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2018 年度 実績報告書

若年性大腸癌の発症における新規原因遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 15K08335
研究機関埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所)

研究代表者

赤木 究  埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 腫瘍診断・予防科, 科長(兼)部長 (30244114)

研究分担者 角田 美穂  埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 腫瘍診断・予防科, 研究員 (60347359)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
キーワードDKC1 / 若年性大腸癌 / パネル検査
研究実績の概要

研究期間の延長を行い、DKC1遺伝子変異を原因とする非常に稀な症例について論文化を行い公表した。今後は主治医の診療機関と連携し、先天角化異常症の典型例から異なる点について詳細な解析を行う予定である。若年大腸癌の症例では、これまで原因が明らかでなかった1症例について、レトロトランスポゾンの挿入変異が存在する事が明らかとなった。この挿入変異は数kbと長い為、一般的なペアのプライマーを用いたPCRによるターゲットエンリッチメントでは検出されにくく、昨年度の研究から必要性が示唆され導入へと至った、片側プライマーを用いたAnchored PCRによるターゲットエンリッチメント法により検出可能となった。さらにこの症例の経験から、多施設共同研究として解析している症例に同様の挿入変異が検出された。通常の遺伝学的検査では検出困難な症例について、原因遺伝子を確定できたことは、遺伝性腫瘍症候群の患者に対する適切な診断とサーベイランスの提供に大きく貢献できたと考えられる。また、cDNAからCDSの全長をPCR、シーケンスを行う事により、mRNAの変化を解析する手法から、解析の困難なPMS2遺伝子の解析が進展し、稀な変化を捉えられるようになった。これらのレトロトランスポゾン挿入変異と、PMS2遺伝子の変化については現在論文化を行っている。本研究成果によって、稀な遺伝子だけでなく、既知の遺伝子に起こる稀な変化についても詳細に解析できるフローが構築され、今後の研究の基盤となる技術となった。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Development of metachronous rectal cancers in a young man with dyskeratosis congenita: a case report.2019

    • 著者名/発表者名
      Watanabe M, Yamamoto G, Fujiyoshi K, Akagi Y, Kakuta M, Nishimura Y, Akagi K.
    • 雑誌名

      J Med Case Rep.

      巻: 13 ページ: 117-122

    • DOI

      10.1186/s13256-019-2044-5.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Multi-gene panel を用いた遺伝性大腸がんの遺伝子診断2018

    • 著者名/発表者名
      赤木 究、山本 剛、宮部泉、角田美穂、若月智和、田中佳輔、中村 篤大、山下 健太郎、山口達郎、三口真司、須藤剛、 永坂 岳司、塩澤学、中野 雄介、野水整、安田有里、主藤朝也、稲田麻里、賀川義規、富田佳典
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第63回大会
    • 招待講演
  • [学会発表] Analyzing pathogenic variants in Lynch syndrome by DNA and RNA sequencing2018

    • 著者名/発表者名
      山本 剛, 新井 吉子, 立川 哲彦, 赤木 究
    • 学会等名
      第77回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] An update on hereditary tumors Construction of Integrated Database of Clinical and Genetic Information for Lynch syndrome in Japan2018

    • 著者名/発表者名
      赤木 究, 山本 剛, 松下 一之, 檜井 孝夫, 横井 左奈, 田中屋 宏爾, 松原 長秀, 冨田 尚裕, 石田 秀行
    • 学会等名
      第77回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
  • [学会発表] 多数の大腸腺腫を併発した日本人若年発症直腸癌患者におけるMBD4遺伝子生殖細胞系列病的変異の同定と直腸癌組織における体細胞変異プロファイルの解析2018

    • 著者名/発表者名
      江口 英孝、田中屋 宏爾、田夛 祐喜、立川 哲彦、平田 智子、神田 将和、 井谷 史嗣、赤木 究、岡崎 康司、石田 秀行
    • 学会等名
      第24回日本家族性腫瘍学会学術集会
  • [学会発表] NGSを用いたCNV検出によるLynch症候群病的バリアントの確定2018

    • 著者名/発表者名
      山本 剛、宮部 泉、高橋 朱実、須藤 久美子、石川 志帆、新井 吉子、菊地 茉莉、田中 桂輔、若月 智和、立川 哲彦、角田 美穂、横井 左奈、檜井 秀夫、松下 一之、赤木 究
    • 学会等名
      第24回日本家族性腫瘍学会学術集会

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公開日: 2019-12-27  

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