細胞核ダイナミクス

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 16084101
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 米田 悦啓 大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 教授 (80191667)
• 研究分担者: 平岡 泰 大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 教授 (10359078) ; 原口 徳子 独立行政法人情報通信研究機構, 未来ICT研究センター, 主任研究員 (20359079) ; 竹安 邦夫 京都大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (40135695) ; 木村 宏 大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 准教授 (30241392)
• 連携研究者: 平岡 泰 大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 教授 (10359078) ; 原口 徳子 独立行政法人情報通信研究機構, 未来ICT研究センター, 主任研究員 (20359079) ; 竹安 邦夫 京都大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (40135695) ; 木村 宏 大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 准教授 (30241392)
• 研究期間 (年度): 2004 – 2008
• キーワード: 細胞核 / 分子イメージング / ゲノム / 細胞核内構造体 / 可視化技術 / 核-細胞質間輸送 / 染色体 / クロマチン

研究概要

本研究領域は、真核細胞の遺伝情報を保持し、発現させる基本構造体である細胞核を研究対象とし、その機能を構造構築のダイナミクスに立脚して統合的に理解することを目的としている。このため、本総括班では、領域内での研究の有機的な融合のため、定期的に開催する班会議を最も重要視し、班会議での発表、討論に基づいて、内部評価を厳密に行なうとともに、活発な意見交換、情報交換を促すことにより、各研究者が相互に影響を及ぼし合い、学際的な相互交流が進展することを目指している。この目的に沿って、領域班会議を5回にわたって開催し、計画班・公募班を問わず、班員すべてが研究成果や計画を発表し、他の班員、総括班評価担当委員からの評価を受けた。また、総括班会議を8回にわたって開催し、主として本研究領域の活動をどのように総括し、次のステップにつなげていくかについて話し合ってきた。一方、本特定領域のキーワードの1つである「可視化」技術は、日進月歩で開発が進んでおり、それらの技術を用いたデータが蓄積してきているため、本研究領域独自のデータベース作成を行った。また、ホームページ、ニュースレターを通して情報発信に努めた。また、国際シンポジウムを3回、公開シンポジウムを2回主催し、国内外への情報発信と情報交換を行った。これら以外にも、技術講習会支援、ワークショップ等の後援など、積極的に本研究分野全体の発展に努めた。

