核スペックルの機能と分子構築:mRNAのスプライシングと核外輸送における役割

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 16084206
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 谷 時雄 熊本大学, 大学院・自然科学研究科, 教授 (80197516)
• 研究期間 (年度): 2004 – 2008
• キーワード: 核スペックル / mRNA / 選択的スプライシング / 低分子化合物 / 蛍光イメージング / 放線菌

研究概要

核スペックルはmRNA前駆体のスプライシングやmRNA核外輸送など,遺伝子発現と密接な関連をもつ核内構造体である.本研究では,核スペックルの機能と形成機構を明らかにするため,mRNA核外輸送の新規可視化解析系構築,及び核スペックルの形成阻害化合物のスクリーニングと解析などを進め,新規核内構造体TIDRの発見,核スペックルの形成と機能に影響を与える10種類の低分子化合物の同定など多くの研究成果を得た.

研究成果

• [雑誌論文] Monitoring of mRNA export (2008)
  • 著者名/発表者名: Kazuaki Tokunaga and Tokio Tani
  • 雑誌名: Current Protocols in Cell Biology 22 ページ: 1-20
  • 査読あり
• [雑誌論文] S1-1 nuclear domains : characterization and dynamics as a function of transcriptional activity (2008)
  • 著者名/発表者名: Akira Inoue, Katsuji Tsugawa, Kazuaki Tokunaga, Kenichi P. Takahashi, Shigehiko Uni, Masatsugu Kimura, Koji Nishio, Naoki Yamamoto, Ken-ichi Honda, Takanori Watanabe, Hideo Yamane and Tokio Tani
  • 雑誌名: Biol. Cell 100 ページ: 523-535
  • 査読あり
• [雑誌論文] The dynamics of pre-mRNAs and poly (A)+ RNA at speckles in living cells revealed by iFRAP studies (2008)
  • 著者名/発表者名: Yo Ishihama, Hisashi Tadakuma, Tokio Tani and Takashi Funatsu
  • 雑誌名: Exp. Cell Res. 314 ページ: 748-762
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dss1 associating with the proteasome functions in selective nuclear mRNA export in yeast (2008)
  • 著者名/発表者名: Taro Mannen, Tomoko Andoh and Tokio Tani
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 365 ページ: 664-671
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of splicing and nuclear retention of pre-mRNA by spliceostatin A in fission yeast (2008)
  • 著者名/発表者名: Chor-Wai Yo, Daisuke Kaida, Shinichi Nsihimura, Akihisa Matsuyama, Yoko Yashiroda, Hiroshi Taoka, Ken Ishigami, Sidenori Watanabe, Hidenori Nakajima, Tokio Tani, Sueharu Horinouchi and Minoru Yoshida
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 364 ページ: 573-577
  • 査読あり
• [雑誌論文] Spliceostatin A targets SF3b and inhibits both splicing and nuclear retention of pre-mRNA (2007)
  • 著者名/発表者名: Daisuke Kaida, Hajime Motoyoshi, Etsu Tashiro, Takayuki Nojima, Masatoshi Hagiwara, Ken Ishigami, Hidenori Watanabe, Takeshi Kitahara, Tatsuhiko Yoshida, Hidenori Nakajima, Tokio Tani, Sueharu Horinouchi and Minoru Yoshida
  • 雑誌名: Nature Chem. Biol. 3 ページ: 576-583
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in the SF1-U2AF59-U2AF23 complex cause exon skipping in Schizosaccharomyces pombe (2007)
  • 著者名/発表者名: Noriko Haraguchi, Tomoko Andoh, David Frendewey and Tokio Tani
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 282 ページ: 2221-2228
  • 査読あり
• [雑誌論文] Participation of XPB/Ptr8p, a component of TFIIH, in nucleocytoplasmic transport of mRNA in fission yeast (2007)
  • 著者名/発表者名: Fumitaka Mizuki, Takeshi. Namiki, Hiroshi Sato, Hiromi Furukawa, Tadao Matsusaka, Yasumi Ohshima, Ryoko Ishibashi, Tomoko Andoh and Tokio Tani
  • 雑誌名: Genes to Cells 12 ページ: 35-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] 酵母研究におけるアイソトープの活用,「RIを使用した実験法」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 水城史貴,萬年太郎,谷時雄
  • 雑誌名: 細胞工学 26 ページ: 92-97
• [雑誌論文] Visual screening for localized RNAs in yeast revealed novel RNAs at the bud-tip (2006)
  • 著者名/発表者名: Tomoko Andoh, Yukiko Oshiro, Sachiko Hayashi, Hideki Takeo and Tokio Tani
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 351 ページ: 999-1004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Imaging of single mRNA molecules movement within a living cell nucleus (2006)
  • 著者名/発表者名: Hisashi Tadakuma, Yo Ishihama, Toshiharu Shibuya, Tokio Tani and Takashi Funatsu
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 344 ページ: 772-779
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleocytoplasmic transport of fluorescent mRNA in living mammalian cells : Nuclear mRNA export is coupled to ongoing gene transcription (2006)
  • 著者名/発表者名: Kazuaki Tokunaga, Toshiharu Shibuya, Yo Ishihama, Hisashi Tadakuma, Miyuki Ide, Minoru Yoshida, Takashi Funatsu, Yasumi Ohshima and Tokio Tani
  • 雑誌名: Genes to Cells 11 ページ: 305-317
  • 査読あり
• [雑誌論文] mRNA核外輸送の蛍光イメージングと核内構造 (2006)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄
  • 雑誌名: ファルマシア 51 ページ: 2197-2199
• [雑誌論文] RNA蛍光イメージングで拓く細胞核研究のフロンティア (2006)
  • 著者名/発表者名: 船津高志,谷時雄
  • 雑誌名: Pharma Vision News Vision News 7 ページ: 23-29
• [雑誌論文] Single molecule imaging of mRNA splicing (2005)
  • 著者名/発表者名: Yo Ishihama, Hisashi Tadakuma, Tokio Tani and Takashi Funatsu
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser. 49 ページ: 209-210
• [雑誌論文] Hsp16p is required for thermotolerance in nuclear mRNA export in fission yeast Schizosaccharomyces pombe (2005)
  • 著者名/発表者名: Jun-ichi Yoshida and Tokio Tani
  • 雑誌名: Cell Structure and Function 29 ページ: 125-138
  • 査読あり
• [雑誌論文] The fission yeast ptr1+ gene involved in nuclear mRNA export encodes a putative ubiquitin ligase (2004)
  • 著者名/発表者名: Tomoko Andoh, Abul Kalam Azad, Asako Shigematsu, Yasumi Ohshima and Tokio Tani
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 317 ページ: 1138-1143
  • 査読あり
• [雑誌論文] The nucleolus is involved in mRNA export from the nucleus in fission yeast (2004)
  • 著者名/発表者名: Takashi Ideue, Abul Kalam Azad, Jun-ichi Yoshida, Tadao Matsusaka, Mitsuhiro Yanagida, Yasumi Ohshima and Tokio Tani
  • 雑誌名: J. Cell Sci. 117 ページ: 2887-2895
  • 査読あり
• [雑誌論文] イーストトラフィック:mRNA細胞内輸送のしくみと制御 (2004)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄,安東知子
  • 雑誌名: 実験医学 22 ページ: 2447-2453
• [学会発表] 核スペックルの形成とRNAダイナミクス (2008)
  • 著者名/発表者名: 志柿花矢,豊田修吉,江藤俊志,松尾陽太,三原由揮,徳永和明,五十嵐雅之,谷時雄
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学学会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20081209-12
• [学会発表] スプライシング因子SF2の核スペックル局在化阻害化合物のスクリーニング (2008)
  • 著者名/発表者名: 江藤俊志,志柿花矢,三原由揮,徳永和明,五十嵐雅之,谷時雄
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学学会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20081209-12
• [学会発表] Screening for natural compounds that affect formation of nuclear speckle (2008)
  • 著者名/発表者名: Kaya Shigaki,Kazuaki Tokunaga,Takashi Eto,Yutaka Kido,Masayuki Igarashi and Tokio Tani
  • 学会等名: 第60回日本細胞生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 20080629-0701
• [学会発表] poly(A)?RNAの核スペックル局在化を阻害する天然化合物のスクリーニング (2008)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太,東祐子,志柿花矢,豊田修吉,徳永和明,五十嵐雅之,谷時雄
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学学会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] Poly(A)+RNAの細胞内動態に影響を与える化合物のスクリーニング (2008)
  • 著者名/発表者名: 豊田修吉,東祐子,徳永和明,松尾陽太,志柿花矢,五十嵐雅之,谷時雄
  • 学会等名: 第10回RNAミーティングs
  • 発表場所: 札幌市
  • 年月日: 2008-07-23
• [学会発表] 核スペックル形成阻害化合物のスクリーニング (2007)
  • 著者名/発表者名: 徳永和明,志柿花矢,城戸裕,五十嵐雅之,安東知子,谷時雄
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20071211-15
• [学会発表] The dynamics of pre-mRNAs at speckles in living cells revealed by iFRAP studies (2007)
  • 著者名/発表者名: Yo Ishihama,Hisashi Tadakuma,TokioTani,Takashi Funatsu
  • 学会等名: 第40回日本発生生物学会・第59回日本細胞生物学会合同大会(JSDB-JSCB 2007 合同大会)
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20070528-30
• [学会発表] NUCLEAR EXPORT OF mRNA IN FISSION YEAST (2006)
  • 著者名/発表者名: Fumitaka Mizuki,Ryoko Ishibashi,Kiriko Matsushita,Mayako Miyabe,Nobuyoshi Watanabe,Tomoko Andoh and Tokio Tani
  • 学会等名: Functional organization of the nucleus
  • 発表場所: 淡路夢舞台
  • 年月日: 20060109-11
• [学会発表] 核から細胞質へのmRNA輸送:分子機構の解明と疾患 (2006)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄
  • 学会等名: 17thフォーラム・イン・ドージン
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2006-11-17
• [学会発表] 核から細胞質へのmRNA輸送:転写と輸送のクロストーク (2006)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄
  • 学会等名: リエゾンラボ研究会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2006-04-19
• [学会発表] S1-1 nuclear bodyとその機能 (2005)
  • 著者名/発表者名: 井上晃,西尾康二,高橋研一,津川克治,山元直樹,八谷和孝,山根英雄,木村政継,徳永和明,谷時雄
  • 学会等名: 第28回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2005-12-07
• [学会発表] 遺伝子の転写とmRNA核外輸送の連携:転写不活性化によりmRNAは核内ドメインTIDR に蓄積する (2004)
  • 著者名/発表者名: 徳永和明,井手深雪,谷時雄
  • 学会等名: 第27回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20041208-11
• [学会発表] 転写不活化に伴う新規核内構造体TIDRへのmRNA蓄積:mRNAの核外輸送と転写反応のカップリング (2004)
  • 著者名/発表者名: 徳永和明,渋谷利治,井手深雪,安東知子,谷時雄
  • 学会等名: 第6回RNAミーティング
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 20040804-06
• [学会発表] 蛍光イメージングによるmRNA核外輸送機構の解析:mRNAの核から細胞質への輸送と転写のカップリング (2004)
  • 著者名/発表者名: 徳永和明,渋谷利治,井手深雪,谷時雄
  • 学会等名: 核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 倉敷
  • 年月日: 20040521-22
• [図書] スプライシングとmRNA核外輸送,「酵母のすべて」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 水城史貴,谷時雄
  • 総ページ数: 130-137
  • 出版者: シュプリンガーフェアラーク東京
• [図書] スプライシング,生物物理学ハンドブック (2007)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄
  • 総ページ数: 122-125
  • 出版者: 朝倉書店
• [図書] 酵母研究-in vivoパルス標識によるRNAの細胞内動態解析法-,細胞工学別冊「RIの逆襲」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 水城史貴,萬年太郎,谷時雄
  • 総ページ数: 121-126
  • 出版者: 秀潤社
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://aster.sci.kumamoto-u.ac.jp/~biohome/staff/tani/index.htm