環境との関係で冗長となった遺伝子の退化による生物の進化

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 16107001
• 研究種目: 基盤研究(S)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 総合研究大学院大学
• 研究代表者: 高畑 尚之 総合研究大学院大学, 学長 (30124217)
• 研究分担者: 颯田 葉子 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 教授 (20222010) ; 大田 竜也 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (30322100)
• 連携研究者: 郷 康広 総合研究大学院大学, 葉山高等研究センター, 上級研究員 (50377123) ; 澤井 裕美 総合研究大学院大学, 葉山高等研究センター, 上級研究員 (60377124) ; 金子 聡子 総合研究大学院大学, 葉山高等研究センター, 上級研究員 (30456339) ; 金 慧琳 総合研究大学院大学, 葉山高等研究センター, 上級研究員 (60507200) ; 井川 武 総合研究大学院大学, 葉山高等研究センター, 上級研究員 (00507197) ; 岩瀬 峰代 総合研究大学院大学, 葉山高等研究センター, センター研究員 (30155048)
• 研究期間 (年度): 2004 – 2008
• キーワード: 偽遺伝子 / 遺伝子発現 / 環境と生物 / ゲノム

研究概要

生物進化の道筋は、その生物を取り巻く生物的・物理的環境によって決められてきた。種の個別性とは既存の遺伝子の発現をその生息環境に適応させて整理した結果である。本研究では、このような作業仮説に基づき、数百万年の期間に獲得されたヒトの個別性に関する遺伝的変容を探った。また、同様の観点から、家禽化に伴うニワトリの遺伝的変容を研究し、作業仮説の一般性を検証した。

