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2017 年度 実績報告書

次世代シークエンサーを用いた古代病原菌解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K14615
研究機関独立行政法人国立科学博物館

研究代表者

篠田 謙一  独立行政法人国立科学博物館, その他部局等, 研究調整役 (30131923)

研究分担者 神澤 秀明  独立行政法人国立科学博物館, 人類研究部, 研究員 (80734912)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード古代ゲノム解析 / 細菌 / メタゲノム / 次世代シークエンサー / 口腔細菌
研究実績の概要

本年度は、昨年までに取得したゲノムデータの解析を行った。オホーツク文化期初期の人骨である北海道利尻島タネトンナイ遺跡から出土した人骨は、結核に罹患している可能性があることが指摘されていたが、今回の分析では結核菌のゲノムを抽出することはできなかった。これまでの結核菌分析の成功例を見ると、その多くは患部付近の人骨を材料としている場合が負い。今回は歯髄に含まれるDNAを解析しているので、これが検出に失敗した原因である可能性がある。古人骨からの病原菌DNAの検出は未だに成功例が少なく、定型的な手法が確立していないのが現状で、本研究期間でもそれをなし遂げることはできなかった。
一方、四肢骨が強く萎縮した北海道の縄文人(入江9号人骨)のゲノムデータを見直した結果、この人物は男性であることが示唆された。この人骨はこれまで女性のものとされ、それを根拠にして筋ジストロフィーではなく、ポリオに罹患していると判断されてきた。しかし男性であることが分かったので、筋ジストロフィーであった可能性が示されることになった。今回の分析は従来説の見直しを迫るものとなった。
オーストラリアのアデレード大学との共同で行った縄文人と江戸時代人の口腔細菌のゲノム解析では、両者に違いが見られた。このことから食性と口腔細菌叢の間に関係がある可能性が示され、食性が不明な集団についても,口腔細菌叢の分析によって見当を付けることができる可能性があることが示された。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Ethnic derivation of the Ainu inferred from ancient mitochondrial DNA data.2018

    • 著者名/発表者名
      Adachi N., Kakuda T., Takahashi R., Kanzawa-Kiriyama H. Shinoda K.
    • 雑誌名

      American Journal of Physical Anthropology

      巻: 162 ページ: 139-148

    • DOI

      10.1002/ajpa.23338

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 佐世保市岩下洞穴および下本山岩陰遺跡出土人骨のミトコンドリアDNA分析.2017

    • 著者名/発表者名
      篠田 謙一, 神澤 秀明, 角田 恒雄, 安達 登
    • 雑誌名

      Anthropological Science (Japanese Series)

      巻: 125 ページ: 49-63

    • DOI

      10.1537/asj.170509

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Analysis of the ancient human genome2017

    • 著者名/発表者名
      篠田謙一
    • 学会等名
      第71回日本人類学会大会
  • [学会発表] ゲノムから探る日本人の成り立ち2017

    • 著者名/発表者名
      篠田謙一
    • 学会等名
      第9回泌尿器抗加齢医学研究会.
    • 招待講演

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公開日: 2018-12-17  

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