腫瘍内エピゲノム不均一性を解明する1細胞クロマチン構造解析技術の開発

2017 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 15K21113
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 腫瘍生物学; 人類遺伝学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 田中 梓 京都大学, 医学研究科, 特別研究員(PD) (70749796)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• キーワード: エピゲノム / 細胞分化 / 成人T細胞白血病 / クロマチン

研究成果の概要

エピゲノムの異常をターゲットとした創薬の開発が期待される一方、多種多様なヒストンマークを1つずつ調べる従来の手法では、エピゲノムの全体像を理解することは難しい。そこで本研究では、オープンクロマチン領域をゲノムワイドで検出するATAC-seqという技術に改良を加え非常に少数の細胞を用いたクロマチン構造解析を行った。細胞数の限られる成人T細胞白血病(ATL)の臨床サンプル30例のクロマチン構造を健常人サンプルと比較解析することでATLで特異的に機能が亢進している転写因子と、機能が減弱している転写因子の絞り込みを行った。

自由記述の分野

エピゲノム