研究成果

• [雑誌論文] A high-resolution structure of the pre-microRNA nuclear export machinery. (2009)
  • 著者名/発表者名: Okada, C., Yamashita, E., *Lee, S.J., Shibata, S., Katahira, J., Nakagawa, A., Yoneda, Y., Tsukihara, T.
  • 雑誌名: Science 326 ページ: 1275-1279
  • 査読あり
• [雑誌論文] Visualizing histone modifications in living cells: spatiotemporal dynamics of H3 phosphorylation during interphase. (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashi-Takanaka, Y., Yamagata, K., Nozaki, N.,, Kimura, H.
  • 雑誌名: J. Cell Biol. 187 ページ: 781-790
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nup98 nucleoporins bearing different types of repeat sequence characterize nucleus-specific nuclear pore complexes in the ciliate Tetrahymena. (2009)
  • 著者名/発表者名: Iwamoto, M., Mori, C., Kojidani, T., Bunai, F., Hori, T., Fukagawa, T., Hiraoka, Y., Haraguchi, T.
  • 雑誌名: Current Biol. 19 ページ: 843-847
  • 査読あり
• [雑誌論文] Individual binding pockets of importinβfor FG-nucleoporins are differently regulated by RanGTP. (2008)
  • 著者名/発表者名: Otsuka, S., Iwasaka, S., Yoneda, Y., Takeyasu, K., Yoshimura, S.H.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105 ページ: 16101-16106
  • 査読あり
• [雑誌論文] Live cell imaging and electron microscopy revealed dynamic processes of BAF-directing nuclear envelope assembly. (2008)
  • 著者名/発表者名: Haraguchi, T., Kojidani, T., Koujin, T., Shimi, T., Osakada, H., Mori, C., Yamamoto, A., Hiraoka, Y.
  • 雑誌名: J. Cell Sci. 121 ページ: 2540-2554
  • 査読あり
• [雑誌論文] Triggering neural differentiation of ES cells by subtype switching of importin-α. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yasuhara, N., Shibazaki, N., Tanaka, S., Nagai, M., Kamikawa, Y., Oe, S., Kamachi, Y., Kondoh, H., Yoneda, Y.
  • 雑誌名: Nature Cell Biol. 9 ページ: 72-79
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nuclear localization of barrier-to-autointegration factor is correlated with progression of S-phase in human cells. (2007)
  • 著者名/発表者名: Haraguchi, T., Koujin, T., Osakada, H., Kojidani, T., Mori, C., Masuda, H., Hiraoka, Y.
  • 雑誌名: J. Cell Sci. 120 ページ: 1967-1977
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel histone-exchange factor, protein phosphatase 2Cγ, mediates the exchange and dephosphorylation of H2A-H2B. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H., Takizawa, N., Allem,, N., Hori, T., Iborra, F.J., Nozaki, N., Muraki, M., Hagiwara, M., Krainer, A.R., Fukagawa, T., Okawa, K.
  • 雑誌名: J. Cell Biol. 175 ページ: 389-400
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meiotic proteins Bqt1 and Bqt2 tether telomeres to form the bouquet arrangement of chromosomes. (2006)
  • 著者名/発表者名: Chikashige, Y., Tsutsumi, C., Yamane, M., Okamasa, K., Haraguchi, T., Hiraoka, Y.
  • 雑誌名: Cell 125 ページ: 59-69
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-molecule reaction analysis reveals the ATP-ADP-dependent conformational changes of chaperonin GroEL. (2006)
  • 著者名/発表者名: M. Yokokawa, C. Wada, T., o, N. Sakai, A. Yagi, Takeyasu, K.
  • 雑誌名: EMBO J. 25 ページ: 4567-4576
  • 査読あり
• [雑誌論文] Importinαtransports Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase type IV (CaMKIV) to the nucleus without utilizing importinβ. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kotera, I., Sekimoto, T., Miyamoto, Y., Saiwaki, T., Nagoshi, E., Sakagami, H., Kondo, H., Yoneda, Y.
  • 雑誌名: EMBO J. 24 ページ: 942-951
  • 査読あり
• [雑誌論文] Linker histone H1 per se can induce three-dimensional folding of chromatin fiber. (2005)
  • 著者名/発表者名: Hizume, K., Yoshimura, S.H., Takeyasu, K.
  • 雑誌名: Biochemistry 44 ページ: 12978-12989
  • 査読あり
• [雑誌論文] The 70 kDa heat shock cognate protein (hsc70) facilitates the nuclear export of the import receptors. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kose, S., Furuta, M., Koike, M., Yoneda, Y., Imamoto, N.
  • 雑誌名: J. Cell Biol. 171 ページ: 19-25
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cellular stresses induce the nuclear accumulation of importin-alpha and cause a conventional nuclear import block. (2004)
  • 著者名/発表者名: Miyamoto, Y., Saiwaki, T., Yamashita, J., Yasuda, Y., Kotera, I., Shibata, S., Shigeta, M., Hiraoka, Y., Haraguchi, T., Yoneda, Y.
  • 雑誌名: J. Cell Biol. 165 ページ: 617-623
  • 査読あり
• [学会発表] Nano-biology of the nucleus. (Keynote Speech) The 10th AEARU Workshop on Molecular Biology and Biotechnology (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeyasu, K.
  • 学会等名: National Taiwan Univ.
  • 発表場所: Taiwan
  • 年月日: 20091111-20091114
• [学会発表] Nuclear protein transport and cell function. (Plenary talk) 7th Annual Scientific Meeting of ARC Centre of Excellence in Biotechnology and Development (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoneda, Y.
  • 学会等名: Kalorama, Victoria, Australia
  • 年月日: 20090907-20090908
• [学会発表] The modification and dynamics of histones in human cells as revealed by a panel of specific monoclonal antibodies. ICHC2008 (2008)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H.
  • 学会等名: 13th Congress of the International Federation of Societies for Histochemistry and Cytochemistry, Symposium "Imaging of nuclear structure and dynamics"
  • 発表場所: Gdansk, Poland
  • 年月日: 20080323-20080827
• [学会発表] Fission yeast genes involved in meiotic SPB-telomere cluster formation. (2007)
  • 著者名/発表者名: Chikashige, Y., Tsutsumi, C., Yamane, M., Okamasa, K., Haraguchi, T., Hiraoka, Y.
  • 学会等名: Fourth International Fission Yeast Meeting
  • 発表場所: Institute of Public Health, Copenhagen, Denmark
  • 年月日: 2007-06-13
• [学会発表] Nucleocytoplasmic transport and its significance to nuclear function. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yoneda, Y.
  • 学会等名: 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress:
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 20060618-20060623
• [学会発表] Chromatin structures and dynamics in fission yeast meiosis. (2005)
  • 著者名/発表者名: Hiraoka, Y.
  • 学会等名: Gordon Research Conference of Chromosome Dynamics
  • 発表場所: Colby-Sawyer College, USA
  • 年月日: 2005-07-31
• [図書] Modern Atomic Force Microscopy and Its Application to the Study of Genome Architecture (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeyasu, K., Maruyama, H., Suzuki, Y., Hizume, K., Yoshimura, S.H.(ed. B. Bhushan.)
  • 出版者: Springer-Verlag
• [図書] Structure and function of inner-nuclear architectures. Nuclear Dynamics (2006)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H., Cook, P.R.(ed. K. Takeyasu, K. Nagata)
  • 総ページ数: 177-196
  • 出版者: Springer-Verlag
• [図書] Nuclear Import and Export in Plants and Animals (2005)
  • 著者名/発表者名: Sekimoto, T., Katahira, J.,, Yoneda, Y.(eds. Tzfira Tzvi, Vitaly Citovsky)
  • 総ページ数: 50-60
  • 出版者: Landes Bioscience
• [備考]
  • URL: http://www.anat3.med.osaka-u.ac.jp/
• [産業財産権] Method of Measuring Biological Sample with high Accuracy (2008)
  • 発明者名: Takeshi Shimi, Tokuko Haraguchi
  • 権利者名: National Institute of Information Communications Technology
  • 産業財産権番号: 特許・第7, 336, 417号
  • 取得年月日: 2008-02-26
• [産業財産権] 超迅速にDNA塩基配列を決定する方法 (2006)
  • 発明者名: 小寺一平、永井健治、谷知巳、米田悦啓
  • 権利者名: 小寺一平、永井健治、谷知巳、米田悦啓
  • 産業財産権番号: 特許・特願2006-034211
  • 出願年月日: 2006-02-20
• [産業財産権] 生物試料を高精度に測定する方法 (2006)
  • 発明者名: 志見剛、原口徳子
  • 権利者名: 独立行政法人情報通信研究機構
  • 産業財産権番号: 特許・特許第3879001号
  • 取得年月日: 2006-11-17