| 研究課題/領域番号 |
15K07203
|
|---|
| 研究機関 | 国立研究開発法人森林研究・整備機構 |
|---|
研究代表者 |
山本 節子 (鈴木節子) 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (70456622)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2021-03-31
|
| キーワード | 小笠原諸島 / 固有種 / 種分化 / エコタイプ |
|---|
| 研究実績の概要 |
自然集団におけるエコタイプ間でどの程度の花粉流動があるのかを定量化するために、自然条件下で受粉した種子の交雑率を調べた。５サイト、サイト当たり１１－１８母樹（合計７４母樹）、約１３００という十分な数の実生が得られた。これらの実生からDNAを抽出し、オオバシマムラサキで開発されたマイクロサテライトマーカー１６座を用いて遺伝実験を行い、遺伝子型の決定を行った。しかし、種子親とされる個体と種子の遺伝子を比較したところ、約２割の種子で親との遺伝子型の不一致が生じており、採取時あるいは播種時にコンタミネーションが生じてしまったものと考えらえる。次年度はコンタミネーションの可能性が低い残りの種子のデータを用いて自然交配種子の交雑率を推定するための解析を進めたい。
開花期のずれが湿性環境と乾性環境といった栽培条件によってずれが生じるかどうかを栽培実験によって検証した。湿性・乾性タイプ各９６苗を湿性・乾性条件の２つの条件に分けて栽培実験を行った。その結果、３年間の追跡では栽培条件によって開花期のずれは確認できなかった。
本年度はオオバシマムラサキに生じている種分化の遺伝的基盤を明らかにするためにドラフトゲノムの取得を行った。母島石門エリアから採取した挿し木苗１個体から抽出したDNAをPacBio Sequel、4SMRT Cellを用い、塩基配列データ37.1Gbを取得することができた。これはオオバシマムラサキのゲノムサイズ800Mbの約46倍に相当し、十分なデータが得られた。
|
| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
今年度は7月から産前産後休暇に入り、年度いっぱい育児休業を取得したため、予定していた一部の解析を完了させることができなかった。一方、ドラフトゲノムの取得は無事に終了させることができた。
|
| 今後の研究の推進方策 |
自然交配種子の解析を行い、自然集団におけるエコタイプ間で花粉流動の程度を明らかにする。オオバシマムラサキのドラフトゲノムのアセンブルを行う。
|
| 次年度使用額が生じた理由 |
（理由）年度途中で産前産後休暇、育児休業に入ることになり、予定していた実験を完了することができなかったため。
（使用計画）追加の実験を行うための試薬を購入する。
|
