• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2016 年度 実施状況報告書

次世代シーケンサーを用いた加齢黄斑変性類縁疾患の疾患感受性遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 15K10879
研究機関国際医療福祉大学

研究代表者

森 圭介  国際医療福祉大学, 大学病院, 教授 (90251090)

研究分担者 勝本 武志  埼玉医科大学, 医学部, 助教 (20751887) [辞退]
堀江 公仁子  埼玉医科大学, 医学部, 教授 (90261982)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード加齢黄斑変性 / 網膜血管腫状増殖 / エクソーム解析 / 遺伝子多型 / 一塩基多型 / 次世代シーケンサ
研究実績の概要

平成28年度に実施した研究成果は大きく分けて、1) サンプル収集と具体的な2)遺伝子解析に分けられる。
1) サンプル収集
昨年度は、研究代表者が施設移動となったため、旧施設(埼玉医科大学)の倫理委員会のサンプル整理を行ったが、今年度は本年度は当該施設(国際医療福祉大学)および旧施設でのサンプル収集の準備と実際の収集を行った。当該施設での倫理書類が受理・承認されたので、サンプル採取・およびのその整理、DNA抽出の体制の整備を同時進行で行った。ゲノムDNA精製を行うとともに、生活環境因子(年齢、性別、身長・体重(BMI)、喫煙歴(pack/year)、心疾患・糖尿病・高血圧など合併症の有無、等)の聴取も行った。結果、両施設を合わせて25サンプル(平成29年3月31日現在)の収集が終了した。当該施設でのサンプル収集が思いの他進展していないのが問題である。収集対象がかなり希な疾患であるため集まりにくいこと、また周辺施設との連携が確立が遅れていることが問題点である。
2) 遺伝子解析
昨年度までに採取されたサンプルに対して、DNA精製を行った。また、今年度消耗品で申請した試薬を用いて、研究協力施設である埼玉医科大学ゲノム医学研究センターの堀江教授の下、イクソーム解析を行った。具体的な統計学的な集計はまだサンプル数が少ないので解析していない。本年度および29年度のサンプル採取・イクソーム解析後、総合的な統計学的解析を開始する予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

昨年度、科研費の申請後に決定した施設の移動の影響が思いの他大きく、昨年度の遅れがそのまま継続している。当該施設でのサンプル採取の体制は整ったが、疾患が比較的稀な状態(加齢黄斑変性の約3%)のため、予想よりもサンプル数が伸びていない。他施設の協力を検討している。

今後の研究の推進方策

現時点までに上述のように、25サンプル収集が出来ているが、今後当該施設でのサンプル数が伸びない場合、すでにサンプルのやり取りに関して倫理委員会の承認を受けている施設があるため、他施設からのサンプルの供与を考えている。

次年度使用額が生じた理由

現状、様式F-7-1に記載したが、予期せぬ研究代表者の施設異動があったため、研究の運営が全体的に遅延している。特に平成27年度においては、研究体制の新たなる確立があったため、どうしてもその年度に予定されていることが出来なかった。それらの遅れが本年度にも響いており、基本的にサンプルの収集の遅れが否めない。そのため。エクソーム解析を多数行うことが出来なかったため(一部は本年度施行)、研究費、特に消耗品の使用が予定より少なくなっている。サンプルが収集され次第、順次増やしていく予定である。

次年度使用額の使用計画

当該施設でのサンプル収集を急ぐが、間に合わない場合は、サンプル供与の関係が確立されている共同研究施設において、収集されたサンプルを供与して頂くことを検討している。このような二重の防御策をとって、必ず実験結果を得られるようにしたい。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2016 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Singapore Eye Research Institute/Duke-NUS Graduate Medical School/National University Health System(シンガポール)

    • 国名
      シンガポール
    • 外国機関名
      Singapore Eye Research Institute/Duke-NUS Graduate Medical School/National University Health System
    • 他の機関数
      5
  • [国際共同研究] The Chinese University of Hong Kong(中国(香港))

