|
タンパク質などの生体分子は、他のタンパク質や低分子化合物（リガンド）と特異的に相互作用することにより構造を変化させ、シグナル伝達や転写制御といった機能を発揮する。
本研究では、研究代表者が開発したMulti-scale Enhanced Sampling法の適用によりリガンド結合過程の計算機シミュレーションに取り組み、生理学的環境に沿った溶媒中での網羅的な全原子構造探索に成功した。得られた構造アンサンブルから自由エネルギー地形を計算し、受容体タンパク質の大きな構造変化とカップルしたリガンド結合過程の最適パスウェイを、側鎖相互作用形成や脱水和過程といった観点から明らかにした。
|
