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2016 年度 実績報告書

統合失調症のゲノムコピー数変異解析とバイオインフォマティクスを用いた分子病態研究

研究課題

研究課題/領域番号 15K19720
研究機関名古屋大学

研究代表者

久島 周  名古屋大学, 高等研究院(医), 特任助教 (00732645)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
キーワードゲノムコピー数変異 / 統合失調症
研究実績の概要

1699名の統合失調症患者と824名の健常者を対象に高解像度アレイCGHを用いてゲノムコピー数変異(CNV)解析を実施し、7066個の稀な(<1%)CNVを得た。その中で、発症と関連するCNV(American College of Medical Geneticsの基準で判定)を患者153名(9.0%)、健常者26名(3.2%)で同定した。その上で、次の検討を行った。
1.臨床表現型解析:発症関連CNVをもつ患者108名の臨床表現型を後方視的に調べた結果、42%の患者で先天性疾患や発達上の問題を認めた。また抗精神病薬への治療反応性に関しては、発症関連CNVをもつ患者はそれ以外の患者と比較して、治療抵抗性を示す割合が有意に高いことを明らかにした(36% vs 17%, オッズ比=2.8, p=0.0036)。
2. 遺伝セット解析に基づく生物学的パスウェイの同定
患者と健常者で同定したCNVデータに基づいて、gene ontologyの遺伝子セットを用いて遺伝子セット解析を行い、患者CNVが優位に集積する生物学的パスウェイを探索した。その結果、53の遺伝子セットが有意(FDR q<0.01)になり、とくに31の遺伝子セットは既報の研究で関連が示唆されていた。これら31の遺伝子セットは、9つの機能的カテゴリー(oxidative stress response, genomic integrity, kinase, small GTPase signaling, synapse, cell adhesion等)に分類できた。この結果は統合失調症の分子病態の理解を深めるものである。特に酸化ストレスは既報で多数の報告があるが、本結果はその遺伝的基盤を明らかにした点で重要である。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (1件)

  • [国際共同研究] Chang Gung University(Taiwan)

    • 国名
      その他の国・地域
    • 外国機関名
      Chang Gung University
  • [国際共同研究] Cardiff University(United Kingdom)

    • 国名
      英国
    • 外国機関名
      Cardiff University
  • [国際共同研究] University of Toronto(Canada)

    • 国名
      カナダ
    • 外国機関名
      University of Toronto
  • [国際共同研究] University of Wurzburg(Germany)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      University of Wurzburg
  • [国際共同研究] Stanford University(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Stanford University
  • [国際共同研究]

    • 他の国数
      1
  • [雑誌論文] High-resolution copy number variation analysis of schizophrenia in Japan.2017

    • 著者名/発表者名
      Kushima I, Aleksic B, Nakatochi M, Shimamura T, Shiino T, Yoshimi A, Kimura H, Takasaki Y, Wang C, Xing J, Ishizuka K, Oya-Ito T, Nakamura Y, Arioka Y, Maeda T, Yamamoto M,
    • 雑誌名

      Mol Psychiatry.

      巻: 22 ページ: 430-440

    • DOI

      10.1038/mp.2016.88.

    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Mutation screening of GRIN2B in schizophrenia and autism spectrum disorder in a Japanese population.2016

    • 著者名/発表者名
      Takasaki Y, Koide T, Wang C, Kimura H, Xing J, Kushima I
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 6 ページ: -

    • DOI

      10.1038/srep33311.

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of a rare variant in CHD8 that contributes to schizophrenia and autism spectrum disorder susceptibility.2016

    • 著者名/発表者名
      Kimura H, Wang C, Ishizuka K, Xing J, Takasaki Y, Kushima I, Aleksic B, Uno Y, Okada T, Ikeda M, Mori D, Inada T, Iwata N, Ozaki N.
    • 雑誌名

      Schizophr Res.

      巻: 178 ページ: 104-106

    • DOI

      10.1016/j.schres.2016.08.023.

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Resequencing and Association Analysis of Six PSD-95-Related Genes as Possible Susceptibility Genes for Schizophrenia and Autism Spectrum Disorders.2016

    • 著者名/発表者名
      Xing J, Kimura H, Wang C, Ishizuka K, Kushima I, Arioka Y, Yoshimi A, Nakamura Y, Shiino T, Oya-Ito T, Takasaki Y, Uno Y, Okada T, Iidaka T, Aleksic B, Mori D, Ozaki N.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 6 ページ: -

    • DOI

      10.1038/srep27491.

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Parental Origin of Interstitial Duplications at 15q11.2-q13.3 in Schizophrenia and Neurodevelopmental Disorders.2016

    • 著者名/発表者名
      Isles AR, Ozaki N, Aleksic B, Kushima I,
    • 雑誌名

      PLoS Genet.

      巻: 12 ページ: -

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1005993.

    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 統合失調症の高解像度ゲノムコピー数変異解析2016

    • 著者名/発表者名
      久島周、アレクシッチ・ブランコ、中杤昌弘、島村徹平、尾崎紀夫
    • 学会等名
      第38回日本生物学的精神医学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-09-08 – 2016-09-08

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公開日: 2018-01-16   更新日: 2022-02-16  

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