三次元ゲノム解析による肝内胆管癌のクローン進化と腫瘍内不均一性の解明

2017 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 15K10170
• 研究機関: 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター)
• 研究代表者: 井口 友宏 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 肝胆膵外科医師 (30598959)
• 研究分担者: 鈴木 穣 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646) ; 宮野 悟 東京大学, 医科学研究所, 教授 (50128104)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• キーワード: 肝内胆管癌 / 腫瘍内不均一性 / 全エキソームシーケンス / RNAシーケンス / clonal evolution

研究実績の概要

①肝内胆管癌の症例集積：肝内胆管癌の切除症例は肝癌の中では比較的割合が低く、九州大学病院別府病院外科のみならず九州大学消化器・総合外科、大阪大学消化器外科、大分県立病院、大分厚生連鶴見病院などと研究協力を行い症例集積を行った。（13症例）適格
症例としては術前及び術後検査にて腫瘤形成性もしくは胆管拡張型の肝内胆管癌と診断されたもの、おおよそ径3㎝以上のもの、腫瘍中心がおおよそ肝内胆管第一分岐より末梢のもの、とした。検体は摘出後すぐに冷凍保存しそのゲノム抽出に供された。正常肝組織お
よび複数個所の主要組織を3次元的に採取しさらに肝内胆管癌は間質成分も多いためLaser microdissectionの手法を用いて拡大観察を行いながら確実に腫瘍成分のみを採取しgenomic DNA・RNAを抽出した。
②次世代シーケンサーによるシーケンス：次世代シーケンサーIllumina Hiseq 2000プラットフォームを使用し抽出したDNA、RNAを用いて網羅的なエキソームシーケンスおよびRNAシーケンスを行った。全エキソームシーケンスは各遺伝子の塩基配列変化およびコピー数変化を検討することを目的とし、RNAシーケンスは各遺伝子の転写量の定量および異常転写産物の同定を目的とした。13症例70か所につきシーケンスが終了している。
③シーケンス結果の解析：シーケンスの結果を東京大学ヒトゲノム解析センターのスーパーコンピュータを用いて解析した。全サンプルにつき遺伝子変異、コピー数変化、遺伝子発現量、異常遺伝子転写産物の同定が終了した。平成30年度においては網羅的解析により各症例における進化系統樹を作成し、その進化の多様性および、治療標的遺伝子の同定を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Subtotal Cholecystectomy as a Last Resort for Complicated Gallstone Disease. (2018)
  • 著者名/発表者名: Sugimachi K, Iguchi T, Morita M, Toh Y.
  • 雑誌名: Mol Clin Oncol 巻: 2 ページ: 201-202
  • DOI: 10.1016/j.jamcollsurg.2017.10.011
  • 査読あり
• [雑誌論文] Up-regulation of SLC9A9 Promotes Cancer Progression and Is Involved in Poor Prognosis in Colorectal Cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ueda M, Iguchi T, Masuda T, Komatsu H, Nambara S, Sakimura S, Hirata H, Uchi R, Eguchi H, Ito S, Sugimachi K, Mizushima T, Doki Y, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: Anticancer Res. 巻: 37 ページ: 2255-2263
  • DOI: 10.21873/anticanres.11562
  • 査読あり
• [雑誌論文] Altered Expression of Hippo Signaling Pathway Molecules in Intrahepatic Cholangiocarcinoma. (2017)
  • 著者名/発表者名: Sugimachi K, Nishio M, Aishima S, Kuroda Y, Iguchi T, Komatsu H, Hirata H, Sakimura S, Eguchi H, Bekki Y, Takenaka K, Maehara Y, Suzuki A, Mimori K.
  • 雑誌名: Oncology. 巻: 93 ページ: 67-74
  • DOI: 10.1159/000463390
  • 査読あり
• [雑誌論文] DDR2 Expression Is Associated with a High Frequency of Peritoneal Dissemination and Poor Prognosis in Colorectal Cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Sasaki S, Ueda M, Iguchi T, Kaneko M, Nakayama H, Watanabe T, Sakamoto A, Mimori K.
  • 雑誌名: Anticancer Res. 巻: 37 ページ: 2587-2591
  • DOI: 10.21873/anticanres.11603
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphoserine Phosphatase Is a Novel Prognostic Biomarker on Chromosome 7 in Colorectal Cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Sato K, Masuda T, Hu Q, Tobo T, Kidogami S, Ogawa Y, Saito T, Nambara S, Komatsu H, Hirata H, Sakimura S, Uchi R, Hayashi N, Iguchi T, Eguchi H, Ito S, Nakagawa T, Mimori K.
  • 雑誌名: Anticancer Res. 巻: 37 ページ: 2365-2371
  • DOI: 10.21873/anticanres.11574
  • 査読あり
• [雑誌論文] Antitumor effects of the antiparasitic agent ivermectin via inhibition of Yes-associated protein 1 expression in gastric cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Nambara S, Masuda T, Nishio M, Kuramitsu S, Tobo T, Ogawa Y, Hu Q, Iguchi T, Kuroda Y, Ito S, Eguchi H, Sugimachi K, Saeki H, Oki E, Maehara Y, Suzuki A, Mimori K.
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 64 ページ: 107666-107677
  • DOI: 10.18632/oncotarget.22587 eCollection 2017 Dec 8.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Circulating exosomal microRNA-203 is associated with metastasis possibly via inducing tumor-associated macrophages in colorectal cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Takano Y,, Masuda T, Iinuma H, Yamaguchi R, Sato K, Tobo T, Hirata H, Kuroda Y, Nambara S, Hayashi N, Iguchi T, Ito S, Eguchi H, Ochiya T, Yanaga K, Miyano S, Mimori K
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 45 ページ: 78598-78613
  • DOI: 10.18632/oncotarget.20009. eCollection 2017 Oct 3.
  • 査読あり
• [学会発表] in silico解析による肝細胞癌の新規関連遺伝子SF3B4（Splicing factor B，subunit 4）の同定と臨床病理学的意義の検討 (2017)
  • 著者名/発表者名: 井口 友宏,辻田 英司, 信藤 由成, 吉田 大輔, 太田 光彦, 南 一仁, 池部 正彦, 森田 勝, 増田 隆明, 三森 功士, 藤 也寸志
  • 学会等名: 第117回日本外科学会定期学術集会
• [学会発表] 高齢者肝胆膵外科手術に対する術前早期リハビリ介入の有用性 (2017)
  • 著者名/発表者名: 井口 友宏,辻田 英司, 信藤 由成, 吉田 大輔, 太田 光彦, 南 一仁, 池部 正彦, 森田 勝, 藤 也寸志.
  • 学会等名: 第72回日本消化器外科学会総会
• [学会発表] 肝細胞癌におけるSF3B4(Splicing factor B,subunit 4)の臨床病理学的意義 (2017)
  • 著者名/発表者名: 井口 友宏、杉町 圭史、香川 正樹、中司 悠、杉山 雅彦、吉田 大輔、太田 光彦、池部 正彦、森田 勝、三森 功士、藤 也寸志
  • 学会等名: 第28回日本消化器癌発生学会総会