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2004 年度 実績報告書

ハイナン/ルソンメダカ種間雑種をもちいた遺伝子地図作成による比較ゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 16310131
研究種目

基盤研究(B)

研究機関東京大学

研究代表者

成瀬 清  東京大学, 大学院・理学系研究科, 講師 (50208089)

研究分担者 酒泉 満  新潟大学, 理学部, 教授 (40175360)
キーワードメダカ / ルソンメダカ / ハブシメダカ / フォスミドライブラリー / シンテニー / 比較ゲノム / ジャワメダカ
研究概要

平成16年度はメダカ遺伝子地図のマーカー数を増やすことによってさらに、高密度化をおこなった。またルソンメダカ及びハブシ/ジャワ種間雑種からゲノムDNAの抽出をおこないフォスミドライブラリーを作成した。ルソンメダカフォスミドライブラリーでは48クローンに関してその両端配列を決定し、メダカゲノム配列との相同性検索をおこなっている。これによりメダカゲノム配列上にルソンメダカゲノム配列がどの程度配置できるかについての基礎的なデータを得ることが出来ると考えている。マッピングによる比較ゲノム解析としてルソンメダカ、ハイナンメダカ、メコンメダカ、ハブシメダカの性決定様式とメダカでの相同領域を決定することが出来た。ハイナンメダカではXX-XY型の性決定様式を持つとともにその性染色体はメダカと同じLG1であった。ルソンメダカではXX-XY型の性決定様式を持ちながらその性染色体はLG1ではなくメダカのLG12に相同であるこが明らかとなった。メコンメダカはXX-XY型の性決定様式であり、その性染色体はメダカLG2に相当することが分かってきた。一方ハブシメダカはZZ-ZW型の性決定様式示しさらに、雌性を決定する染色体がメダカのLG5に相当することが分かってきた。このようにメダカ属魚類は近縁種にもかかわらず、極めてダイナミックに性決定様式と性染色体を変化させるという姿が明らかとなってきた。今後は遺伝子マップレベルでの比較だけではなく、ゲノム配列レベルでの比較ゲノム解析も重要であると考えている。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2004

すべて 雑誌論文 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] A Medaka Gene Map : The Trace of Ancestral vertebrate Proto-Chromosomes Revealed y Comparative Gene Mapping2004

    • 著者名/発表者名
      Naruse K., et al.
    • 雑誌名

      Genome Research 14

      ページ: 820-828

  • [雑誌論文] Medaka genomics : a bridge between mutant phenotype and gene function2004

    • 著者名/発表者名
      Naruse K, et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 619-628

  • [雑誌論文] Large-scale isolation of ESTs from medaka embryo and its application to medaka developmental genetics2004

    • 著者名/発表者名
      Kimura T.et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 915-932

  • [雑誌論文] A first generation physical map of the medaka genome in BACs essential for positional cloning and clone-by-clone based genomic sequence2004

    • 著者名/発表者名
      Zadeh Khorasani M et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 903-914

  • [雑誌論文] A mutation in the gene for aminolevulinic acid dehydrase (ALAD) causes hypochromic anemia in the medaka, Oryzias latipes2004

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto D.et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 747-752

  • [雑誌論文] Repid chromosomal assignment of medaka mutant by bulkde segregation analysis2004

    • 著者名/発表者名
      Mertinez-Morales, J et. a.
    • 雑誌名

      Gene 329

      ページ: 159-165

  • [図書] Medaka genome mapping for functional genomics in "Fish Development and Genetics"(Gong Zhiyuan and Vladimir Korzh ed)2004

    • 著者名/発表者名
      Mitani H.et al.
    • 総ページ数
      637
    • 出版者
      World Scientific Co.Pte.Ltd Singapore

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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