次世代シークエンサーによる乳がん及び前立腺がん特異的がん関連遺伝子の多型解析

2017 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 15K08720
• 研究機関: 千葉県がんセンター(研究所)
• 研究代表者: 中村 洋子 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター, 主席研究員 (60260254)
• 研究分担者: 三上 春夫 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター, 部長 (10332355)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• キーワード: 乳がん / 前立腺がん / エクソーム解析 / がん関連遺伝子 / 次世代シークエンサー

研究実績の概要

千葉県東北部には、がんの集積性が見られ、その地域を含む健常者約8,000 人を対象に最長12年間追跡しているコホート研究が進行中である。その中で県内のがん高発症地区の原因究明と体細胞変異との関連について検討し、さらに院内患者集団と比較し、リスクマーカー、体細胞変異Signatureを同定し、がん予防、治療、予後予測へ結びつく分子診断技術を将来的に開発することを目的としている。
コホート研究で収集した血液検体を用いて、乳がん発症40 例、前立腺がん発症28例をリスク群、さらに70 歳までがんの発症がなく、がんマーカー（CEA,CA19-9）陰性、家族歴無しの33 例を非リスク群として、400 種類以上のがん関連遺伝子について、リスク群特異的かつ機能的な多型同定のため、Ion Ampli SeqとComprehensive Cancer Panel（CCP）を使用し、Ion Torrent PGM半導体シークエンサー解析を行ってきた。その中で、他のがん種で見出した、がん関連遺伝子が乳がんならびに前立腺がんに関与があるか検討を進めた。解析を進めている遺伝子は、遺伝子多型に伴いアミノ酸変化が認められ、タンパク構造に影響を与え、タンパク質の機能を変えることが予測される遺伝子である。また、乳がんおよび前立腺がん発症症例検体での解析から、アミノ酸の変化やストップコドンを創出するミッセンス・ナンセンス変異を同定した遺伝子についても検討中である。
さらに、乳がん発症症例40症例について、BRCA2の多型解析から、既知のSNPは４つあり、また１つは未知のものであることが本研究で分かっている。

研究成果

• [雑誌論文] A genome-wide association study in the Japanese population identifies the 12q24 locus for habitual coffee consumption: The J-MICC Study. (2018)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa-Senda H, Hachiya T, Shimizu A, Hosono S, Oze I, Watanabe M, Matsuo K, Ito H, Hara M, Nishida Y, Endoh K, Kuriki K, Katsuura-Kamano S, Arisawa K, Nindita Y, Ibusuki R, Suzuki S, Hosono A, Mikami H, Nakamura Y, Takashima N, Sasakabe T, Kawai S, Okada R, Hishida A, Naito M, Wakai K, Tanaka H. et al.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 8 ページ: 1493
  • DOI: 10.1038/s41598-018-19914-w.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genomic analysis-integrated whole-exome sequencing of neuroblastomas identifies genetic mutations in axon guidance pathway. (2017)
  • 著者名/発表者名: Li Y, Ohira M, Zhou Y, Xiong T, Luo W, Yang C, Li X, Gao Z, Zhou R, Nakamura Y, Kamijo T, Kaneko Y, Taketani T, Ueyama J, Tajiri T, Zhang H, Wang J, Yang H, Yin Y, Nakagawara A.
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8 ページ: 56684-56697
  • DOI: 10.18632/oncotarget.18079.
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Genetic Variants of RAMP2 and CLR are Associated with Stroke. (2017)
  • 著者名/発表者名: Koyama T, Kuriyama N, Ozaki E, Matsui D, Watanabe I, Takeshita W, Iwai K, Watanabe Y, Nakatochi M, Shimanoe C, Tanaka K, Oze I, Ito H, Uemura H, Katsuura-Kamano S, Ibusuki R, Shimoshikiryo I, Takashima N, Kadota A, Kawai S, Sasakabe T, Okada R, Hishida A, Naito M, Mikami H, Nakamura Y, Wakai K. et.al.
  • 雑誌名: J Atheroscler Thromb, 巻: 24 ページ: 1267-1281
  • DOI: 10.5551/jat.41517
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 前向きコホート研究による胃がん高リスク群でのアミノ酸変化を伴う多型の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 中村洋子、滝口伸浩、三上春夫、永瀬浩喜
  • 学会等名: 第26回日本癌病態治療研究会
• [学会発表] 千葉利根川水系におけるがんの高罹患率の原因究明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 中村洋子、高山喜美子、三上春夫、永瀬浩喜
  • 学会等名: 日本がん登録協議会第26回学術集会
• [学会発表] 前向きコホート研究によるがんの高リスク群でのアミノ酸変化を伴う多型の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 中村洋子、巽康年、奥村和弘、高取敦志、丸喜明、横井左奈、大平美紀、鍋谷圭宏、深沢賢、片山稔、三上春夫、永瀬浩喜
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [学会発表] 血清中の微量元素含有量を用いた新たながんスクリーニング法の開発に関する研究 (2017)
  • 著者名/発表者名: 三上春夫、宮城洋平、中村洋子、永瀬浩喜
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [備考] 千葉県がんセンター研究所
  • URL: https://www.pref.chiba.lg.jp/gan/kenkyujo/index.html
• [備考] 千葉県がんセンター研究所Facebook
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