研究課題/領域番号 |
15K06940
|
研究機関 | 千葉県立中央博物館 |
研究代表者 |
倉西 良一 千葉県立中央博物館, その他部局等, 研究員 (10250143)
|
研究分担者 |
栗田 隆気 千葉県立中央博物館, その他部局等, 研究員 (00738841)
|
研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
|
キーワード | 保全遺伝学 / マイクロサテライト / 核DNA / 絶滅危惧種 |
研究実績の概要 |
1)個体を損傷させない非殺傷型DNA抽出法の開発。非殺傷型DNA抽出法は脱皮殻に付着する組織よる全遺伝子抽出法であり、理論的には個体への損傷が全く起こらないため絶滅危惧昆虫の遺伝子解析においては最も必要とされる研究手法である。従来の実験手法では脱皮殻に付着する組織が少なく(DNAの収量が少ないため)体表に不着したと考えられるツリガネムシなどの他の生物の遺伝子の混入が検出され開発が難航した。しかし緩衝液による洗浄と幼虫の飼育環境の改善を並行することにより実現可能な水準まで到達した。 2)集団遺伝構造を明らかにするために、(個体間の関係を特定するのに有効な)核DNA遺伝子マーカー(マイクロサテライトマーカー)を開発した。平成27年度に許可を得て採捕した終令幼虫より全遺伝子を抽出し、ギガシークエンサーを使って約100万から180万の塩基配列を読み込んだ。この塩基配列を解析し136対のマイクロサテライトマーカー候補領域を選定、分子生物学的実験解析の結果27対のマイクロサテライトマーカーを開発に成功した。今回新たに開発できたマイクロサテライトマーカーは地域の個体群内の遺伝的多様性の把握や地域個体群の連続性や独自性の解析に極めて重要なものである。 3)平野の止水域に生息する絶滅危惧種ミサキツノトビケラの生息状況を調査しその形態を幼虫・蛹・成虫を記載した。 4)オオナガレトビケラについて生息域全域からサンプルを収集し形態・遺伝子の解析をすすめた。従来日本産は1種とされていたが複数の種が含まれることが明らかとなった。
|
現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
シークエンサーの故障により一部サンプルの解析に遅延が生じたが、おおむね順調に進展しているといえる。
|
今後の研究の推進方策 |
石川県のシャープゲンゴロウモドキ個体群と千葉県のシャープゲンゴロウモドキ個体群をマイクロサテライトマーカーによって集団遺伝学的に比較検討する。継続して地域個体群間の遺伝的接続性と保全単位の解明を分子生物学的方法で行なう。これらの結果を統合し遺伝的多様性を増強・維持しつつ、地域個体群としての遺伝的独自性が失われない系統保存計画の理論的根拠を構築する研究を行う。マイクロサテライトマーカーや集団遺伝解析の結果については平成28年度中の論文化を目指している。 シャープゲンゴロウモドキ以外の絶滅危惧水生昆虫についても遺伝子解析を進める。
|
次年度使用額が生じた理由 |
平成27年度は、室内で行う分子実験に多大な時間が必要で十分な野外調査ができなかった。
|
次年度使用額の使用計画 |
平成28年度は論文のとりまとめと並行して野外における調査も実施し、絶滅危惧種の実体解明を含めて行う。
|