| 研究課題/領域番号 |
15K07187
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| 研究機関 | 香川大学 |
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研究代表者 |
竹崎 直子 香川大学, 学内共同利用施設等, 教授 (30398036)
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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| キーワード | phylogenomics / coelacanth / lungfish / tetrapod |
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| 研究実績の概要 |
本年度は、シーラカンス、肺魚のどちらが四足動物に近縁であるか知るために３種類の多数遺伝子データを解析した。シーラカンス、肺魚、四足動物の系統関係は化石データからもまだ確立されたわけではなく、詳細な解析が必要である。２つのデータセットはすでに発表された論文(Amemiya et al. 2013 [22 species, 251 genes]; Liang et al. 2013 [10 species, 1,290 genes])から、１つは本研究の共同研究者によって作成されたもの(26 species, 831 genes)である。この解析により、肺魚がシーラカンスよりも四足動物に近いことが支持された。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
解析により、全てのデータセットにおいて、外群としてcartilaginous fish を用いると肺魚が四足動物に近縁である系統樹が支持され、ray-finned fishを用いるとシーラカンスが四足動物に近縁である系統樹が支持された。系統分類では、ray-finned fishがcartilaginous fishよりも四足動物、シーラカンス、肺魚に近縁であることが確立されているが、近年の研究では肺魚が四足動物に近いとする説が有力である。四足動物、シーラカンス、肺魚の系統関係を知るために、なぜ外群によって異なる系統関係が支持されるのかを調べた。最も大きく影響しているのは、ray-finned fishの配列データの分化の程度がcartilaginous fishよりも高いことであることがわかった。この結論を得るために系統関係推定法や数学的モデルを考慮したり、データから推定されたbranch lengthを用いたcomputer simulationを行ったり、様々な試みをしなければならなかったので、当初の計画よりも時間がかかった。
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| 今後の研究の推進方策 |
これまでの解析で用いたデータセット中のray-finned fishは全てteleost というグループに属している。teleostの共通の祖先ではwhole genome duplicationが起こった可能性が高く、このことによりteleostの進化速度が速くなっていると言われている。Ray-finned fishでもteleost ではないgarなどのデータが最近発表されており、試行的研究において、これらgarなどのデータの進化速度はteleostよりも遅いことがわかっている。したがって、garなどを外群として用いて、四足動物、シーラカンス、肺魚の系統関係の推定を行い、シーラカンスよりも肺魚が四足動物に近いことをより確かに示してしていく予定である。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
本年度受領額と支出額の差は１９８円であり、実質的にはゼロである。
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| 次年度使用額の使用計画 |
上記の通り、本年度受領額と支出額の差は１９８円であり、実質的にはゼロである。
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