研究課題
基盤研究(B)
1.人畜共通病原微生物としてセパシア菌群(Burkholderia cepacia comples)を対象として、国内外の農業生態系(作物根圏、土壌等)、および臨床試料由来の菌株を収集し、長期凍結保存した。2.分離菌株について、16S rDNAを指標としたRFLPや塩基配列に基づき同定を行った。PCR法による遺伝子型(Genomovar)の判別を行った結果、農業環境由来の80%以上がI型に、残りはIII-B型に分布した。一方、臨床由来株は、I〜V型に分布したが、過半数はIII-A又はIII-B型であった。3.各種植物病原菌に対する抗生作用を検定した結果、環境由来菌株の多くが陽性であった。抗生物質ピロールニトリンの生合成遺伝子(PrnC)の分布は、環境由来菌株では85%以上で検出されたのに対し、臨床由来菌株では25%と低く、いずれの場合も陽性株のほとんどはGenomovar Iに属した。4.ヒト由来の伝染系統マーカー遺伝子(esmR)の存在について検索した結果、農業環境由来または臨床由来菌株のそれぞれ12%および46%に分布し、いずれも遺伝子型III-AおよびIII-Bに属した。また農業環境由来菌株の5%以上に、両方の遺伝子の存在が認められ、潜在的リスクが示唆された。5.セパシア菌群における血清学的性質および環境中からの検出・診断法の開発のために、8種類の遺伝型に対応するポリクローナル抗体が作製された。6.得られた微生物特性情報は順次データベース化され、農業環境技術研究所において、分散型データベースにより構築された「微生物インベントリーmicroForce」の中で、「Burkholderia cepacia」近縁菌データベース」としてWeb公開されユーザー利用が図られている(http://www.niaes.affrc.go.jp/inventry/microorg/index.html).
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