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2016 年度 実施状況報告書

デジタルPCRを用いた超高感度マルチプレックス変異検出法の確立とその臨床的検討

研究課題

研究課題/領域番号 15K09226
研究機関和歌山県立医科大学

研究代表者

山本 信之  和歌山県立医科大学, 医学部, 教授 (60298966)

研究分担者 洪 泰浩  和歌山県立医科大学, 医学部, 講師 (80426519)
赤松 弘朗  和歌山県立医科大学, 医学部, 助教 (10646582)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード分子標的治療 / 新規診断技術 / EGFR変異
研究実績の概要

肺がんはがん関連死の原因として高い割合を占める。特定の遺伝子変異を有する患者においては、分子標的薬剤が著効し、治療成績は向上している。しかしながら、de novo耐性変異等の低頻度変異アリルが存在する時の臨床像は不明であり、治療戦略は確立されていない。肺がんを分子生物学的レベルで解明し、さらなる個別化医療を進めるためには、より高感度な検出系を確立し、生物学的特徴および臨床像を解明する必要がある。本申請では、デジタルPCR 法を用いて承認薬剤の標的遺伝子変異を網羅する測定パネルを開発し、変異検出感度と精度の飛躍的な向上を実現することを目標にしている。加えて、低頻度変異アリル存在時の臨床像を解明し、肺がん個別化医療推進につなげることを目指している。
前年度から引き続き、標的となるEGFR遺伝子変異をクローニングしたプラスミドを用いて、複数の遺伝子変異を同時に検出できるデジタルPCRの測定パネルを確立に取り組んだ。具体的には3種類のEGFR遺伝子変異(L858R、Exon19 Deletion、T790M)を同時に検出する5つのパネル検出系の確立に取り組み、検出系をほぼ確立した。その上で本年度は主に上記EGFR遺伝子変異測定パネルを用いて患者検体での測定用のための臨床試験を実施した。既に組織検体での検討をほぼ終了し、検出用のカットオフ値の設定を行い、臨床研究用に利用することが可能な状態となっている。現在はさらに血液検体からの血漿DNAを用いての検討を実施しており、こちらについてもマルチプレックス化により主要な遺伝子変異の検出を可能とする予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

1.標的となるEGFR遺伝子変異をクローニングしたプラスミドを用いて、複数の遺伝子変異を同時に検出できるデジタルPCRの測定パネルを確立に取り組んだ。具体的には3種類のEGFR遺伝子変異(L858R、Exon19 Deletion、T790M)を同時に検出するパネル検出系の確立に取り組み、検出系をほぼ確立した。
2.上記の検出系を用いて臨床検体での検討を実施した。組織検体での測定を既に終えており、現在は血液検体からの血漿DNAを用いた測定を実施している。
3.第三世代EGFR阻害剤の耐性獲得機序として報告されている、EGFR C797S変異に対しての検出系の確立を目指し取り組みを開始した。

今後の研究の推進方策

血液検体からの血漿DNAを含む臨床検体を用いての検討を進めるとともに、耐性出現の早期予測及び治療効果との相関について評価を進める。具体的には、EGFR阻害剤を投与される患者において、治療開始後のEGFR変異アリル頻度の推移を経時的に観察することで、無増悪生存期間との関係を検討する予定である。また第三世代EGFR阻害剤の耐性の原因となるEGFR C797Sの検出系の確立を目指す。デジタルPCR法を利用した次世代シーケンシングについても引き続き検討を行う。本方法により少量の鋳型DNAの利用においても、網羅的な遺伝子変異解析が実現できる可能性がある。

次年度使用額が生じた理由

次年度使用額が生じた理由として、非常に精度高く検出を行うことができたため、当初の予定よりも大幅に確認のための再測定を減らすことができたことが挙げられる。

次年度使用額の使用計画

次年度にはさらなる臨床検体を用いての評価を予定しており、その測定に研究費を使用する。加えて、新規の標的の検出を予定しており、その検出系確立に用いる。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2016

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 1件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 7件) 図書 (5件)

  • [雑誌論文] Peripheral pulmonary carcinoid tumor diagnosed by endobronchial ultrasound guided bronchoscopy2016

    • 著者名/発表者名
      Tanaka A
    • 雑誌名

      Respirol Case Rep

      巻: 4 ページ: 10-12

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Differences in physical activity according to mMRC grade in patients with COPD2016

    • 著者名/発表者名
      Hayata A
    • 雑誌名

      Int J Chron Obstruct Pulmon Dis

      巻: 11 ページ: 2203-2208

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Applicability of the Japanese equation for estimating glomerular filtration rate in patients with advanced-stage thoracic cancer2016

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi T
    • 雑誌名

      Respir Investig

      巻: 54 ページ: 479-483

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Afatinib versus Chemotherapy in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer and Common Epidermal Growth Factor Receptor Gene Mutations and Brain Metastases2016

    • 著者名/発表者名
      Schuler M
    • 雑誌名

      J Thorac Oncol

      巻: 11 ページ: 380-390

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Feasibility study of chemoradiotherapy followed by amrubicin and cisplatin for limited-disease small cell lung cancer2016

