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2015 年度 実施状況報告書

危機的状況にあるリュウキュウアユの存続に向けたメタ個体群構造の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K07538
研究機関総合地球環境学研究所

研究代表者

武島 弘彦  総合地球環境学研究所, 研究高度化支援センター, 特任助教 (50573086)

研究分担者 安房田 智司  新潟大学, 自然科学系, 助教 (60569002)
井口 恵一朗  長崎大学, 環境科学部, 教授 (00371865)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード生物多様性 / 絶滅危惧種 / リュウキュウアユ / DNA分析 / メタ個体群 / 保全
研究実績の概要

喪失と変質が深刻化している淡水生態系において,絶滅危惧種「リュウキュウアユ」は,その自然集団を奄美大島に残すのみとなった.本研究は,リュウキュウアユの最大個体数を有する東部住用湾集団について,具体的な保全策・存続手法の提案に向けて,(1)生態調査と(2)遺伝分析を行い,メタ個体群構造の実態解明を目的としている.
初年度である本年度は,(1)に関しては,奄美大島東部の住用湾以外の地域も含む合計10の河川について,生息河川調査,個体数調査,ならびに,なわばり形成個体の状況を調べる社会構造調査を年間1回実施し,データを取得した.さらに,西部の合計18河川についても同様の調査を実施し,データを取得することができた.
(2)に関しては,25マーカーという大規模なマイクロサテライトDNA分析システムを確立した.先行的に1992年から2008年に採集されたリュウキュウアユ781個体について,構築した大規模マーカー分析を適用したところ,奄美大島東部において,遺伝的差異の程度は小さいものの,統計的に支持される3つのグループが,初めて検出された.また,遺伝分析のための,より非侵襲的サンプリングを目指して,予定していた孵化仔魚のサンプリングにかえて,個体の糞便からのDNA抽出ならびにマイクロサテライトDNA分析を試みたところ,良好な結果が得られた.そこで今年度は,奄美大島東部の5河川,西部の2河川,合計7河川から185個体の糞便サンプルを採集した.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究では,(1)生態調査と(2)遺伝分析の実施により研究を進める上で,まず(1)に関して,研究の基礎となる生息河川と個体数の調査を,これまでにない規模で実施した.この結果により,本格的な河川環境調査のための,ターゲット河川の再調整を行うことができた.
(2)の遺伝分析に関しては,まず,25マーカーの大規模マイクロサテライトDNA分析のシステムを確立することができた.さらに12マーカーを分析に加える予備実験に成功しており,計画通り30マーカーを超える大規模分析系が構築されつつある.また,先行して行われた,既存サンプルのDNA分析により,奄美大島東部の3つのグループが明らかとなり,今年度採集した糞便サンプルとの比較検討が可能となった.非侵襲的サンプリングの達成のために試みた,個体の糞便からのDNA抽出ならびにマイクロサテライトDNA分析に成功し,今年度採集した糞便サンプルについて分析の準備が整った.

今後の研究の推進方策

次年度も,分担研究者間の協力連携のもと,今年度実施しなかった河川環境の調査を実施する.河川調査では,今年度明らかになった奄美大島東部の3つの遺伝的なグループを中心として,より多くの河川で糞便サンプルの採集を試みる.遺伝分析については,大規模マイクロサテライトDNA分析システムの基盤が構築できたので,新規採集サンプルの分析を速やかに実施していく.得られた生態・遺伝データに基づいて,有効集団サイズ等のメタ個体群構造推定のための予備的解析を実施する.

次年度使用額が生じた理由

本格的な河川環境の調査を実施しなかったために,旅費に次年度使用額が生じた.

次年度使用額の使用計画

本年度実施しなかった,本格的な河川環境の調査を,次年度は実施する.

