研究課題
本年度は国立病院機構九州がんセンターで採取した頭頸部ないし消化器がんの患者に対し本研究についての同意取得、口腔診査および唾液採取を前年度より継続して行った。採取した70名の患者の唾液は細菌DNAを抽出したのち、細菌共通配列である8Fおよび338Rプライマーを用いて細菌16SrRNA遺伝子V1-V2領域をPCR法で増幅した。各被験者由来のPCR増幅断片は等濃度ずつ混合し、次世代シーケンサーIon PGMを用いて塩基配列を解読することで16SrRNA遺伝子塩基配列を取得した。がん患者群の唾液からは483OTU（菌種レベル）が検出され、Streptococcus属が最も優勢で、次いでNeisseria属、Prevotella属、Rothia属、Veillonella属、Actinomyces属、Porphyromonas属がほとんどの被験者で高い割合を占めていた。この結果は従来のがん患者でない健康成人の唾液細菌叢の構成と一致していた。細菌構成類似度指標UniFracを用いた福岡県久山町の成人住民2286名の唾液との比較でも、細菌叢の全体構成としては本患者群が一般住民と大きく異ならなかった。一方で一部の細菌種の構成比率には差異が認められ、細菌属レベルではがん患者ではVeillonella属、Actinomyces属等がより優勢であるのに対し、Prevotella属等の構成比率が低い傾向が認められた。両群を特徴づける菌種をLEFSe解析により探索すると上記の細菌属に該当するVeillonella atypicaやPrevotella melaninogenicaといった菌種に加え、歯周病の病原細菌として知られるPorphyromonas gingivalisががん患者を特徴的づける菌種として選出され、口腔常在微生物叢と頭頸部・消化器がんとの関連性が示唆された。
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すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 7件、 招待講演 6件)
Clin Oral Investig
巻: 印刷中 ページ: 印刷中
10.1007/s00784-016-2035-5
PLoS One
巻: 12 ページ: e0174782
10.1371/journal.pone.0174782