    • 著者名/発表者名
      Sekine I
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 107 ページ: 315-319

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phase II study of erlotinib plus tivantinib (ARQ 197) in patients with locally advanced or metastatic EGFR mutation-positive non-small-cell lung cancer just after progression on EGFR-TKI, gefitinib or erlotinib2016

    • 著者名/発表者名
      Azuma K
    • 雑誌名

      ESMO open

      巻: 1 ページ: e000063

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Re-biopsy status among non-small cell lung cancer patients in Japan: A retrospective study2016

    • 著者名/発表者名
      Nosaki K
    • 雑誌名

      Lung Cancer

      巻: 101 ページ: 1-8

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bevacizumab for non‐small‐cell lung cancer: A nested case control study of risk factors for hemoptysis2016

    • 著者名/発表者名
      Goto K
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 107 ページ: 1837-1842

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A randomized, double-blind, phase II study of ramucirumab plus docetaxel vs placebo plus docetaxel in Japanese patients with stage IV non-small cell lung cancer after disease progression on platinum-based therapy2016

    • 著者名/発表者名
      Yoh K
    • 雑誌名

      Lung Cancer 99: 186-193, 2016 20.Atagi S, Goto K, Seto

      巻: 99 ページ: 186-193

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Erlotinib for Japanese patients with activating EGFR mutation-positive non-small-cell lung cancer: combined analyses from two Phase II studies2016

    • 著者名/発表者名
      Atagi S
    • 雑誌名

      Future Oncol

      巻: 12 ページ: 2117-2126

    • 査読あり
  • [学会発表] Comparative analysis of PD-L1 expression between circulating tumor cells and tumor tissues in patients with lung cancer2016

    • 著者名/発表者名
      Koh Y,
    • 学会等名
      IASLC 17th World Conference on Lung Cancer 2016
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2016-12-04 – 2016-12-07
    • 国際学会
  • [学会発表] Phase II study of nimotuzumab + conrurrent chemoradiotherapy (CRT) for stage III non-small cell lung cancer (NSCLC): 5-year follow up results2016

    • 著者名/発表者名
      Hayakawa K
    • 学会等名
      IASLC 17th World Conference on Lung Cancer 2016
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2016-12-04 – 2016-12-07
    • 国際学会
  • [学会発表] Alectinib (ALC) versus Crizotinib (CRZ) in ALk-positive non-small cell lung cancer (ALK+ NSCLC): Primary results form phase III study (J-ALEX)2016

    • 著者名/発表者名
      Kim Y
    • 学会等名
      IASLC 17th World Conference on Lung Cancer 2016
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2016-12-04 – 2016-12-07
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparison of PD-L1 expression between tumor tissues and circulating tumor cells and tumor tissues in patients with lung cancer2016

    • 著者名/発表者名
      Koh Y
    • 学会等名
      EORTC-NCI-AACR
    • 発表場所
      Munich, Germany
    • 年月日
      2016-11-29 – 2016-12-02
    • 国際学会
  • [学会発表] A prospective biomarker study using digital PCR method in EGFR mutated, advanced lung adenocarcinoma patients treated with afatinib2016

    • 著者名/発表者名
      Akamatsu H
    • 学会等名
      American Association for Cancer Research Annual Meeting 2016
    • 発表場所
      New Orleans, Louisiana, USA
    • 年月日
      2016-04-16 – 2016-04-20
    • 国際学会
  • [学会発表] Differential expression of PD-L1 on circulating tumor cells in patients with advanced lung cancer2016

    • 著者名/発表者名
      Kim W
    • 学会等名
      American Association for Cancer Research Annual Meeting 2016
    • 発表場所
      New Orleans, Louisiana, USA
    • 年月日
      2016-04-16 – 2016-04-20
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of an automated device for size-based enrichment and isolation of circulating tumor cells in lung cancer patients2016

    • 著者名/発表者名
      Yagi S
    • 学会等名
      American Association for Cancer Research Annual Meeting 2016
    • 発表場所
      New Orleans, Louisiana, USA
    • 年月日
      2016-04-16 – 2016-04-20
    • 国際学会
  • [図書] デジタルPCRの原理と臨床腫瘍学での有用性2016

    • 著者名/発表者名
      赤松弘朗, 洪泰浩, 山本信之
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      中外医学社
  • [図書] どのような肺がん患者に化学療法が行われるか2016

    • 著者名/発表者名
      赤松弘朗, 山本信之
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      学研
  • [図書] 抗癌薬の副作用対策2016

    • 著者名/発表者名
      赤松弘朗, 山本信之
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      南江堂
  • [図書] 分子標的時代における治療推奨の重みづけをどうするか?2016

    • 著者名/発表者名
      赤松弘朗, 山本信之
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      中外医学社
  • [図書] 各種がんにおける化学療法 1肺癌2016

    • 著者名/発表者名
      赤松弘朗, 山本信之
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      学研

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公開日: 2018-01-16  

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