| 研究課題/領域番号 |
15K12270
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
持続可能システム
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| 研究機関 | 国立研究開発法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
持田 恵一 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (90387960)
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| 連携研究者 |
櫻井 哲也 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, ユニットリーダー (90415167)
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| 研究協力者 |
山口 由紀子 (上原 由紀子) 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, テクニカルスタッフ
井上 小槙 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, テクニカルスタッフ
清水 みなみ 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, テクニカルスタッフ
吉田 拓広 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, テクニカルスタッフ
高萩 航太郎 公立大学法人横浜市立大学, 生命ナノシステム研究科, 学生
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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| キーワード | 除虫菊 / トランスクリプトーム / 代謝 |
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| 研究成果の概要 |
除虫菊が生産する忌避成分の代謝に関連する遺伝子を網羅的に同定するために、障害ストレスに応答するトランスクリプトームの時系列解析を行った。損傷ストレスを与える前の葉と、損傷ストレスを与えてから継時的に葉を収集し、細胞内で誘導される遺伝子の網羅的に収集した。一連のRNA-seq法による解析で785,196,824のリードを得た。これらをアセンブリすることで、195,776のリファレンスとして利用する転写物の配列を得た。これらの遺伝子の機能注釈を行い、忌避成分生産を含む障害応答における関連遺伝子を網羅的に収集するための基礎的データを得た。
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| 自由記述の分野 |
ゲノム情報科学
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