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2017 年度 実績報告書

計算解剖学および遺伝学的手法を用いた妊娠初期ヒト胎児における新しい診断基準の確立

研究課題

研究課題/領域番号 15K08134
研究機関京都大学

研究代表者

山田 重人  京都大学, 医学研究科, 教授 (80432384)

研究分担者 田村 寛  京都大学, 国際高等教育院, 特定教授 (40418760)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード発生学 / 解剖学 / 計算解剖学
研究実績の概要

本研究は、Kyoto Collectionを用いて、世界最高の高解像度で三次元イメージングを行い、得られた画像所見を計算解剖学的手法により数値として表現することで、妊娠初期胎児形態の定量的基準を作成する。また、異常例の標本から遺伝学的データを抽出し画像所見と比較することにより、形態学的診断を遺伝学的に裏付け、臨床的に有用な診断基準を確立しようとするものである。
【高解像度高速胚撮像法の確立】位相CTを利用した画像撮像を引き続き行った。192時間のマシンタイムを得て、ヒト胚子の撮像を行ったが、マシントラブルの影響もあり、データが解析に耐えるかどうかについては検討を要する状態である。
【計算解剖学的解析による先天異常診断】既存のMR画像データベースを用いての解析を試みている。幾何学的形態測定学(Geometric Morphometrics, GM)による画像解析を導入し、ヒト形態形成の動的変化の定量的な解明を試みた。画像処理および機械学習による抽出の結果、外表面上においてマニュアルによる抽出と遜色のない三次元可視化モデルを作成することができた。PCAの結果、PC1、PC2およびPC3がそれぞれ69.9%、6.56%、6.11%を示した。PC1は脳の前後方向の成分であり、これにより脳の形態変化は、前後方向、特に終脳の後方部分の拡大が最も著しいことが示された。
【古標本からの核酸抽出法の開発】外表異常の認められないコントロール胎児20例を選出し、前年度までに確立した抽出プロトコールに基づき、DNA抽出を行った。対象標本は30ー50年以上もの長期間ホルマリン液に浸漬されていたため、短時間(数時間ーovernight)の固定液内浸漬後にパラフィンに包埋されたFFPEサンプルよりもさらにDNA変性が進行したためにシークエンス解析を実施できるレベルの抽出DNAは得ることが困難であった。

  • 研究成果

    (43件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 11件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (28件) (うち国際学会 3件、 招待講演 4件) 図書 (3件)

  • [国際共同研究] National Human Genome Research Institute(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      National Human Genome Research Institute
  • [雑誌論文] Fortieth Anniversary of the Congenital Anomaly Research Center, Kyoto University Graduate School of Medicine.Fortieth Anniversary of the Congenital Anomaly Research Center, Kyoto University Graduate School of Medicine.2018

    • 著者名/発表者名
      Yamada S, Nagai M, Hagiwara M
    • 雑誌名

      Anat Rec

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1002/ar.23786

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel Imaging Modalities for Human Embryology and Applications in Education.2018

    • 著者名/発表者名
      Yamada S, Nakano S, Makishima H, Motoki T
    • 雑誌名

      Anat Rec

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1002/ar.23785

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical and Demographic Evaluation of a Holoprosencephaly Cohort from the Kyoto Collection of Human Embryos2018

    • 著者名/発表者名
      Abe Y, Kruszka P, Martinez A, Shiota K, Yamada S, Muenke M
    • 雑誌名

      Anat Rec

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1002/ar.23791

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本における出生前遺伝学的検査の動向 1998-20162018

    • 著者名/発表者名
      佐々木愛子,左合治彦,吉橋博史,山田重人,三宅秀彦,鈴森伸宏,高田史男,増崎英明,平原史樹,久具宏司,小西郁生
    • 雑誌名

      日本周産期・新生児医学会誌

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 超音波検査による胎児甲状腺機能評価を行った胎児甲状腺腫の5例2018

