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2017 年度 実績報告書

大腸癌の成長に関与するD群レンサ球菌の多株比較解析に基づく病原性因子に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 15K08462
研究機関神戸市環境保健研究所

研究代表者

野本 竜平  神戸市環境保健研究所, その他部局等, 研究員 (60642238)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード多株比較ゲノム解析 / ゲノムワイド関連解析 / 人獣共通感染症
研究実績の概要

本研究では新興の人獣共通感染症が疑われる細菌であり、ヒトの大腸癌との因果関係も予測されているStreptococcus gallolyticus (SG) の病原性因子及び腫瘍細胞の活性化因子の解明と、それらの獲得・進化機構の解明を目指す。そのために。1) SG 野外・臨床分離株のゲノム配列を取得し、各病原性候補遺伝子の分布を明らかにし、その中でメタデータとの比較から実際に疾病の発症や宿主細胞への接着に関与すると想定される遺伝子の候補を選定する。2) 培養細胞や実験動物を用いた解析から、1)で予測された候補遺伝子の発現の差異が細胞への接着や炎症誘導性及び病原性に与える影響を明らかにする。3) 2)で絞り込んだ遺伝子の組換え体を通した解析から、SG の病原性発揮機構を解明すると共に、どのような相互作用ネットワークで宿主細胞の炎症を誘導し、ひいては腫瘍細胞形成促進へとつながるメカニズムを解明する。本年度は昨年度までに得られたゲノムデータに更に20株のSG菌株を追加し、詳細にコアゲノム解析を実施した。これまでの解析で計99株のゲノム配列を用いて解析を実施した。SNP系統樹、アクセサリー遺伝子マトリックスによる系統樹、コアゲノムアライメント系統樹などの系統解析では、SG は全ての株が他のStreptococcus属から独立した系統的位置にクラスターを形成した。また、コアゲノム解析結果を基にメタデータの特徴と遺伝子の有無を関連付けるゲノムワイド関連解析を実施したところ、ヒト由来株と動物由来株に特徴づけられる遺伝子は見出せず、本菌が人獣共通感染症を引き起こす可能性が示唆された。また、莢膜の生合成関連遺伝子群やグルカンの生合成遺伝子群に多様性が見いだされ、その多様性が本菌が引き起こす臨床症状の違いの原因となっている可能性が考えられた。本研究を通じてSGが生体内でどのような挙動で病原性を発揮するのかに関して一定の知見が得られた。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Development of PCR for identifying Streptococcus parasuis, a close relative of Streptococcus suis2018

    • 著者名/発表者名
      Ryoko Yamada a, Le Hong Thuy Tien b, Sakura Arai , Mari Tohya, Kasumi Ishida-Kuroki, Ryohei Nomoto, Hyunjung Kim, Eriko Suzuki, Ro Osawa, Takayasu Watanabe, Tsutomu Sekizaki
    • 雑誌名

      The Journal of Veterinary Medical Science

      巻: 印刷中 ページ: -

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Taurine does not affect the composition, diversity, or metabolism of human colonic microbiota simulated in a single-batch fermentation system2017

    • 著者名/発表者名
      Sasaki Kengo、Sasaki Daisuke、Okai Naoko、Tanaka Kosei、Nomoto Ryohei、Fukuda Itsuko、Yoshida Ken-ichi、Kondo Akihiko、Osawa Ro
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 12 ページ: -

    • DOI

      https://doi.org/10.1371/journal.pone.0180991

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Streptococcus gallolyticusの病原因子の解明を目指した比較ゲノム解析2017

    • 著者名/発表者名
      野本竜平、丸山史人、大倉正稔、高松大輔、大澤朗
    • 学会等名
      第90回日本細菌学会学術総会
  • [学会発表] Streptococcus gallolyticusの種内・亜種内比較ゲノム解析による病原性因子の探索2017

    • 著者名/発表者名
      野本竜平, 丸山史人, 大倉正稔, 高松大輔, 大澤 朗
    • 学会等名
      第49回レンサ球菌研究会

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公開日: 2018-12-17  

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