研究課題
放射線による変異導入頻度の測定を行うため、ヒト繊維肉腫細胞 HT1080を用いることとした。細胞を一度クローン化し、均一な細胞集団を形成させ、これらの細胞を96ウェルプレートにFACS Ariaを用いてソーティングを行い１細胞/ウェルの状態にした。137CS γ線源放射照射装置を使用して放射線照射群・非照射群を作成した。放射線照射群の線量はγ線照射2.5 Gy・500 ｍGy・100 ｍGy・20 mGyとしそれぞれのγ線照射細胞を得た。これらの細胞の全ゲノムシーケンスを行うために細胞を分裂増殖させた後にPCRフリーの系にてシーケンス用サンプル調整を行い、HiSeq2500を用いて全ゲノムシーケンスを行った。現在シーケンスデータを得て計算機による解析を行っている。
2: おおむね順調に進展している
放射線照射を行う細胞の準備から放射線照射を行い、シーケンスサンプルの調整、全ゲノムシーケンスまで進んでおり、現在データの解析中である。初年度ではシーケンスを行うあたりまでを計画していたのでおおむね順調に計画は進捗ている。
放射線照射を行った細胞からDNAを抽出し全ゲノムシーケンスを行っておりシーケンスデータの解析中であるが、解析方法も決まった方法があるわけではなく必要にあわせて自分でプログラムを組んで解析する場合が出てきている。これらの解析を組み合わせることで詳細な変異導入頻度を測定に努める方針である。
全ゲノムシーケンスとして次年度に繰り越したシーケンスが存在するため。
全ゲノムシーケンスを行い現在解析を行っているが、実験データの再現性を確認するために同じ系を繰り返し確認を行う。
すべて 2016 2015
すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)
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