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long noncoding RNA (lncRNA)は、急速な解析技術の進展の中でその機能の重要性が明らかになってきた歴史の浅い分子種である。本研究ではイネを対象として、イネの生産性にとって重要な、胚乳の発生と環境に応答する際に生じるlncRNAを網羅的に探索した。胚乳の初期発生と環境応答時には、それぞれ様々な種類のlncRNAが転写されること、それぞれの組織、応答によって生成されるlncRNAの組成は異なることを明らかにした。また、DNA脱メチル化酵素の変異体を用いて、そのエピジェネティックな制御の関わりを解析することを試みた。
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