    • 著者名/発表者名
      菅 智美,伊尾紳吾,千草義継,谷洋彦,杉並興,濵西潤三,山田重人,松村謙臣,近藤英治
    • 雑誌名

      日本周産期・新生児医学会誌

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tail reduction process during human embryonic development2018

    • 著者名/発表者名
      Tojima Sayaka、Makishima Haruyuki、Takakuwa Tetsuya、Yamada Shigehito
    • 雑誌名

      Journal of Anatomy

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1111/joa.12774

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Number of synergies is dependent on spasticity and gait kinetics in children with cerebral palsy.2018

    • 著者名/発表者名
      Hashiguchi Y, Ohata K, Osako S, Kitatani R, Aga Y, Masaki M, Yamada S
    • 雑誌名

      Pediatr Phys Ther

      巻: 30(1) ページ: 34-38

    • DOI

      10.1097/PEP.0000000000000460

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Three-dimensional models of the segmented human fetal brain generated by magnetic resonance imaging2017

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Yutaka、Miyazaki Reina、Kamatani Mikako、Uwabe Chigako、Makishima Haruyuki、Nagai Momoko、Katsube Motoki、Yamamoto Akira、Imai Hirohiko、Kose Katsumi、Togashi Kaori、Yamada Shigehito
    • 雑誌名

      Congenital Anomalies (Kyoto)

      巻: 58 ページ: 48~55

    • DOI

      10.1111/cga.12229

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Spatiotemporal Statistical Model for Eyeballs of Human Embryos2017

    • 著者名/発表者名
      KISHIMOTO Masashi、SAITO Atsushi、TAKAKUWA Tetsuya、YAMADA Shigehito、MATSUZOE Hiroshi、HONTANI Hidekata、SHIMIZU Akinobu
    • 雑誌名

      IEICE Transactions on Information and Systems

      巻: E100.D ページ: 1505~1515

    • DOI

      10.1587/transinf.2016EDP7493

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitation of nasal development in the early prenatal period using geometric morphometrics and MRI: a new insight into the critical period of Binder phenotype2017

    • 著者名/発表者名
      Katsube Motoki、Yamada Shigehito、Miyazaki Reina、Yamaguchi Yutaka、Makishima Haruyuki、Takakuwa Tetsuya、Yamamoto Akira、Fujii Yosuke、Morimoto Naoki、Ito Tsuyoshi、Imai Hirohiko、Suzuki Shigehiko
    • 雑誌名

      Prenatal Diagnosis

      巻: 37 ページ: 907~915

    • DOI

      10.1002/pd.5106

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 遺伝カウンセリングにおける一般診療と専門診療の機能区分の設定2017

    • 著者名/発表者名
      三宅秀彦,村上裕美,鳥嶋雅子,稲葉慧,松川愛未,高嶺恵理子,米井歩,浦尾充子,山田重人,小杉眞司.
    • 雑誌名

      日本遺伝カウンセリング学会誌

      巻: 38(1) ページ: 43、108

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0173852

    • 査読あり
  • [学会発表] 産婦人科と遺伝医療2018

    • 著者名/発表者名
      山田重人
    • 学会等名
      第17回東海不妊内分泌研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト胚子・胎児中枢神経系の半自動セグメンテーションによる三次元立体像の作成2018

    • 著者名/発表者名
      山口豊、宮崎伶菜、上部千賀子、巻島美幸、勝部元紀、山本憲、今井宏彦、米山明男、巨瀬勝美、冨樫かおり、山田重人
    • 学会等名
      第123回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • [学会発表] ワークショップ2 胎盤の生理と病理 胎盤発生の基礎 ヒト発生学の視点からワークショップ2 胎盤の生理と病理 胎盤発生の基礎;ヒト発生学の視点から2017

    • 著者名/発表者名
      山田重人、伊尾紳吾
    • 学会等名
      第25回胎盤学会学術集会
  • [学会発表] 胎児脳神経系の発生2017