    • 国名
      その他の国・地域
    • 外国機関名
      The Chinese University of Hong Kong
  • [国際共同研究] Seoul National University/Seoul Nat Univ Bundang Hospital/College of Medicine(韓国)

    • 国名
      韓国
    • 外国機関名
      Seoul National University/Seoul Nat Univ Bundang Hospital/College of Medicine
    • 他の機関数
      6
  • [国際共同研究] Sichuan Provincial People’s Hospital/University of Electronic Science/Ministry of Education of China(中国)

    • 国名
      中国
    • 外国機関名
      Sichuan Provincial People’s Hospital/University of Electronic Science/Ministry of Education of China
    • 他の機関数
      4
  • [国際共同研究] University of Pittsburgh/Public Health, University of Pittsburgh(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      University of Pittsburgh/Public Health, University of Pittsburgh
  • [国際共同研究]

    • 他の国数
      2
  • [雑誌論文] Retinochoroidal morphology described by wide-field montage imaging of spectral domain optical coherence tomography.2016

    • 著者名/発表者名
      Mori K, Kanno J, Gehlbach PL.
    • 雑誌名

      Retina

      巻: 36 ページ: 375-384

    • DOI

      10.1097/IAE.0000000000000703.

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A missense variant in FGD6 confers increased risk of polypoidal choroidal vasculopathy.2016

    • 著者名/発表者名
      125.Huang L, Zhang H, Cheng CY, Wen F, Tam PO, Zhao P, Chen H, Li Z, Chen L, Tai Z, Yamashiro K, Deng S, Zhu X, Chen W, Cai L, Lu F, Li Y, Cheung CG, Shi Y, Miyake M, Lin Y, Gong B, Liu X, Sim KS, Yang J, Mori K, et al.
    • 雑誌名

      Nat Genet

      巻: 48 ページ: 640-647

    • DOI

      10.1038/ng.3546

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Low-frequency coding variants in CETP and CFB are associated with susceptibility of exudative age-related macular degeneration in the Japanese population.2016

    • 著者名/発表者名
      126.Momozawa Y, Akiyama M, Kamatani Y, Arakawa S, Yasuda M, Yoshida S, Oshima Y, Mori R, Tanaka K, Mori K, Inoue S, Terasaki H, Yasuma T, Honda S, Miki A, Inoue M, Fujisawa K, Takahashi K, Yasukawa T, Yanagi Y, Kadonosono K, Sonoda KH, Ishibashi T, Takahashi A, Kubo M.
    • 雑誌名

      Hum Mol Genet

      巻: 25 ページ: 5027-5034

    • DOI

      10.1093/hmg/ddw335

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 脈絡膜血管新生モデルにおける遺伝子発現ネットワーク.2016

    • 著者名/発表者名
      堀江公仁子、上山数弘、森圭介、井上聡.
    • 学会等名
      脳心血管抗加齢研究会
    • 発表場所
      東京、日本
    • 年月日
      2016-12-17 – 2016-12-18
  • [学会発表] Potential androgen receptor-mediated gene regulatory pathways in a mouse model of laser-induced choroidal neovascularization.2016

    • 著者名/発表者名
      Horie-Inoue K, Ueyama K, Mori K, Inoue S.
    • 学会等名
      XXII Biennial Meeting of the International Society for Eye Research.
    • 発表場所
      Tokyo, Japan
    • 年月日
      2016-09-25 – 2016-09-29
    • 国際学会
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる加齢黄斑変性類縁疾患感受性遺伝子の同定.2016

    • 著者名/発表者名
      森圭介、堀江公仁子
    • 学会等名
      国際医療福祉大学学会.
    • 発表場所
      栃木、日本
    • 年月日
      2016-08-28
    • 招待講演

URL: 

公開日: 2018-01-16   更新日: 2022-02-16  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi