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2006 年度 実績報告書

ミトコンドリアエネルギー変換を駆動する蛋白質複合体の機能の原子機構

研究課題

研究課題/領域番号 16087208
研究機関兵庫県立大学

研究代表者

吉川 信也  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 教授 (40068119)

研究分担者 村本 和優  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 助教授 (50305679)
伊藤 恭子  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 助手 (70206316)
キーワード酵素反応機構 / 膜蛋白質 / ミトコンドリア / エネルギー変換 / X線結晶構造解析 / チトクロム酸化酵素 / NADH-ユビキノン還元酵素
研究概要

ウシ心筋チトクロム酸化酵素の結晶化条件とX線回折実験条件を検討し、1.4Å分解能に到達した。溶媒領域を考慮すると、この分解能で水素原子レベルの構造解析が可能である。ウシ心筋チトクロム酸化酵素の固有の脂質13分子全ての構造が不飽和結合の位置と立体構造も含めて決定された。またDCCDの結合によるリン脂質の脂肪酸鎖の立体構造変化をX線結晶構造解析により明らかにし、脂肪酸鎖がO_2の酵素還元部位への供給を制御していることを明らかにした。さらにZn^<2+>およびCd^<2+>がO_2還元のためのH^+供給経路の人口にあるHis503に結合し、プロトンポンプを阻害することを証明した。これは、50Å以上の遠距離相互作用を示すものであるが、Zn/Cd結合部位とポロトンポンプ系との間にはX線構造の変化は全く認められない。ウシ心筋チトクロム酸化酵素のX線構造より予想されるH-経路のペプチド結合と水チャネルの部位特異的変異により、この経路がプロトンポンプ経路であることを実験的に証明した。これまで細菌酵素の部位特異的変異解析から、D経路がプロトンポンプ経路であるとも主張されてきたが、その主張の根拠について詳細に検討し、実験的には完全に証明されたとは言えないことを明らかにした。NADH-ユビキノン還元酵素およびF_1F_0ATP合成酵素の二次元結晶化に重要な進歩があった。前者は37℃の温度アユーリングにより二次元配列の規則性が大幅に改善され、オプティカルディフラクシンが確認できた。また分子節とSDSゲル電気泳動により、37℃処理がサブユユット組成に影響を与えることを示す結果は得られなかった。したがって、この結果は本酵素全体の結晶化が可能であることを実証するものである。F_1F_0ATP合成酵素もこれまではドメインの構造しか報告されていなかったが、サブユニットの全く欠損していない酵素表品の二次元結晶化に成功した。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] A histidine residue acting as a controlling site for dioxygen reduction and proton pumping by cytochrome c oxidase2007

    • 著者名/発表者名
      Muramoto, K., Hirata, K., Shinzawa-Itoh, K., Yoko-o, S., Yamashita,.E., Aoyama, H., Tsukihara, T., Yoshikawa, S.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA (In press)

  • [雑誌論文] Resonance Raman spectra of the FMN of the bovine heart NADH : ubiquinone oxidoreductase, the largest membrane protein in the mitochondrial respiratory system2007

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, H., Nakatsubo, R., Yamaguchi, S., Ogura, T., Shinzawa-Itoh, K., Yoshikawa, S.
    • 雑誌名

      J. Bioenergetics and Biomembranes (In press)

  • [雑誌論文] Structures and physiological roles of thirteen lipids of bovine heart cytochrome c oxidase2007

    • 著者名/発表者名
      Shinzawa-Itoh, K., Aoyama, H., Muramoto, K., Terada, H., Kurauchi, T., Tadehara, Y., Yamasaki, A., Sugimura, T., Kurono, S., Tsujimoto, K., Mizushima, T., Yamashita, E., Tsukihara, T., Yoshikawa, S.
    • 雑誌名

      EMBO J. 26

      ページ: 1713-1725

  • [雑誌論文] The Proton-Pumping Pathway of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase2007

    • 著者名/発表者名
      Shimokata, K., Katayama, Y., Murayama, H., Suematu, M., Tsukihara, T., Muramoto, K., Aoyama, H., Yoshikawa, S., Shimada, H.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      ページ: 4200-4205

  • [雑誌論文] Reaction mechanism of bovine heart cytochrome c oxidase2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa, S., Muramoto, K., Shinzawa-Itoh, K., Aoyama, H., Tsukihara, T., Ogura, T., Shimokata, K., Katayama, Y., Shimada, H
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta 1757

      ページ: 395-400

  • [雑誌論文] Proton pumping mechanism of bovine heart cytochrome c oxidase2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa, S., Muramoto, K., Shinzawa-Itoh, K., Aoyama, H., Tsukihara, T., Shimokata, K., Katayama, Y., Shimada, H.
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta 1757

      ページ: 1110-1116

  • [図書] Reducing dioxygen to water : cytochrome c oxidase : "Biological Inorganic Chemistry Structure and Reactivity"( edited by I. Bertini, H. B. Gray, E. I. Stiefel, J. S. Valentine)2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa, S.
    • 総ページ数
      14, 739
    • 出版者
      University Science Books, Sausalito, California

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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