  • 研究成果

    (19件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Genetic and morphological differences among the three species of the genus Rastrelliger (Perciformes: Scombridae).2016

    • 著者名/発表者名
      Nozomu Muto, Ulysses B. Alama, Harutaka Hata, Armi May T. Guzman, Ramon Cruz, Arnold Gaje, Rex Ferdinand M. Traifalgar, Ryo Kakioka, Hirohiko Takeshima, Hiroyuki Motomura, Fumihito Muto, Ricardo P. Babaran, Satoshi Ishikawa
    • 雑誌名

      Ichthyological Research

      巻: 63 ページ: 275-287

    • DOI

      10.1007/s10228-015-0498-z

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Mitogenome Sequencing Alleviates Random Rooting Effect in Phylogeography.2016

    • 著者名/発表者名
      Shotaro Hirase, Hirohiko Takeshima, Mutsumi Nishida, Wataru Iwasaki
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1093/gbe/evw063

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Using dense locality sampling resolves the subtle genetic population structure of the dispersive fish species Plecoglossus altivelis.2016

    • 著者名/発表者名
      Hirohiko Takeshima, Kei'ichiro Iguchi, Yasuyuki Hashiguchi, Mutsumi Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1111/mec.13650

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genetic similarity of the Hainan medaka populations collected from hyper- and hypoosmotic environments in northern Vietnam.2015

    • 著者名/発表者名
      Hideki Hayakawa, Quang Dung Le, Masato Kinoshita, Yusuke Takehana, Kei Sakuma, Hirohiko Takeshima, Shigeaki Kojima, Kiyoshi Naruse, Koji Inoue
    • 雑誌名

      Ocean Science Journal

      巻: 50 ページ: 231-235

    • DOI

      10.1007/s12601-015-0020-6

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Severely depleted genetic diversity and population structure of a large predatory marine fish (Lates japonicus) endemic to Japan.2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Takahashi, Naohiko Takeshita, Hideaki Tanoue, Shusaku Ueda, Hirohiko Takeshima, Teruhisa Komatsu, Izumi Kinoshita, Mutsumi Nishida
    • 雑誌名

      Conservation Genetics

      巻: 16 ページ: 1155-1165

    • DOI

      10.1007/s10592-015-0729-x

    • 査読あり
  • [学会発表] 回遊性ハゼ科魚類の淡水進出に伴う平行的種分化: 近似ベイズ法を用いた検証2016

    • 著者名/発表者名
      山﨑 曜,武島弘彦,鹿野雄一,大迫尚晴,鈴木 寿之,西田 睦,渡辺勝敏
    • 学会等名
      第63回日本生態学会大会
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2016-03-22
  • [学会発表] 奄美大島役勝川の栄養供給源はどこにあるのか2016

    • 著者名/発表者名
      阿部信一郎・棗田孝晴・黒田暁・井口恵一朗
    • 学会等名
      日本藻類学会第40回大会
    • 発表場所
      日本歯科大学生命歯学部(東京都千代田区)
    • 年月日
      2016-03-20
  • [学会発表] 絶滅危惧種リュウキュウアユの遺伝的個体群構造解析ーメタ個体群構造の解明に向けてー2016

    • 著者名/発表者名
      小黒環
    • 学会等名
      第2回新潟大学佐渡3施設による森里海公開シンポジウム,学生研究発表会
    • 発表場所
      佐渡市トキ交流会館(新潟県佐渡市)
    • 年月日
      2016-02-20
  • [学会発表] アユの初期生残にとって不都合な環境条件とは?2016

    • 著者名/発表者名
      井口恵一朗
    • 学会等名
      平成27年度全国湖沼河川養殖研究会アユ資源研究部会報告会
    • 発表場所
      東京都島しょ農林水産総合センター(東京都港区)
    • 年月日
      2016-02-02
    • 招待講演
  • [学会発表] アユ地域個体群における形態形質の個体感変異2016

    • 著者名/発表者名
      星野大翼・井口恵一朗
    • 学会等名
      長崎県生物学会第45回大会
    • 発表場所
      佐世保市コミュニティセンター(長崎県佐世保市)
    • 年月日
      2016-01-10
  • [学会発表] 長崎県産アユの遺伝的個体群構造に関する研究2016