    • 著者名/発表者名
      山田重人
    • 学会等名
      第19回日本イアンドナルド超音波講座
    • 招待講演
  • [学会発表] 産婦人科に必要な臨床遺伝の基礎知識2017

    • 著者名/発表者名
      山田重人
    • 学会等名
      第87回石川石川産科婦人科学会臨床懇話会
    • 招待講演
  • [学会発表] 頭部顔面の発生と先天異常学への展開2017

    • 著者名/発表者名
      山田重人
    • 学会等名
      第27回遺伝医学セミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト胎児における頭蓋顔面骨格の形態変化:Geometric morphometricsによる成長の解析と可視化2017

    • 著者名/発表者名
      勝部 元紀、山田 重人、巻島 美幸、宮崎伶菜、山口 豊、山本 憲、斉藤 篤、清水 昭伸、今井 宏彦、鈴木 茂彦
    • 学会等名
      第35回日本頭蓋学顔面外科学会学術集会
  • [学会発表] Down症候群を持つ人の自己認識と社会的因子の関連2017

    • 著者名/発表者名
      三宅 秀彦、山田 重人、藤井 庸祐、伊尾 紳吾、池田 真理子、浦野 真理、小笹 由香、金井 誠、福島 明宗、松原 洋一、齋藤 加代子、小西 郁生
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第62回大会
  • [学会発表] 京都大学医学部附属病院における乳がん・卵巣がんに関する遺伝カウンセリング状況2017

    • 著者名/発表者名
      本田 明夏、村上 裕美、鳥嶋 雅子、松川 愛未、山田 崇弘、山田 重人、小杉 眞司
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第62回大会
  • [学会発表] ヒト胎児脳の三次元立体化像の作成における機械学習とマニュアル抽出の比較検討(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      山口 豊、宮崎伶菜、上部 千賀子、巻島 美幸、勝部 元紀、山本 憲、今井 宏彦、米山 明男、巨瀬 勝美、冨樫かおり、山田 重人
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] 臨床用MRIを用いたヒト胎児筋骨格系の解析-DTIとT2の比較-(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      宮崎伶菜、山本憲、巻島美幸、岡田知久、富樫かおり、上部千賀子、山田重人
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] 変形のある連続切片よりヒト胚子の良好な三次元像を得る試み(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      巻島美幸、上部千賀子、梶原武紘、舩冨卓哉、久保尋之、向川康博、山田重人
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] ヒト胚発生過程における尾部退縮過程の解明(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      東島沙弥佳、巻島美幸、高桑徹也、山田重人
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] ヒト胚子期後腎における腎盂の三次元的解析とネフロンの成熟段階別の分布(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      石山華、山田重人、巻島美幸、上部千賀子、高桑徹也
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] ヒト胚子期~胎児期初期における大腿骨の形態形成の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      鈴木裕子、山田重人、上部千賀子、米山明男、武田徹、今井宏彦、松田哲也、高桑徹也
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] ヒト胎児期初期の骨盤形成(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      金橋 徹、奥村 美咲、米山 明男、武田 徹、今井 宏彦、松田 哲也、上部千賀子、山田 重人、高桑 徹也
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] ヒト気管支分岐形成の三次元的解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      藤井 瀬菜、村中 太河、松林 潤、米山 明男、武田 徹、兵頭 一行、上部千賀子、巻島 美幸、山田 重人、高桑 徹也
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] 高解像度 MRI・DTI を用いたヒト胎児心筋の走行(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      西谷 早織、山田 重人、上部千賀子、原口 亮、今井 宏彦、松田 哲也、高桑 徹也
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] ヒトにおける胎児期の脳形態形成の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      白石 直樹、山中 美希、岡本 育恵、山田 重人、上部千賀子、今井 宏彦、松田 哲也、高桑 徹也
    • 学会等名
      第57回日本先天異常学会大会
  • [学会発表] Relationship between self-perception and social factors in people with Down syndrome(Poster)2017