研究成果

• [雑誌論文] ological implication for loss of function at major histocompatibility complex loci (2008)
  • 著者名/発表者名: Sawai, H., Go, Y. and Satta, Y. Bi
  • 雑誌名: Immunogenetics 60 ページ: 295-302
  • 査読あり
• [雑誌論文] J. Gene flow between species of Lake Victoria haplochromine fishes (2007)
  • 著者名/発表者名: Samonte, I. E., Satta, Y. Sato, A., Tichy, H., Takahata, N.and Klein
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol 24 ページ: 2069-2080
  • 査読あり
• [雑誌論文] mtDNA sequenc es show Japanese native chickens have multiple origins (2007)
  • 著者名/発表者名: Oka, T., Ino, Y., Nomura, K.,Ka washima, S., Kuwatama, T., Han ada, H., Amano, T., Takada,M., Takahata, N., Hayashi, Y.and Ak ishinomiya, F
  • 雑誌名: Animal Genet 38 ページ: 287-293
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary history of sex-linked mammalian amelogenin genes (2007)
  • 著者名/発表者名: Iwase, M., Kaneko, S., Kim, H., Satta, Y. and Takahata, N
  • 雑誌名: Cells Tissues Organs 186 ページ: 49-59
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular clock : An anti-neo-Darwinian legacy (2007)
  • 著者名/発表者名: Takahata, N
  • 雑誌名: Genetics 176 ページ: 1-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] An Al u retrotrans-position-mediated deletio n of CHD7 in a patient with CH ARGE syndrome (2007)
  • 著者名/発表者名: Udaka, T., Okamoto, N., Aramaki, M., Torii, C., Kosaki, R., Hosokai, N., Hayakawa, T.,, Takahata, N., Ta kahashi, T. and Kosaki, K
  • 雑誌名: Am. J. Med. Genet. A 147 ページ: 721-726
  • 査読あり
• [雑誌論文] The origin and evolutio n of human ampliconic gene familie s and ampliconic structure (2007)
  • 著者名/発表者名: Bhowmick, B. K., Satta, Y. and Ta kahata, N
  • 雑誌名: Genome Res 17 ページ: 441-450
  • 査読あり
• [雑誌論文] Further evid ence for recombina- tion between m ouse hemoglobin-beta b1 and b2 ge nes based on the nucleotide sequenc es of intron, UTR, and intergenic spacer regions. (2006)
  • 著者名/発表者名: Sato, J. J., Tsuru, Y., Hirai, K., Ya maguchi, Y., Mekada, K., Takahata,N. and Moriwaki, K
  • 雑誌名: Genes, Genet. Syst 81 ページ: 201-209
  • 査読あり
• [雑誌論文] Origin and evolution of processed pseudoge nes that stabilize functional Makorin1 mRNAs in mice (2006)
  • 著者名/発表者名: Kaneko, S., Aki, I., Tsuda, K. Mekada, K., Moriwaki, K, Takahata N.,and Satta, Y
  • 雑誌名: primates and other mammals. Genetics 172 ページ: 2421-2429
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fixation of the human-specific CMP-N-acetylneuraminic acid hydroxylase pseudogene and implications of haplotype diversity for human evolution (2006)
  • 著者名/発表者名: Hayakawa, T., Aki, I., Varki, A.,Satta, Y., and Takahata, N
  • 雑誌名: Genetics 172 ページ: 1139-1146
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lineage-specific loss of function of bitter taste receptor genes in humans and non-human primates (2005)
  • 著者名/発表者名: Go, Y., Satta, Y., Takenaka, O.,and Takahata, N
  • 雑誌名: Genetics 170 ページ: 313-326
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ancestral population sizes and species divergence times in the primate lineage on the basis of intron and B AC end sequences (2004)
  • 著者名/発表者名: Satta, Y., Hickerson, M., Watanabe,H., O'hUigin, C., and Klein, J
  • 雑誌名: J. Mol. Evol 59 ページ: 478-487
  • 査読あり
• [雑誌論文] The distribution of the ancestral haplotype in finite stepping-stone models with population expansion (2004)
  • 著者名/発表者名: Satta, Y., and Takahata, N
  • 雑誌名: Mol. Ecol 13 ページ: 877-886
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary relationships of major histocompatibility complex class I genes in simian prima tes (2004)
  • 著者名/発表者名: Sawai, H., Kawamoto, Y., Takahata,N., and Satta, Y
  • 雑誌名: Genetics 166 ページ: 1897-1907
  • 査読あり
• [学会発表] Evolutionary origin of peptideglycan recognition proteins in the vertebrate innate immune system」22^nd European Immunogenetics and Histocompatibility Conference (2008)
  • 著者名/発表者名: Satta, Y
  • 学会等名: Satellite Symposium "MHC gene polymorphism and evolution"
  • 発表場所: Toulouse
  • 年月日: 20080402-05
• [学会発表] 遺伝子の退化によるヒトの進化-尿酸酸化酵素遺伝子を例として (2008)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: 第41回日本痛風・核酸代謝学会、ランチョンセミナー
  • 発表場所: 福井
  • 年月日: 20080214-15
• [学会発表] 極限環境におけるノトセニア亜目硬骨魚類の分子進化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大田竜也
  • 学会等名: 第77回岩手大学COEフォーラム
  • 発表場所: 岩手大学
  • 年月日: 2008-11-28
• [学会発表] 機能を失った遺伝子の進化-偽遺伝子の生物学的意味 (2008)
  • 著者名/発表者名: 颯田葉子
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会、第19回システムバイオロジー研究会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-06-27
• [学会発表] 環境とゲノム (2008)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: 生態学会シンポジウム『ゲノム進化学と生態学』
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2008-03-15
• [学会発表] 人類特異的な遺伝的変化と人類進化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 颯田葉子
  • 学会等名: 人間行動進化研究会
  • 発表場所: 葉山
  • 年月日: 2007-12-08
• [学会発表] 偽遺伝子と進化医学 (2007)
  • 著者名/発表者名: 颯田葉子
  • 学会等名: 国立遺伝学研究所シンポジウム『ヒトゲノム多様性に基づく進化医学の発展』
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2007-10-03
• [学会発表] The current status of the neutral theory of molecular evolution (2007)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: 遺伝学会ミニシンポジウム『分子進化の中立説 : これまでの40年とこれから』
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2007-09-19
• [学会発表] Motoo Kimura: An original thinker on evolution in Japan (2007)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: JSPSサマープログラム
  • 発表場所: 葉山
  • 年月日: 2007-07-18
• [学会発表] ヒト特異的な遺伝的変化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 颯田葉子
  • 学会等名: BRCセミナー
  • 発表場所: 筑波
  • 年月日: 2007-05-31
• [学会発表] スズキ類ノトセニア亜目魚類における多重遺伝子族の進化 (2006)
  • 著者名/発表者名: 大田竜也
  • 学会等名: 日本分子生物学会2006フォーラム、シンポジウム「生物進化の遺伝メカニズム-生物環境適応と重複遺伝子の分子進化」
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20061206-08
• [学会発表] 集団遺伝学理論および分子進化に関する研究 (2006)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: 第8回進化学会、木村賞受賞講演
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20060829-31
• [学会発表] Evolution of primate sex chromosomes and sex-linked genes (2006)
  • 著者名/発表者名: Takahata, N.
  • 学会等名: Masatoshi Nei Legacy Symposium, Genomes, Evolution & Bioinformatics 2006 (SMBE)
  • 発表場所: Arizona State University
  • 年月日: 20060524-28
• [学会発表] 人間の由来と病気 (2006)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: 日本文学研究専攻特別講義
  • 年月日: 2006-12-14
• [学会発表] 生物の進化と病気 (2006)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: 人間行動進化研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2006-12-02
• [学会発表] アミノ酸の合成酵素と味覚受容体遺伝子群の進化と退化 (2006)
  • 著者名/発表者名: 高畑尚之
  • 学会等名: ICAAS「アミノ酸の科学シリーズ講演会」第六回-進化の視点から栄養を考える-
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2006-04-13
• [学会発表] Reduced repertoires of olfactory receptor genes in marine mammals, Cetacea. Annual meeting for Society for Molecular Biology and Evolution (2005)
  • 著者名/発表者名: Go, Y., Satta, Y., Kuno, K., and Takahata, N.
  • 学会等名: Auckland Convention Center
  • 発表場所: New Zealand
  • 年月日: 20050619-24
• [学会発表] A large ancestral population size and the origin of domestic chickens (2005)
  • 著者名/発表者名: Sawai, H., Satta, Y., and Takahata, N
  • 学会等名: Annual meeting for Society for Molecular Biology and Evolution, Auckland Convention Center
  • 発表場所: New Zealand
  • 年月日: 20050619-24
• [学会発表] Origin and evolution of processed pseudogenes that stabilize functional Makorin1 mRNAs in mice, primates and other mammals. Annual meeting for Society for Molecular Biology and Evolution (2005)
  • 著者名/発表者名: Kaneko, S., Tsuda, K., Mekada, K., Moriwaki, K, Takahata N., and Satta, Y
  • 学会等名: Auckland Convention Center
  • 発表場所: New Zealand
  • 年月日: 20050619-24
• [図書] 環境を〈感じる〉岩波サイエンスライブラリー (2009)
  • 著者名/発表者名: 郷康広・颯田葉子
  • 総ページ数: 114
  • 出版者: 岩波書店
• [図書] 「遺伝子からみたヒトの進化」シリーズ進化学第2巻「ヒトの進化」第2章 (2006)
  • 著者名/発表者名: 颯田葉子・斎藤成也
  • 出版者: 岩波書店