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2015 年度 実施状況報告書

遷移状態を制御する機能性人工生体分子の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15KT0071
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

川上 隆史  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬分子プロファイリング研究センター, 研究員 (60638881)

研究期間 (年度) 2015-07-10 – 2018-03-31
キーワードDIVERSEシステム / PUREシステム / cDNAディスプレイ / ペプチドタグ / タンパク質ラベリング / バイオイメージング / 蛍光イメージング / 蛍光プローブ
研究実績の概要

(ポリ)ペプチドタグと低分子の反応などの生体分子関連化学反応の創製は、化学反応の遷移状態制御の機構解明において非常に重要である。
これまでに、低分子との反応を介して特定タンパク質をラベルするための様々なペプチドタグ(sortase基質ペプチドタグ、トランスグルタミナーゼ基質ペプチドタグ等)が報告されているが、天然に既に存在するタンパク質の改変や、メカニズムに基づいたデザイン、ファージディスプレイ等の細胞系分子進化のいずれかによって開発されてきている。
本研究では、数十兆種類という多様(diverse)な(ポリ)ペプチドタグライブラリーからの超高速スクリーニングを可能にする無細胞系の分子進化により、タンパク質ラベリング用ポリペプチドタグを創製する新システム(DIVERSEシステム:Directed In Vitro Evolution of Reactive peptide-tags via Sequential Enrichment)を開発し、非酵素的に共有結合でラベリングするペプチドタグのde novo創製を達成した。そして創製したペプチドタグを用いて、様々な蛍光プローブによるタンパク質ラベリングや生細胞内タンパク質のバイオイメージングへの応用を実証した(Kawakami et al., Chemisty & Biology, 22, 1671-1679, (2015))。
DIVERSEシステムは、新規ペプチドタグのde novo創製に限らず、数十兆種類のポリペプチドタグライブラリーからの超高速スクリーニングを介した、既存ポリペプチドタグの配列最適化等への応用も期待することができる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ポリペプチドタグと低分子等の反応の創製を可能にするDIVERSEシステムの開発に成功し、非酵素的に共有結合でタンパク質ラベリングするペプチドタグのde novo創製を達成したため。そして創製したペプチドタグを用いて、様々な蛍光プローブによるタンパク質ラベリングや生細胞内タンパク質のバイオイメージングへの応用を実証したため。

今後の研究の推進方策

創製したペプチドタグと低分子の間の新規化学反応について、その遷移状態制御の機構解明を推進する。
またDIVERSEシステムを用いて、既存ポリペプチドタグの技術を有する研究者と、ポリペプチドタグ配列最適化に関する共同研究も推進する。

次年度使用額が生じた理由

研究計画が順調に進んだため、計画よりも研究費を抑えることが可能となった。また、所属機関の共用機器が使用可能となったため、計画よりも研究費を抑えることが可能となった。

次年度使用額の使用計画

引き続き、細胞生物学実験試薬・器具、有機合成化学実験試薬・器具などの物品費、学会発表のための旅費等として使用する計画である。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Directed Evolution of a Cyclized Peptoid-Peptide Chimera against a Cell-Free Expressed Protein and Proteomic Profiling of the Interacting Proteins to Create a Protein-Protein Interaction Inhibitor2016

    • 著者名/発表者名
      Takashi Kawakami, Koji Ogawa, Tomohisa Hatta, Naoki Goshima, and Tohru Natsume
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 11 ページ: 1569-1577

    • DOI

      10.1021/acschembio.5b01014

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] DIVERSE System: De Novo Creation of Peptide Tags for Non-enzymatic Covalent Labeling by In Vitro Evolution for Protein Imaging Inside Living Cells2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Kawakami, Koji Ogawa, Naoki Goshima, and Tohru Natsume
    • 雑誌名

      Chemistry & Biology

      巻: 22 ページ: 1671-1679

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2015.10.016

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] In vitro display evolution of cyclized peptidomimetics targeted to a chemically synthesized amyloid beta protein dimer2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Kawakami, Kazuma Murakami, Daiki Sakamoto, Mizuho Hanaki, Tohru Natsume, and Kazuhiro Irie
    • 雑誌名

      Peptide Science

      巻: 52 ページ: 323-324

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Post-translational modification mapping of collagen that binds to HSP47 by directed ligand evolution and DNLC mass spectrometry2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Kawakami, Shinya Ito, Naoki Goshima, Kazuhiro Nagata, and Tohru Natsume
    • 雑誌名

      Peptide Science

      巻: 52 ページ: 321-322

    • 査読あり
  • [学会発表] 試験管内分子進化法を用いたPPI阻害環状Nアルキルペプチド化合物の創製2016

    • 著者名/発表者名
      川上隆史
    • 学会等名
      新学術領域研究「天然物ケミカルバイオロジー」地区ミニシンポジウム~天然物ケミカルバイオロジーの更なる発展を目指して~
    • 発表場所
      京都大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-02-23 – 2016-02-23
    • 招待講演
  • [学会発表] Directed evolution of antibody-like peptides for proteomics2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Kawakami, Naoki Goshima, and Tohru Natsume
    • 学会等名
      The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • 発表場所
      Honolulu (USA)
    • 年月日
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • 国際学会
  • [学会発表] 無細胞分子進化法と超高感度質量分析を用いた翻訳後修飾の網羅的解析2015

    • 著者名/発表者名
      川上隆史、伊藤進也、五島直樹、永田和宏、夏目徹
    • 学会等名
      日本ペプチド学会第52回ペプチド討論会
    • 発表場所
      平塚中央公民館(神奈川県平塚市)
    • 年月日
      2015-11-16 – 2015-11-18
  • [学会発表] アミロイドβ二量体を標的とする非天然型環状ペプチドの試験管内分子進化2015

    • 著者名/発表者名
      川上隆史、村上一馬、阪本大樹、花木瑞穂、夏目徹、入江一浩
    • 学会等名
      日本ペプチド学会第52回ペプチド討論会
    • 発表場所
      平塚中央公民館(神奈川県平塚市)
    • 年月日
      2015-11-16 – 2015-11-18
  • [学会発表] 進化分子工学と有機合成化学を基盤とするペプチドツール創製システムの構築2015

    • 著者名/発表者名
      川上隆史
    • 学会等名
      BioJapan2015 World Business Forum
    • 発表場所
      パシフィコ横山(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2015-10-15 – 2015-10-15
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考]

    • URL

      http://www.molprof.jp/~kawakami/

  • [備考]

    • URL

      http://researchmap.jp/takakawa/

  • [産業財産権] 任意の標的物質と共有結合可能な(ポリ)ペプチド/タンパク質タグの選択方法及び選択されて得られた(ポリ)ペプチド/タンパク質タグ2015

    • 発明者名
      川上隆史、夏目徹
    • 権利者名
      川上隆史、夏目徹
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2015-160191
    • 出願年月日
      2015-08-14

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公開日: 2017-01-06  

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