| 研究実績の概要 |
(1) アルカン分解菌の分離と性状解析 [メタゲノム解析] 集積培養を経た軽油添加系について重点的に解析を行った。本培養系はC8からC26のn-アルカンの減少がみられ、特にC16からC19のn-アルカンは継代後大きく減少した。メタ16S rDNA解析の結果、アーキアでは酢酸資化性メタン生成アーキアであるMethanosaeta属が優占し、バクテリアではSmithella属が優占していた。継代後は継代前と比べてMethanosaeta属、Smithella属の割合が増加した。メタゲノム解析の結果、継代前では2種類のSmithella属菌に由来する配列が得られた。継代後では、継代前の片方と同じOtuであるSmithella属菌の配列が得られ、1種類のSmithella属菌の優占が示唆された。また、それぞれの配列からアルキルスクシネート合成酵素（ass）遺伝子群を含むオペロンが得られた。AssAの系統解析の結果、継代を通じて優占していたSmithella属菌由来AssAは近縁であり、継代後で消失した Smithella属菌由来AssAとは異なった。軽油組成の経時変化を考慮すると、2種類のSmithella属菌は基質とするn-アルカンの炭素数が異なり、基質の減少に伴って片方のSmithlla属菌が減り、1種類のSmithella属菌が優占したと考えられる。
(2) 無酸素環境下における炭化水素分解菌群の多様性解析 硫酸塩還元トルエン分解細菌（TSK株）のゲノム解析を行った。分離されたTSK株のゲノム解析により、Contig 数154，最大Contig長295,967 bp，全長4,878,231 bpでcds数は4453と予想された。ゲノム解析完全性のベンチマーク解析ソフト（BUSCO）で100%近いコア遺伝子が検出された。
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