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2004 年度 実績報告書

作物近縁野生種コアコレクションを利用した効率的共生系遺伝子資源保全方法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 16310160
研究種目

基盤研究(B)

研究機関独立行政法人農業生物資源研究所

研究代表者

友岡 憲彦  独立行政法人農業生物資源研究所, 遺伝資源研究グループ, 主任研究官 (40373253)

研究分担者 横山 正  東京農工大学, 農学部, 助教授 (70313286)
加賀 秋人  独立行政法人農業生物資源研究所, 遺伝資源研究グループ, 主任研究官 (30391551)
キーワード共生系遺伝子 / 作物近縁野生種 / コアコレクション / 多様性の保全 / Bradyrhizobium属根粒菌 / Vigna属野生種
研究概要

本課題の目的はアジア熱帯地域で多様な種分化を遂げているVigna属マメ科野生植物に着生している根粒菌の遺伝的多様性を明らかにし、Vigna属コアコレクションを用いて、効率的に新規共生関連遺伝子の多様性を収集保全する方法を開発することである。以下に本年度の研究実績概要を述べる。
1)タイに自生するVigna属野生植物に着生していたBradyrhizobium属根粒菌は、これまでに解析が進んでいた温帯のダイズ、タイのダイズに着生している根粒菌とは大きく異なる根粒形成遺伝子を持っており、その遺伝的多様性も非常に大きいことが分った。種分類の指標となるgyrB遺伝子領域の解析でも、これらの根粒菌がこれまでに知られていない新しい変異を持っていることが判明した。これらの菌は、根粒着生応答反応のシグナル物質であるNodファクターにも変異がみられ、Vigna属のマメ科作物であるアズキ、リョクトウ、ダイズ等に対して多様な根粒着生反応がみられた。
2)新規共生関連遺伝子多様性を収集するために、スリランカ、パプアニューギニア、石垣島において多様な環境条件下において自生しているVigna属野生計13種から根粒菌を収集保全した。
3)植物側の共生関連遺伝子の多様性を評価するため、ミヤコグサで報告されたNodファクター認識遺伝子NFR1とNFR5をVigna属で増幅するためのプライマー設計を試みた。ミヤコグサのNFR遺伝子およびその他の植物の相同性の高い遺伝子の遺伝配列から複数の縮合プライマーを設計し、アズキ(Vigna angularis)の根から抽出したRNAを用いてPCR増幅を行ったところ、NFR1に相当する1194bpの断片と、NFR5に相当する約1300bpの断片が得られた。その塩基配列を解析した結果、ミヤコグサのNFR1とNFR5に類似する遺伝配列がアズキの根でも発現していると考えられた。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2005 2004

すべて 雑誌論文 (8件)

  • [雑誌論文] Ecological survey of Vigna and Bradyrhizobium genentic diversity in Northern Laos and Southern China2005

    • 著者名/発表者名
      Tomooka N., et al.
    • 雑誌名

      Annual Report on Exploration and Introduction of Plant Genetic Resources 21(印刷中)

  • [雑誌論文] Ecological survey and conservation of Vigna and Bradyrhizobium genetic diversity in Ishigaki island, Southern Japan2005

    • 著者名/発表者名
      Tomooka N., et al.
    • 雑誌名

      Annual Report on Exploration and Introduction of Plant Genetic Resources 21(印刷中)

  • [雑誌論文] Ecological survey and conservation of Vigna and Bradyrhizobium genetic resources in Papua New Guinea2005

    • 著者名/発表者名
      Tomooka N., et al.
    • 雑誌名

      Annual Report on Exploration and Introduction of Plant Genetic Resources 21(印刷中)

  • [雑誌論文] Field survey of Vigna genetic resources in Laos2004

    • 著者名/発表者名
      Tomooka N. et al.
    • 雑誌名

      Annual Report on Exploration and Introduction of Plant Genetic Resources 20

      ページ: 77-92

  • [雑誌論文] パプアニューギニアにおけるマメ類遺伝資源の調査2004

    • 著者名/発表者名
      友岡憲彦 他
    • 雑誌名

      熱帯農業 48(2)

      ページ: 79-80

  • [雑誌論文] Large-Scale Analysis of Gene Expression Profiles during Early Stages of Root Nodule Formation in a Model Legume, Lotus japonicus.2004

    • 著者名/発表者名
      Kouchi H., T.Yokoyama 他
    • 雑誌名

      DNA Research 11

      ページ: 263-274

  • [雑誌論文] Expression Islands Clustered on the Symbiosis Island of the Mesorhizobium loti Genome.2004

    • 著者名/発表者名
      Uchiumi, T., T.Yokoyama 他
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 186

      ページ: 2439-2448

  • [雑誌論文] ダイズ根粒PBS物質が単生状態のBradyrhizobium japonicum USDA110株の増殖及び遺伝子発現に及ぼす影響2004

    • 著者名/発表者名
      市田紗智子, 横山正, 有馬泰紘
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学会講演要旨集 50

      ページ: 61

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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