DNAマイクロアレイを基盤とする神経疾患診療システムの構築

2004 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16209028
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 辻 省次 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (70150612)
• 研究分担者: 後藤 順 東京大学, 医学部・附属病院, 講師 (10211252) ; 高橋 祐二 東京大学, 医学部・附属病院, 助手 (00372392)
• キーワード: パーキンソン病 / 神経変性疾患 / DNA micro array / DNA chip / resequencing / 疾患関連遺伝子 / PCR / 分子遺伝学

研究概要

本研究の目的は,現在の分子遺伝学の最新の知見を診療に結びつける最善の方法を築きあげることにある.この課題を実現するために,次の3点を柱としている.1.遺伝性神経疾患の遺伝子診断をDNA microarrayを用いてハイスループットで行うシステムの構築,2.疾患関連遺伝子の体系的解析による孤発性神経疾患へのアプローチ,3.神経疾患の患者毎の臨床表現型の多様性の背景を探索する.この目的を効率よく達成する方法として,DNA microarrayを用いた疾患関連遺伝子のresequencingのシステムの構築を進めている.本年度の研究で,パーキンソン病,アルツハイマー病,筋萎縮性側索硬化症,副腎白質ジストロフィー,家族性痙性対麻痺などを対象としてresequencingを目的とした,DNAマイクロアレイを設計した.試作したDNA microarrayについて,副腎白質ジストロフィー遺伝子をモデルとして,予備的検討を加え,2647塩基中2645塩基について(99.2%)配列の決定が可能であり,十分実用性があることを検証した.ハイスループット化のためには,多数のゲノムDNAに対して,多種類のPCR primer,試薬の分注作業が必須であり,roboticsを導入し,PCR primerや試薬の分注を自動化するシステムの構築を進めている.できる限り同一のPCR条件を用いること,long range PCRを用いることなどを進めている.孤発性の神経疾患へのアプローチとしてはパーキンソン病をモデル系として,大規模resequencingを開始した.

研究成果

• [雑誌論文] Five year follow up of a patient with spinal and bulbar muscular atrophy treated with leuprorelin. (2004)
  • 著者名/発表者名: Shimohata T, Kimura T, Nishizawa M, Onodera O, Tsuji S.
  • 雑誌名: J Neurol Neurosurg Psychiatry 75 ページ: 1206-1207
• [雑誌論文] Aprataxin, the causative protein for early-onset ataxia with ocular motor apraxia and hypoalbuminemia, is a nuclear protein with a potential role as a nucleotide repair protein. (2004)
  • 著者名/発表者名: Sano, Y., Date, H, Igarashi, S, Onodera, O, Oyake, M, Takahashi, T, Hayashi, S, Morimatsu, M, Takahashi, H, Makifuchi, T, Fukuhara, N, Tsuji, S.
  • 雑誌名: Ann.Neurol. 55 ページ: 241-249
• [雑誌論文] Japanese SCA families with a distinct phenotype linked to a locus overlapping with SCA15 locus (2004)
  • 著者名/発表者名: Hara, K, Fukushima, T, Suzuki, T, Shimohata, T, Oyake, M, Ishiguro, H, Hirota, K, Miyashita, A, Kuwano, R, Kurisaki, H, Yomono, H, Goto, J, Kanazawa, I, Tsuji, S
  • 雑誌名: Neurol. 62 ページ: 648-651
• [雑誌論文] Greenstein, P.Huntington's Disease-like 2 (HDL2) in North America and Japan. (2004)
  • 著者名/発表者名: Margolis RL, Holmes, S E., Rosenblatt, A., Gourley, L., O'Hearn, E., Ross, C A., Seltzer, W K., Walker, RH., Ashizawa, T., Rasmussen, A., Hayden, M., Almqvist, E W., Harris, J., Fahn, S., MacDonald, M E., Mysore, J., Shimohata, T., Tsuji, S., Potter, N., Nakaso, K., Adachi, Y., Nakashima, K., Bird, T., Krause, A.
  • 雑誌名: Ann Neurol 56 ページ: 670-674
• [雑誌論文] Beta-synuclein gene alterations in dementia with Lewy bodies. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ohtake H, Limprasert, P., Fan, Y., Onodera, O., Kakita, A., Takahashi, H., Bonner, L T., Tsuang, D W., Murray, I V., Lee, V M., Trojanowski, JQ., Ishikawa, A., Idezuka, J., Murata, M., Toda, T., Bird, T D., Leverenz, J B., Tsuii, S.
  • 雑誌名: Neurology 63 ページ: 805-811
• [雑誌論文] Adult-onset leukoencephalopathy with vanishing white matter with a missense mutation in EIF 2B5. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ohtake H, Shimohata, T., Terajima, K., Kimura, T., Jo, R., Kaseda, R., Iizuka, O., Takano, M., Akaiwa, Y., Goto, H., Kobayashi, H., Sugai, T., Muratake, T., Hosoki, T., Shioiri T., Okamoto, K., Onodera, O., Tanaka, K., Someya, T., Nakada, T., Tsuji, S.
  • 雑誌名: Neurology 62 ページ: 1601-1603