2016 年度研究成果報告書

ゲノム3次元構造データに基づく共局在遺伝子の網羅的探索

研究課題

研究課題/領域番号	15K16089
研究種目	若手研究(B)
配分区分	基金
研究分野	生命・健康・医療情報学
研究機関	国立研究開発法人産業技術総合研究所
研究代表者	齋藤裕国立研究開発法人産業技術総合研究所, 人工知能研究センター, 研究員 (60721496)
研究期間 (年度)	2015-04-01 – 2017-03-31
キーワード	ゲノム3D構造 / エピゲノム / HiC/3C
研究成果の概要	ハイスループット実験技術HiCによって得られたゲノム3次元構造データから、遺伝子の共局在を網羅的に探索する情報解析手法Coseargeを開発した。Coseargeによって胚性幹細胞のHiCデータを解析した結果、先行研究において提案されたtopologically associated domainとは異なる新しい共局在遺伝子を多数発見できた。特に、胚性幹細胞に特異的な遺伝子であるSOX2とDNAダメージ修復関連の遺伝子が共局在するという新しい知見が得られた。
自由記述の分野	エピゲノム情報解析の新規手法開発