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2009 年度 実績報告書

ゲノム機能解析とインフォマティクスを駆使した生命システムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 16063101
研究機関東京大学

研究代表者

高木 利久  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (30110836)

研究分担者 久原 哲  九州大学, 大学院・農学研究院, 教授 (00153320)
林 哲也  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (10173014)
加藤 和人  京都大学, 人文科学研究所, 准教授 (10202011)
キーワード生命システム / ゲノム機能解析 / 生命シミュレーション / バイオインフォマティクス / 遺伝子ネットワーク / 表現型解析 / ゲノムオントロジー / システム生物学
研究概要

本総括班は、「ゲノム機能解析とインフォマティクスを駆使した生命システムの解明」(略称:生命システム情報)を有機的かつ円滑に運営し、研究を効率良く進めるためのものである。また、この総括班は、「生命システム情報」だけでなく、「比較ゲノム」、「応用ゲノム」、「基盤ゲノム」を含む、ゲノム特定4領域全体の総括班としての機能も果たすように設計されているため、ゲノム特定4領域の有機的、効率的運営のための活動もあわせて展開したほか、国内の関連プロジェクトやセンターとの連絡調整も行った。
平成21年度に行った主な活動は以下の通りである。
・領域横断微生物研究会(平成21年7月21日~23日、宮崎)の開催
・ゲノム研究者と一般市民の交流イベント「ゲノムひろば」(平成21年8月1日~2日、東京)の開催
・ゲノム特定4領域の計画研究(69課題)、公募研究(81課題)、支援班(5課題)の班員による合同班会議
(平成21年8月31日~9月1日、神戸)の開催
・インフォマティクス研究者と医学研究者の交流会(平成21年11月20日~21日、柏)の開催
・高校生をおもな対象とした、研究者と市民との交流会「ミニゲノムひろば」(平成21年12月20日、福岡)の開催
・ゲノム特定4領域成果公開シンポジウム(平成22年2月11日~12日、東京)の開催
・ゲノム特定4領域ホームページの運用,ゲノム特定4領域の電子名簿の作成
・平成16年度~平成21年度研究成果報告書の作成
・ゲノム特定4領域で開発されたデータベースなどの成果公開用サーバの整備
・新型シーケンサー(454FLX)を利用した研究支援活動
・班員専用SNS(ソーシャルネットワーキングサービス)の運用

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Figure classification in biomedical literature to elucidate disease mechanisms, based on pathways2010

    • 著者名/発表者名
      Ishii, N.
    • 雑誌名

      Artificial Intelligence in Medicine ((印刷中)掲載確定)

    • 査読あり
  • [学会発表] Effective multi-scale graph navigation system powered by fast and biologically meaningful hierarchical clustering2009

    • 著者名/発表者名
      Praneenararat, T.
    • 学会等名
      The 20th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
    • 年月日
      20091214-20091216
  • [学会発表] Biomedical figure search using combination of bag of keypoints and bag of words2009

    • 著者名/発表者名
      Koike, A.
    • 学会等名
      The 20th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
    • 年月日
      2009-12-15
  • [学会発表] Classification of neuroimaging figures toward automatic figure annotation system2009

    • 著者名/発表者名
      Ishii, N.
    • 学会等名
      The 20th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
    • 年月日
      2009-12-14
  • [学会発表] 生命科学研究者のための統合文献情報管理システム2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎渉
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
    • 年月日
      2009-12-10
  • [備考] 特定領域ゲノム4領域ホームページ

    • URL

      http://www.genome-sci.jp/

  • [備考] ゲノムひろば

    • URL

      http://hiroba.genome-sci.jp/

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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