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2016 年度 実績報告書

藍色細菌時計タンパク質KaiBの構造と機能の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K18492
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

谷山 怜子 (村上怜子)  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, その他 (00444365)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
キーワード生物時計 / 藍色細菌 / 概日リズム / 超分子質量分析 / 中性子小角散乱 / X線結晶構造解析
研究実績の概要

藍色細菌の時計タンパク質は、KaiA、KaiBおよびKaiCから構成され、3つのタンパク質によって時間振動が生み出される。KaiAおよびKaiBはKaiCと相互作用し、時計関連タンパク質SasAもまた、KaiCと相互作用する。本研究では、Kai生物時計機構が時間情報を生み出す機構を明らかにするために、Kaiタンパク質複合体の構造解析を行った。
① KaiBとKaiCの相互作用において、抗リン酸化変異体(KaiCDT)が最も効率よく複合体を形成することが明らかになった。超分子質量分析法により、KaiBはKaiCDT6量体に対し、高い協同性をもって6分子結合することを明らかにした。さらに、中性子小角散乱法により、KaiC6量体上に6分子のKaiBがリング上に配置されていることを見出した。この相互作用界面は発信系に関わるSasAとKaiCの相互作用界面を完全に覆い隠すものであったため、KaiBの強い正の協同生によって、SasAが一斉に解離するという発信メカニズムが想定される。
② 概日振動中におけるKaiA, KaiB, KaiCの複合体形成を調査した。KaiCのリン酸化期にはKaiA-KaiB-KaiC複合体が、脱リン酸化期にはKaiA-KaiC複合体が観察された。KaiA-KaiB-KaiC複合体ではKaiBがKaiAと結合することで、KaiAとKaiCとの相互作用を阻害し、KaiAによるKaiCのリン酸化の促進を負に制御している可能性が示唆された。
③ SasA-KaiC複合体のキャラクタライズを行った。超分子質量分析によりSasAはKaiBのような協同性は示さず、KaiC6量体に対し結合する分子数が濃度依存的に増えていくことが明らかになった。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Structural characterization of the circadian clock protein complex composed of KaiB and KaiC by inverse contrast-matching small-angle neutron scattering.2016

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, M., Yagi, H., Ishii, K., Porcar, L., Martel, A., Oyama, K., Noda, M., Yunoki, Y., Murakami, R., Inoue, R., Sato, N., Oba, Y., Terauchi, K., Uchiyama, S. & Kato, K.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 6 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/srep35567.

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Circadian oscillations of KaiA-KaiC and KaiB-KaiC complex formations in an in vitro reconstituted KaiABC clock oscillator.2016

    • 著者名/発表者名
      Murakami, R., Mutoh, R., Ishii, K. & Ishiura, M.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 8 ページ: 890-900

    • DOI

      10.1111/gtc.12392

    • 査読あり
  • [学会発表] 物理化学的計測による時計タンパク質複合体の構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      柚木康弘, 杉山正明, 矢木宏和, 石井健太郎, 大山克明, Lionel Porcar, Anne Martel, 野田勝紀, 村上怜子, 井上倫太郎, 佐藤伸浩, 大場洋次郎, 寺内一姫, 内山 進, 加藤晃一
    • 学会等名
      第81回生化学会中部支部会
    • 発表場所
      名古屋市立大学
    • 年月日
      2017-05-20 – 2017-05-20
  • [学会発表] Structural characterization of circadian clock protein complexes by small-angle neutron scattering and native mass spectrometry analyses2017

    • 著者名/発表者名
      Yunoki, Y., Sugiyama, M., Yagi, H., Ishii, K., Oyama, K., Porcar, L., Martel, A., Noda, M., Murakami, R., Inoue, R., Sato, N., Oba, Y., Terauchi, K., Uchiyama, S. & Kato, K.
    • 学会等名
      新学術領域「動的秩序と機能」第5回国際シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2017-01-21 – 2017-01-22
    • 国際学会

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公開日: 2018-01-16  

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