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2016 年度 実施状況報告書

DNAメチル化の下流で発現制御に関与する新規因子群の同定と解析

研究課題

研究課題/領域番号 15K07100
研究機関長岡技術科学大学

研究代表者

西村 泰介  長岡技術科学大学, 工学研究科, 准教授 (10378581)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード遺伝子サイレンシング / DNAメチル化 / シロイヌナズナ
研究実績の概要

今年度は、MOM1の機能欠失変異体の表現型を抑圧する変異体smom (suppressor of mom1) のうち、smom6変異体に特に着目して、その原因遺伝子の同定を目指した。全ゲノム配列の決定と連鎖解析の結果から、核ー細胞質間輸送に関わるSAC3Bタンパク質をコードする遺伝子に変異が見出され、かつSAC3B遺伝子をsmom6変異体に導入したところ表現型が相補された。この結果から、smom6変異体の原因遺伝子がSAC3B遺伝子であることを明らかにした。SAC3Bタンパク質は核膜孔複合体関連因子NUAと相互作用することが知られており、NUAタンパク質は脱SUMO化酵素ESD4と相互作用することにより、脱SUMO化に関与することが報告されている。このことから、MOM1による遺伝子サイレンシングには、核ー細胞質間輸送やSUMO化が関与することが予想された。
また前年度、MOM1に物理的に相互作用する因子として、SUMO E4リガーゼ酵素であるPIAL1とPIAL2タンパク質を同定し、その機能欠失変異体がmom1変異体と同様の表現型を示すことを明らかにしたが、この結果は他グループからも報告された。そこで本年度はMOM1タンパク質とPIAL1, PIAL2タンパク質が遺伝的に同経路で機能するかを明らかにするために、mom1 pial1 pial2三重変異体を作出し、表現型を観察した。その結果、この三重変異体はそれぞれの変異体と同等の表現型を示したため、MOM1タンパク質とPIAL1, PIAL2タンパク質は同経路で作用すると考えられた。さらにPIAL1とPIAL2タンパク質の遺伝子サイレンシングの機能を明らかにするため、PIAL1とPIAL2タンパク質の強制発現シロイヌナズナと細胞内局在を調べるためのGFP融合タンパク質を発現するシロイヌナズナを作出した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

MOM1タンパク質と相互作用し遺伝子サイレンシングに機能する因子としてSUMO E4リガーゼが、一方mom1変異体の抑圧変異の原因遺伝子として、脱SUMO化に関与する因子と相互作用するタンパク質をコードする遺伝子が同定されたことから、MOM1による遺伝子サイレンシング機構には、タンパク質のSUMO化が何らか関与することが強く示唆された。これはこれまでに無い新しい仮説であり、DNAメチル化の関与する遺伝子サイレンシングにおける新しい分子レベルでの制御機構を明らかにするという本研究課題の目的に大きく近づいたと言える。最終年度では、本年度作出した研究試料を活用することで、この仮説の検証を行い、DNAメチル化の下流におけるSUMO化の機能を明らかにすることが期待できる。

今後の研究の推進方策

次年度は、MOM1による遺伝子サイレンシングとSUMO化の関係を明らかにするため、今年度作出したPIAL1,PIAL2強制発現植物やGFP融合タンパク質発現植物の解析を進めるとともに、脱SUMO化酵素の突然変異体を用いて、脱SUMO化とMOM1やDNAメチル化による遺伝子サイレンシングとの機能的な関係を明らかにし、遺伝子サイレンシングにおけるタンパク質SUMO化の新しいモデルを提案する。
またsmom8, 12突然変異体の原因遺伝子も同定し、より多方面からMOM1による遺伝子サイレンシング機構を明らかにすることを目指す。

次年度使用額が生じた理由

本年度は計画通りに研究が進み、ほぼ残額が残らなかった。次年度使用額として計上される12,028円は、いくつかの消耗品が予定より安価に購入できたことなどによる。

次年度使用額の使用計画

予定の計画では購入できなかった分子生物学解析用試薬を購入する。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 学会発表 (2件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] ケンブリッジ大学(英国)

    • 国名
      英国
    • 外国機関名
      ケンブリッジ大学
  • [国際共同研究] VIB vzw(ベルギー)

    • 国名
      ベルギー
    • 外国機関名
      VIB vzw
  • [学会発表] シロイヌナズナ・サイレンシング因子MOM1の機能欠損変異の抑圧変異体smom2,smom6の遺伝解析2016

    • 著者名/発表者名
      湯川裕介, Larissa Broger, 山口勝司, 重信秀治, Jerzy Paszkowski, 西村泰介
    • 学会等名
      第34回日本植物細胞分子生物学会
    • 発表場所
      信州大学繊維学部
    • 年月日
      2016-09-01 – 2016-09-03
  • [学会発表] シロイヌナズナPIAL1,PIAL2タンパク質はDNAメチル化の下流もしくは独立で遺伝子サイレンシングに関与する2016

    • 著者名/発表者名
      野川省吾, 佐藤卓磨, Eveline Van De Slijke, Kris Gevaert, Geert De Jaeger, 山本章子, 武田真, 服部束穂, 西村泰介
    • 学会等名
      第34回日本植物細胞分子生物学会
    • 発表場所
      信州大学繊維学部
    • 年月日
      2016-09-01 – 2016-09-03
  • [図書] エピジェネティクスの生態学―環境に応答して遺伝子を調節するしくみ2017

    • 著者名/発表者名
      西村泰介ほか(種生物学会 編)
    • 総ページ数
      250
    • 出版者
      文一総合出版

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公開日: 2018-01-16  

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