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2017 年度 実績報告書

筋ジストロフィー原因遺伝子産物LARGEによる糖鎖の伸長機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K07935
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

矢木 宏和  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 講師 (70565423)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワードLARGE / K4CP / 糖鎖伸長 / 高速AFM
研究実績の概要

本研究は、2つの糖転移ドメインを有する糖転移酵素(LARGEおよびK4CP)の糖鎖伸長機構の解明を目指すものである。昨年度までに、超分子質量分析(nMS)およびX線小角散乱(SAXS)を利用した解析により、K4CPは溶液中では2量体を形成していることが予想された。本年度は、K4CPの会合状態の濃度依存性を超遠心分析を利用して調べたところ、nMSやSAXSの測定濃度領域である0.2mg/mL以上の濃度では2量体として存在しているが、0.05mg/mLの領域では単量体として存在していた。単量体として存在していた濃度は、高速AFMによってK4CPに由来する2輝点が近接している像が観測された濃度であり、1つの輝点が1つのドメインであることが明らかになった。このような濃度依存的な2量体形成の傾向は筋ジストロフィーの原因遺伝子産物であるLARGEにも認められ、高速AFMによる観測においても、2つの輝点が揺動している様子を捉えることができた。さらに基質を加えることで、時間の経過とともに糖鎖が伸延する様子が確認され、LARGEによる糖鎖合成の過程を捉えることができた。
また、全反射蛍光顕微鏡による1分子蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)の計測を行うことで、K4CPの糖鎖伸長過程を捉えることを試みた。その結果、高濃度のK4CP-Alexa647をガラス基板へ吸着させ、糖基質CH4-Cy3を結合させる条件でFRETを検出することに成功した。さらに、K4CP-Alexa647に糖基質CH4-Cy3を加え、UDP-GalNacとUDP-GlcAを加えると、段階的にFRET効率が減少する分子が捉えられた。これは、K4CP-Alexa647へCH4-Cy3が結合しFRETを起こし、糖鎖が伸長することで、K4CP-Alexa647とCH4-Cy3が離れ、FRET効率が下がったものと考えられる。
以上より、2つの糖転移ドメインを有する糖転移酵素は、各ドメインの配向を柔軟に変化させることにより、ドメイン間で基質糖鎖を受け渡し、糖鎖のリピート構造の伸長を効率的に行っているものと考えられる。

  • 研究成果

    (23件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 3件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 2件、 招待講演 6件)

  • [国際共同研究] Academia Sinica(台湾)

    • 国名
      その他の国・地域
    • 外国機関名
      Academia Sinica
  • [国際共同研究] UMRS1138, University; Paris Descartes,/Institut Laue-Langevin(フランス)

    • 国名
      フランス
    • 外国機関名
      UMRS1138, University; Paris Descartes,/Institut Laue-Langevin
  • [雑誌論文] Site-specific N-glycosylation analysis of soluble Fcγ receptor IIIb in human serum2018

    • 著者名/発表者名
      Yagi, H., Takakura, D., Roumenina, L.T., Fridman, W.H., Sautes-Fridman, C., Kawasaki, N., Kato, K.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8(1) ページ: art. no. 2719

    • DOI

      10.1038/s41598-018-21145-y

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Lewis X-Carrying Neoglycolipids Evoke Selective Apoptosis in Neural Stem Cells2018

    • 著者名/発表者名
      Yagi, H., Yan, G., Suzuki, T., Tsuge, S., Yamaguchi, T., Kato, K.
    • 雑誌名

      Neurochemical Research

      巻: 43(1) ページ: 212-218

    • DOI

      10.1007/s11064-017-2415-5

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stable isotope labeling approaches for NMR characterization of glycoproteins using eukaryotic expression systems2018

    • 著者名/発表者名
      Yanaka, S., Yagi, H., Yogo, R., Yagi-Utsumi, M., Kato, K.
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR

      巻: --- ページ: 1-10

    • DOI

      10.1007/s10858-018-0169-2

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 3D structural analysis of protein O-mannosyl kinase, POMK, a causative gene product of dystroglycanopathy2017

    • 著者名/発表者名
      Nagae, M., Mishra, S.K., Neyazaki, M., Oi, R., Ikeda, A., Matsugaki, N., Akashi, S., Manya, H., Mizuno, M., Yagi, H., Kato, K., Senda, T., Endo, T., Nogi, T., Yamaguchi, Y.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 22(4) ページ: 348-359

    • DOI

      10.1111/gtc.12480

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Alteration of a recombinant protein N-glycan structure in silkworms by partial suppression of N-acetylglucosaminidase gene expression2017

    • 著者名/発表者名
      Kato, T., Kikuta, K., Kanematsu, A., Kondo, S., Yagi, H., Kato, K., Park, E.Y.
    • 雑誌名

