病原微生物の潜伏環境としての原生生物の役割

2017 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 15K14850
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 中尾 亮 北海道大学, 獣医学研究院, 准教授 (50633955)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• キーワード: 原生生物 / アメーバ / メタゲノム / 共生微生物 / 細菌叢

研究実績の概要

本研究は、環境中に生息するアメーバ等の原生生物が「病原体の自然界での潜伏」と「環境菌から病原菌への進化」において重要な役割を担うのではないかとの仮説を立て、環境サンプル中の細菌および原生生物組成を明らかにすることを目的とした。タイ王国の類鼻疽流行地から採集した土壌および環境水およびザンビア共和国首都ルサカ近隣で採取した環境水を材料に原核生物16SリボソーマルRNA遺伝子および真核生物18SリボソーマルRNA遺伝子の超可変領域をPCR増幅し、Illumina MiSeqを用いてアンプリコン解析を実施した。タイ王国の類鼻疽流行地由来サンプルからは、類鼻疽病原体であるBurkholderia pseudomalleiに相同性の高い配列が多数得られた。一方で、解析した16SリボソーマルRNA遺伝子領域の配列のみではB. pseudomalleiと近縁である非病原性のB. thailandensisと区別が困難であり、今後MinIONなどのロングリードシーケンサーを用いた解析の必要性が明らかとなった。ザンビア共和国由来のサンプルからは、FusobacteriumおよびTermimonas等が最優占細菌属として検出されたが、当地で流行する感染症との関連は見出せなかった。真核生物18SリボソーマルRNA遺伝子の解析については、データベース整備が進まず、多くのリードのアノテーションが困難となる課題が残った。今後、データベースの拡充とリボソーマルRNA遺伝子間領域であるITS（internal transcribed spacer）1 および ITS2等の他の超可変領域を追加した解析が必要と考えられた。

研究成果

• [国際共同研究] University of Zambia(Zambia)
  • 国名: ザンビア
  • 外国機関名: University of Zambia
• [国際共同研究] Mahidol University(Thailand)
  • 国名: タイ
  • 外国機関名: Mahidol University
• [雑誌論文] Tick-borne haemoparasites and Anaplasmataceae in domestic dogs in Zambia (2018)
  • 著者名/発表者名: Qiu Yongjin, Kaneko Chiho, Kajihara Masahiro, Ngonda Saasa, Simulundu Edgar, Muleya Walter, Thu May J., Hang'ombe Mudenda B., Katakura Ken, Takada Ayato, Sawa Hirofumi, Simuunza Martin, Nakao Ryo
  • 雑誌名: Ticks and Tick-borne Diseases 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: 10.1016/j.ttbdis.2018.03.025
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] First molecular detection and genetic characterization of Coxiella burnetii in Zambian dogs and rodents (2018)
  • 著者名/発表者名: Chitanga Simbarashe、Simulundu Edgar、Simuunza Martin C.、Changula Katendi、Qiu Yongjin、Kajihara Masahiro、Nakao Ryo、Syakalima Michelo、Takada Ayato、Mweene Aaron S.、Mukaratirwa Samson、Hang’ombe Bernard M.
  • 雑誌名: Parasites & Vectors 巻: 11 ページ: 40
  • DOI: 10.1186/s13071-018-2629-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Geographic strain differentiation of Schistosoma japonicum in the Philippines using microsatellite markers (2017)
  • 著者名/発表者名: Moendeg Kharleezelle J.、Angeles Jose Ma M.、Nakao Ryo、Leonardo Lydia R.、Fontanilla Ian Kendrich C.、Goto Yasuyuki、Kirinoki Masashi、Villacorte Elena A.、Rivera Pilarita T.、Inoue Noboru、Chigusa Yuichi、Kawazu Shin-ichiro
  • 雑誌名: PLOS Neglected Tropical Diseases 巻: 11 ページ: e0005749
  • DOI: 10.1371/journal.pntd.0005749
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Listeria monocytogenes serotype 4b strains replicate in monocytes/macrophages more than the other serotypes (2017)
  • 著者名/発表者名: HASEBE Rie、NAKAO Ryo、OHNUMA Aiko、YAMASAKI Takeshi、SAWA Hirofumi、TAKAI Shinji、HORIUCHI Motohiro
  • 雑誌名: The Journal of Veterinary Medical Science 巻: 79 ページ: 962～969
  • DOI: 10.1292/jvms.16-0575
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Potential of cell-free DNA as a novel diagnostic biomarker for parasite infections in dog (2017)
  • 著者名/発表者名: Akter S, Nakao R, Katakura K
  • 学会等名: 26th International Conference of the World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology (WAAVP)
  • 国際学会