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2007 年度 研究成果報告書概要

核酸医薬の革新的大量効率合成法

研究課題

研究課題/領域番号 16350085
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関東京大学

研究代表者

和田 猛  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 准教授 (90240548)

研究期間 (年度) 2004 – 2007
キーワードRNA合成 / 保護基 / 核酸医薬 / 固相合成 / siRNA / RNAi / 自動合成 / RNA類縁体
研究概要

本年度は,本研究課題でこれまで開発してきた核酸に新規合成手法をRNA類縁体合成に応用するため,RNA化学合の鍵となる,2'-水酸基保護基の開発を行った。2'-水酸基の保護基として、塩基性条件下脱保護が可能な1-(2-シアノエトキシ)エチル(CEE)基を用いるモノマーユニットの合成を検討し,4種類の核酸塩基を有するモノマーユニットの合成法を確立した。さらに,CEE基の脱保護条件について検討した結果,塩基としてTBAFを用いると、CEE基は迅速に脱保護されることを見いだした。合成したモノマーユニットを用い,2量体を合成し、その脱保護条件を検討した。2量体を用いたCEE基の脱保護にTBAFを用いることによって,目的とするRNA 2量体が得られるが,アデノシンとシチジンを含む2量体の場合,塩基部位に2-シアノエチル化が進行することを明らかにした。これは,CEE基脱保護反応の副生成物であるアクリロニトリルが塩基性条件下,Michael型の付加反応を引き起こしていることが原因であることが明らかとなり,この副反応を抑制するために,アクリロニトリルの捕捉剤を種々検討した結果,ニトロメタンを添加することによって,ほぼ完全に副反応を抑制することに成功した。最適化された条件を自動合成機をいた固相合成法に適用し,種々のオリゴヌクレオチドを合成した。CEE基で保護したモノマーユニットを用いる縮合反応収率は98-99%であり,長鎖RNAの合成に十分有効であることを示した。そこで,siRNA21量体の合成を行い,良好な収率で目的物を単離することに成功した。今後,本研究で開発した新しい保護基を種々のRNA類縁体合成に適することにより,効率的な核酸医薬の合成が可能になることが期待される。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (5件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Solid-phase synthesis of backbone-modefied DNA analogs by the boranophosphotriester method using new protecting groups for nucleobases2008

    • 著者名/発表者名
      Kawanaka, T., Shimizu, M., Shintani, N, Wada, T.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett. 13

      ページ: 783-3786

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of Dinucleoside Phosphates and their Analogs by the Boranophosphotriester Method Using Azido-Based Protecting Groups2007

    • 著者名/発表者名
      Kawanaka, T., Shintani, N., Shimizu, M, Wada, T.
    • 雑誌名

      Tetrahedron Lett. 48

      ページ: 1973-1976

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protein-based peptide-bond formation by aminoacyl-tRNA protein transferase2007

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, K., Toh, Y., Suto, K., Shimizu, Y., Oka, N., Wada. T., Tomita, K.
    • 雑誌名

      Nature 449

      ページ: 867-871

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chemical synthesis and properties of stereoregulated phosphorothioate RNAs2007

    • 著者名/発表者名
      Wada. T., Kondo, T., Fujiwara, S., Sato, T., Oka, N.
    • 雑誌名

      □Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      ページ: 119-120

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Nucleoside H-boranophosphonates : Synthesis and properties of a new class of nucleotide analogs2007

    • 著者名/発表者名
      Higashida, R., Kawanaka, T., Oka, N., Wada. T.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      ページ: 133-134

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Solid-phase synthesis and properties of chiral peptide nucleic acids bearing cationic side chains2007

    • 著者名/発表者名
      Harada, H., Funayama, S., Shoji, Y, Wada. T.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      ページ: 259-260

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] 立体が制御されたホスホロチオエートRNAの化学合成と性質2007

    • 著者名/発表者名
      和田猛, 近藤知明, 藤原聡, 佐藤輝聴, 岡夏央
    • 学会等名
      第5回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2007-11-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Chemical synthesis and properties of stereoregulated phosphorothioate RNAs (Invited Lecture)2007

    • 学会等名
      The 5th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • 発表場所
      The University of Tokyo, Japan
    • 年月日
      2007-11-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] Nucleoside H-boranophosphonates: synthesis and properties of a new class of nucleotide analogs2007

    • 学会等名
      The 5th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • 発表場所
      The University of Tokyo, Japan
    • 年月日
      2007-11-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] Solid-phase synthesis and properties of chiral peptide nucleic acids bearing cationic side chains2007

    • 学会等名
      The 5th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • 発表場所
      The University of Tokyo, Japan
    • 年月日
      2007-11-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] Stereocontrolled Synthesis of Phosphorothioate DNA and RNA by the Oxazaphospholidine Approach2007

    • 学会等名
      The 17th International Symposium on Phosphorous Chemistry
    • 発表場所
      Xiamen University, China
    • 年月日
      2007-04-16
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [図書] フルオラスケミストリー2007

    • 著者名/発表者名
      和田猛(共著)
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より

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公開日: 2010-06-09  

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