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2017 年度 実績報告書

イチジクコバチにおける寄主植物への適応の遺伝的基盤の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K21705
研究機関琉球大学

研究代表者

和智 仲是  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, ポスドク研究員 (40635299)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワード分子生態学 / 遺伝的多様性 / 生物間相互作用 / 共種分化 / ゲノム / 昆虫 / イチジクコバチ科 / イチジク属
研究実績の概要

本研究では、イチジクコバチの種群を材料に、次世代シークエンサーを用いた解析により点突然変異をマーカーにしたゲノム規模の相関解析を行う。そして寄主植物の異なる種間・集団間の比較により、種ごとに特定の寄主植物の利用を可能にするゲノム領域を明らかにする。新たに解読するイヌビワコバチのゲノムや他種のゲノムを参照配列として、寄主であるイチジク属植物への適応に関わる遺伝子群の探索を行う。一連の解析結果により、イチジクコバチにおける寄主利用の遺伝的基盤を明らかにすることを目指す。
最終年度である本年度は、イヌビワコバチBlastophaga nipponica(日本集団32個体・台湾集団33個体)とその近縁種B. taiwanensis(台湾集団30個体)を材料に、ゲノム規模の情報を用いた比較を行った。その結果、両種の台湾集団間の遺伝的分化の程度は小さいことが明らかになった(FST=0.026)。さらに、この傾向とは異なり、種間で特に大きな遺伝的分化を示す領域が10領域見出された。これらの領域のうち、寄主植物の違いに対応した分化の傾向を示す領域(3領域)について、新規に配列を取得したイヌビワコバチのドラフトゲノムを元に周辺に位置する遺伝子の特定を試みた。ゲノム上の位置が推定できた領域は全て遺伝子間領域に位置していた。当初の予想とは異なり、周辺に位置する遺伝子に共通した機能を見いだすことはできなかった。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2018 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [国際共同研究] 国立中興大学(台湾)

    • 国名
      その他の国・地域
    • 外国機関名
      国立中興大学
  • [雑誌論文] Application of next-generation sequencing to the study of non-model insects2018

    • 著者名/発表者名
      Nakatadata Wachi, Kei W. Matsubayashi, Kaoru Maeto
    • 雑誌名

      Entomological Science

      巻: 21 ページ: 3-11

    • DOI

      https://doi.org/10.1111/ens.12281

    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2018-12-17   更新日: 2022-08-18  

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