    • 著者名/発表者名
      Miyake H, Yamada S, Fujii Y, Taniguchi-Ikeda M, Urano M, Ozasa Y, Kanai M, Fukushima A, Matsubara Y, Saito K, Konishi I.
    • 学会等名
      The 21h International Conference on Prenatal Diagnosis and Therapy
    • 国際学会
  • [学会発表] Trends of genetic prenatal testing in Japan; 1998-2016(Poster)2017

    • 著者名/発表者名
      Sasaki A, Sago H, Yoshihash H, Yamada S, Miyake H, Suzumori N, Takada F, Masuzaki H, Hirahara F, Kugu K, Konishi I.
    • 学会等名
      The 21h International Conference on Prenatal Diagnosis and Therapy
    • 国際学会
  • [学会発表] Tail reduction process during human embryonic development(Poster)2017

    • 著者名/発表者名
      Tojima S, Makishima H, Takakuwa T, Yamada S.
    • 学会等名
      The 18th International Society of Developmental Biology
    • 国際学会
  • [学会発表] Tail reduction process during human embryonic development(Oral + Poster)2017

    • 著者名/発表者名
      Tojima S, Makishima H, Takakuwa T, Yamada S.
    • 学会等名
      第50回日本発生生物学会大会
  • [学会発表] Three dimensional utilization of human embryo specimens of the “Kyoto Collection” (Poster)2017

    • 著者名/発表者名
      Makishima H, Katsube M, Miyazaki R, Yamaguchi Y, Kobayashi S, Uwabe C, Yamamoto A, Imai H, Yoneyama A, Funatomi T, Morimoto N, Takeda T, Nakatsukasa M, Kose K, Takakuwa T, Yamada S.
    • 学会等名
      第50回日本発生生物学会大会
  • [学会発表] ヒト気管支発生の 3 次元的解析2017

    • 著者名/発表者名
      高桑徹也、村中太河、山田重人
    • 学会等名
      第106回日本病理学会総会
  • [学会発表] ヒト胚子期における脳形態形成の解析2017

    • 著者名/発表者名
      白石直樹、片山愛里、中島崇、山田重人、上部千賀子、巨瀬勝美、高桑徹也
    • 学会等名
      第106回日本病理学会総会
  • [学会発表] EFICを用いた膝関節の形態形成の解析2017

    • 著者名/発表者名
      高石亮太、Xiangkai Zhang、青山朋樹、山田重人、高桑徹也
    • 学会等名
      第106回日本病理学会総会
  • [学会発表] Down 症候群を持つ人達の自己認識への社会的要因の関与2017

    • 著者名/発表者名
      三宅秀彦、他
    • 学会等名
      第69回日本産科婦人科学会学術講演会
  • [図書] ヒト発生研究への応用と進化発生学への展開。(橋爪誠編「多元計算解剖学の基礎と臨床への応用」)2018

    • 著者名/発表者名
      勝部元紀、巻島美幸、山田重人
    • 総ページ数
      303
    • 出版者
      誠文堂新光社
    • ISBN
      978-4416518243
  • [図書] Prenatal Diagnosis of the Human Embryo and Fetus. In: “Precision Medicine in Gynecology and Obstetrics”, book editied by Ikuo Konishi,2017

    • 著者名/発表者名
      Yamada S, Miyake H.
    • 総ページ数
      250
    • 出版者
      Springer Singapore
    • ISBN
      978-9811024887
  • [図書] 産婦人科診療に役立つ 早わかり遺伝医療入門2017

    • 著者名/発表者名
      山田 重人、三宅 秀彦
    • 総ページ数
      152
    • 出版者
      メディカ出版
    • ISBN
      978-4-8404-6495-6

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公開日: 2018-12-17   更新日: 2022-06-06  

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