      Biotechnology Letters

      巻: 39(9) ページ: 1299-1308

    • DOI

      10.1007/s10529-017-2361-y

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] NMR detection of semi-specific antibody interactions in serum environments2017

    • 著者名/発表者名
      Yanaka, S., Yamazaki, T., Yogo, R., Noda, M., Uchiyama, S., Yagi, H., Kato, K.
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 22(10) ページ: art. no. 1619

    • DOI

      10.3390/molecules22101619

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Technical basis for nuclear magnetic resonance approach for glycoproteins2017

    • 著者名/発表者名
      Kato, K., Yanaka, S., Yagi, H.
    • 雑誌名

      Experimental Approaches of NMR Spectroscopy: Methodology and Application to Life Science and Materials Science

      巻: --- ページ: 415-438

    • DOI

      10.1007/978-981-10-5966-7_15

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of conformational deformation-coupled interaction between immunoglobulin G1 Fc glycoprotein and a low-affinity Fcγ receptor by deuteration-assisted small-angle neutron scattering2017

    • 著者名/発表者名
      Yogo, R., Yanaka, S., Yagi, H., Martel, A., Porcar, L., Ueki, Y., Inoue, R., Sato, N., Sugiyama, M., Kato, K.
    • 雑誌名

      Biochemistry and Biophysics Reports

      巻: 12 ページ: 1-4

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2017.08.004

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Conformational effects of N-glycan core fucosylation of immunoglobulin G Fc region on its interaction with Fcγ receptor IIIa2017

    • 著者名/発表者名
      Sakae, Y., Satoh, T., Yagi, H., Yanaka, S., Yamaguchi, T., Isoda, Y., Iida, S., Okamoto, Y., Kato, K.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7(1) ページ: art. no. 13780

    • DOI

      10.1038/s41598-017-13845-8

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] タンパク質における糖鎖修飾の生物学的機能と高次構造への影響2017

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和
    • 学会等名
      第1回名古屋市立大学若手イブニングセミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] 糖タンパク質における糖鎖の生物機能と高次構造への影響2017

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和
    • 学会等名
      第58回 日本生化学会中国四国支部例会
    • 招待講演
  • [学会発表] FUT9によるキャリアタンパク質特異的なフコース修飾機構の解明2017

    • 著者名/発表者名
      齋藤泰輝,矢木宏和,柘植信吾,Chuwei Kuo,Kay-Hooi Khoo,加藤晃一
    • 学会等名
      第81回 日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
  • [学会発表] フコース転移酵素によるキャリアタンパク質特異的なLewisX修飾機構2017

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和,齋藤泰輝,姫田美咲,柘植信吾,加藤晃一
    • 学会等名
      第69回日本細胞生物学会大会
  • [学会発表] 糖タンパク質糖鎖の機能解明のための構造解析技術の開発と応用2017

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和
    • 学会等名
      第1回触発型有機化学研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] The characterization of the laminin-binding glycans on alpha-dystroglycan catalyzed by several causative gene products of dystroglycanopathy2017

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Yagi
    • 学会等名
      The 1st International Conference on the Glycobiology of Nervous System
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Mechanisms underlying the carrier protein-specific lewis X modification catalyzed by fucosyltransferase IX2017

    • 著者名/発表者名
      Taiki Saito, Hirokazu Yagi, Shingo Tsuge, Chuwei Kuo, Kay-Hooi Khoo, and Koichi Kato
    • 学会等名
      The 1st International Conference on the Glycobiology of Nervous System
    • 国際学会
  • [学会発表] 糖タンパク質糖鎖の構造解析法の開発と糖鎖機能解析への応用2017

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和
    • 学会等名
      第2回G-CHAINセミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] 糖タンパク質糖鎖の機能解明のための構造生物学的アプローチ法の開発と応用2017

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和
    • 学会等名
      第26回 日本バイオイメージング学会学術集会
    • 招待講演
  • [学会発表] α-ジストログリカンに発現するホスホジエステル結合を有する糖鎖の構造機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      尾林卓幸,矢木宏和,Chu-Wei Kuo,蜷川 暁,Kay-Hooi Khoo,加藤晃一
    • 学会等名
      第14回「若手の力フォーラム」
  • [学会発表] フコース転移酵素9によるキャリアタンパク質特異的なフコース修飾機構の解明2017

    • 著者名/発表者名
      齋藤泰輝,矢木宏和,Chu-Wei Kuo,Kay-Hooi Khoo,加藤晃一
    • 学会等名
      第14回「若手の力フォーラム」
  • [学会発表] フコース転移酵素のキャリアタンパク質に対する特異的なLewisX修飾機構2017

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和,齋藤泰輝,姫田美咲,柘植信吾,加藤晃一
    • 学会等名
      2017年度 生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)

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公開日: 2018-12-17   更新日: 2022-08-18  

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