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2017 年度 研究成果報告書

深海底微生物のメタゲノム分析と新奇レアメタル依存遺伝子発現誘導機構の解明

研究課題

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研究課題/領域番号 15K14419
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 ゲノム生物学
研究機関高知大学

研究代表者

芦内 誠  高知大学, 教育研究部総合科学系生命環境医学部門, 教授 (20271091)

研究分担者 若松 泰介  高知大学, 教育研究部総合科学系生命環境医学部門, 講師 (60597938)
連携研究者 稲垣 史生  独立行政法人 海洋研究開発機構, 高知コア研究所, 上席研究員 (50360748)
諸野 祐樹  独立行政法人 海洋研究開発機構, 高知コア研究所, 主任研究員 (30421845)
研究協力者 白米 優一  愛媛大学, 連合農学研究科
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード深海底 / 難培養性微生物 / メタゲノム / レアメタルバイオロジー / 核酸スイッチ / 金属イオン吸着 / 機能性バイオ高分子
研究成果の概要

微生物はあらゆる環境に生息しているが、その大半は既存の方法論では増やせない“難培養性”であることが分かってきた。メタゲノム技術の出現により、かかる難培養生命体の遺伝生理学の扉が開いた。今回、深海底コア試料を対象とする機能メタゲノム分析から、新奇レアメタル応答遺伝子配列の単離に成功した。また、計算化学的手法を応用し、リボスイッチ様の新たな構造モチーフの同定にも成功した。堆肥から深海底まで、様々な生息環境に適応した土壌細菌“巨大菌”にもレアメタル(レアアース)応答性が見いだされた。その細胞増殖や環境適応にも関わる生存戦略の概観が見えてきた。

自由記述の分野

応用分子微生物学

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公開日: 2019-03-29  

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