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2004 年度 実績報告書

GPU装備のPCクラスタによる医用画像の高性能計算に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 16016254
研究機関大阪大学

研究代表者

萩原 兼一  大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 (00133140)

研究分担者 伊野 文彦  大阪大学, 情報科学研究科, 助手 (90346172)
キーワードGPU / GPGPU / 非描画処理 / 頂点プロセッサ / フラグメントプロセッサ / 剛体2次元 / 3次元位置合わせ / 命令移動 / 高速化
研究概要

本研究では,次世代のHPC(HPC : High Performance Computing)環境として台頭してきたGPU(Graphics Processing Unit)に着目し,プログラム可能な2つの内部プロセッサ(VP(Vertex Processor)とFP(Fragment Processor))をもつGPUを装備したPCクラスタを用いて医用画像処理の高速化を実現する.具体的には,GPUが本来の対象としてきた描画処理(レンダリング)を始め,これまで対象としていなかった非描画処理を新しい用途として開拓していき,GPUによる非描画処理のためのプログラミング手法を確立する.
本年度は次に挙げる3つの課題を研究した.
1)GPU内プロセッサ間命令移動による性能向上手法
一般にGPUを用いたプログラミングを行う場合に,FPを中心にしたプログラムとなる.したがって,FPの処理負荷がVPのそれより多くなり,GPU全体としての効率が悪い.そこで,任意にVPプログラムとFPプログラムが与えられた場合に,FPからVPに移動可能な命令を移動させ,GPU全体の効率を上げる方法を提案した.医用画像の基本処理であるガウスフィルタのGPU実装に,この提案方法を応用し,約2倍の性能向上があることを実証した.
2)GPUによる2次元/3次元画像位置合わせアルゴリズムの開発
CPUによる実装と比較して,GPUによる実装は20〜100倍の速度向上が見込めることを実験により確認した.
3)大規模データを可視化するための効率のよいボリュームレンダリング
研究成果は,論文誌および国際会議において発表していて,高い評価を得ている.

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2005 2004

すべて 雑誌論文 (17件)

  • [雑誌論文] メッセージ通信プログラムの性能改善可能性を評価するための実行履歴の削減2005

    • 著者名/発表者名
      伊野 文彦
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌 188-D-I・4(採録決定)

  • [雑誌論文] PerWiz : A What-If Prediction Tool for Tuning Message Passing Programs2005

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of the 6th International Conference on High Performance Computing for Computational Science (採録決定)

  • [雑誌論文] Fast Performance Prediction of Master-Slave Programs by Partial Task Execution2005

    • 著者名/発表者名
      Yasuharu Mizutani
    • 雑誌名

      WSEAS Transactions on Computers (採録決定)

  • [雑誌論文] Fast Performance Prediction of Master-Slave Programs by Partial Task Execution2005

    • 著者名/発表者名
      Yasuharu Mizutani
    • 雑誌名

      Proceedings of the 4th WSEAS International Conference on Software Engineering, Parallel and Distributed Systems (採録決定)

  • [雑誌論文] 短時間処理向け資源管理を実現するためのGlobus Toolkitの性能評価2005

    • 著者名/発表者名
      村木 健介
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2004-HPC-101(発表予定)

  • [雑誌論文] A Data Distributed Parallel Algorithm for Nonrigid Image Registration2005

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Parallel Computing (採録決定)

  • [雑誌論文] PCクラスタを用いた並列非剛体位置合わせ手法の性能評価2005

    • 著者名/発表者名
      田中 裕也
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2004-54

      ページ: 19-24

  • [雑誌論文] 汎用グラフィクスハードウェアを用いた2次元/3次元剛体位置合わせの予備評価2005

    • 著者名/発表者名
      合田 圭吾
    • 雑誌名

      第5回胚ハイフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウムポスター論文集

      ページ: 20

  • [雑誌論文] A Performance Analysis Tool for Performance Debugging of Message Passing Parallel Programs2004

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of the 33rd International Conference on Parallel Processing Workshops

      ページ: 546-554

  • [雑誌論文] Evaluation of Performance Prediction Method for Master/Slave Parallel Programs2004

    • 著者名/発表者名
      Yasuharu Mizutani
    • 雑誌名

      IEICE Transactions on Information and Systems E87-D・4

      ページ: 967-975

  • [雑誌論文] 部分的なタスク実行によるマスタスレーブ型並列プログラムの高速な性能予測2004

    • 著者名/発表者名
      水谷 泰治
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2004-HPC-98

      ページ: 13-18

  • [雑誌論文] MPIプログラムにおける大規模な実行履歴生成の検討2004

    • 著者名/発表者名
      置田 真生
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2004-HPC-98

      ページ: 19-24

  • [雑誌論文] 実時間グリッド計算のための資源割当システムの設計2004

    • 著者名/発表者名
      伊野 文彦
    • 雑誌名

      第3回情報科学技術フォーラム講演論文集

      ページ: 115-116

  • [雑誌論文] 大規模データセットを可視化するための効率のよい並列ボリュームレンダリング2004

    • 著者名/発表者名
      松井 学
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 45・SIG11

      ページ: 346-355

  • [雑誌論文] Parallel Volume Rendering with Early Ray Termination for Visualizing Large-Scale Datasets2004

    • 著者名/発表者名
      Manabu matsui
    • 雑誌名

      Proceedings of the 2nd International Symposium on Parallel and Distributed Processing and Applications

      ページ: 245-256

  • [雑誌論文] 大規模データセットを可視化するための効率のよい並列ボリュームレンダリング2004

    • 著者名/発表者名
      松井 学
    • 雑誌名

      第2回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      ページ: 93-101

  • [雑誌論文] Real-Time Estimation of Hip Range of Motion for Total Hip Replacement Surgery2004

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Kawasaki
    • 雑誌名

      Proceedings of the 7th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention

      ページ: 629-636

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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