研究課題/領域番号 |
15K07301
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研究機関 | 明治大学 |
研究代表者 |
半田 高 明治大学, 農学部, 教授 (00192708)
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研究分担者 |
山岸 真澄 北海道大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (40210348)
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研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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キーワード | ユリ / 遺伝的多様性 / 色素合成遺伝子 / 転写調節因子 |
研究実績の概要 |
ユリ属Archelirion節のこれまで未調査であったササユリ、オトメユリ、カノコユリについて自生地での形態調査とDNA分析試料の採取を行い、一部については各種多変量解析手法を用いた統計解析とSSR分析を行った。その結果、各種の各地域における多様性と種間の遺伝的関係性について一部が明らかとなった。 白地の花弁の中央にアントシアニン色素による赤いラインが入るオリエンタルハイブリッドユリ品種ディジーをもちいて、どのようなメカニズムが働いてこのような模様ができるのか明らかにする目的で、花弁の赤い部分と白い部分で全転写産物(transcriptome)を比較した。次世代シークエンスとde novo assemblyを用いてcontigのライブラリーを構築し、その上で赤い部分と白い部分で発現量に差のあるcontig(DEGs)を検出したところ、1290がDEGsとして検出された(FDR <5%)。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
起源種の多少性解析に関しては、2017年度に予定していた4種のうち3種について調査と解析を進めることができた。また、ジセダイシークエンス情報を用いることで、栽培化に関わる遺伝子のうち、花の色模様に関係する色素合成の転写調節因子の候補を明らかにすることができた。
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今後の研究の推進方策 |
起源種の遺伝的多様性に関しては、引き続き自生地での調査とDNA分析試料の採取を進める。また、オリエンタルハイブリッドの主な園芸品種についても調査を進め、野生集団と園芸品種との遺伝的類縁関係を明らかにする。 また、栽培化に関わる遺伝子の探索では、次世代シークエンス情報から得られた候補遺伝子について、品種ディジーをもちいた模様の解析により、得られたDEGsを詳細に解析し、模様ができるメカニズムの解明を目指す。
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次年度使用額が生じた理由 |
2016度前期に調査および材料採取での旅費、ならびに実験に使用する試薬や消耗品の購入に使用するため。
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次年度使用額の使用計画 |
2016年度5月から7月に実験材料の開花期に合わせて、旅費を使用して調査と材料採取を行う予定である。また、2016年度当初よりDNA分析に使用する試薬や消耗品を購入予定である。
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