    • 著者名/発表者名
      佐古田雅哉・井口恵一朗
    • 学会等名
      長崎県生物学会第45回大会
    • 発表場所
      佐世保市コミュニティセンター(長崎県佐世保市)
    • 年月日
      2016-01-10
  • [学会発表] 有性・無性の生殖サイクルを介した稀な遺伝子流動が促進するフナ類の多様化2015

    • 著者名/発表者名
      三品 達平・武島 弘彦・高田 未来美・井口 恵一朗 ・田畑 諒一・西田 睦・渡辺 勝敏
    • 学会等名
      第48回日本魚類学会年会
    • 発表場所
      近畿大学奈良キャンパス(奈良県奈良市)
    • 年月日
      2015-09-06
  • [学会発表] 琵琶湖水系における底生魚カマツカの形態的多様性と遺伝的集団構造2015

    • 著者名/発表者名
      遠藤 千晴・富永 浩史・三品 達平・山﨑 曜・ 武島 弘彦・渡辺 勝敏
    • 学会等名
      第48回日本魚類学会年会
    • 発表場所
      近畿大学奈良キャンパス(奈良県奈良市)
    • 年月日
      2015-09-06
  • [学会発表] グルクマ属魚類3 種の遺伝的・形態的差異2015

    • 著者名/発表者名
      武藤 望生・Ulysses ALAMA・畑 晴陵・武島 弘彦・柿岡 諒・ Arnold GAJE ・Ramon CRUZ ・Armi GUZMAN ・Rex TRAIFALGAR・Ricardo BABARAN・ 本村 浩之・武藤 文人・石川 智士
    • 学会等名
      第48回日本魚類学会年会
    • 発表場所
      近畿大学奈良キャンパス(奈良県奈良市)
    • 年月日
      2015-09-06
  • [学会発表] 次世代シーケンシングによるリュウキュウアユの集団ミトコンドリアゲノミクス2015

    • 著者名/発表者名
      武島 弘彦・佐久間 啓・川原 玲香・米沢 俊彦・ 安房田 智司・井口 恵一朗・西田 睦
    • 学会等名
      第48回日本魚類学会年会
    • 発表場所
      近畿大学奈良キャンパス(奈良県奈良市)
    • 年月日
      2015-09-06
  • [学会発表] 南シナ海におけるメガネタマガシラの遺伝的集団構造2015

    • 著者名/発表者名
      柿岡 諒・武藤 望生・武島 弘彦・Osman MUDA・Sukchai ARNUPAPBOON・Kamolrat PHUTTHARAKSA・Nguyan VAN QUAN・ Arnold GAJE・Ramon CRUZ ・Ulysses ALAMA・Armi GUZMAN・Rex TRAIFALGAR・Ricardo BABARAN ・本村 浩之・武藤 文人・石川 智士
    • 学会等名
      第48回日本魚類学会年会
    • 発表場所
      近畿大学奈良キャンパス(奈良県奈良市)
    • 年月日
      2015-09-06
  • [学会発表] Historical background to the relationship between freshwater fisheries and the great cormorant in Japan.2015

    • 著者名/発表者名
      Kei'ichiro Iguchi
    • 学会等名
      Vth International Wildlife Management Congress
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2015-07-27
    • 国際学会
  • [学会発表] 脊椎動物における頻繁な倍数性の進化―フナ属魚類における倍数性多型の起源2015

    • 著者名/発表者名
      三品 達平, 武島 弘彦, 高田 未来美, 井口 恵一朗, 田畑 諒一, 西田 睦, 渡辺 勝敏
    • 学会等名
      NGS現場の会第四回研究会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2015-07-02
  • [図書] 生物の多様性. 「水産海洋ハンドブック」第3版,竹内俊郎, 中田英昭, 和田時夫, 上田宏, 有元貴文, 渡部終五, 中前明, 橋本牧 編2016

    • 著者名/発表者名
      井口恵一朗
    • 総ページ数
      662
    • 出版者
      生物研究社

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公開日: 2017-01-06  

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