| 研究課題/領域番号 |
16390193
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
法医学
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
玉木 敬二 京都大学, 医学研究科, 教授 (90217175)
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| 研究分担者 |
鶴山 竜昭 京都大学, 医学研究科, 講師 (00303842)
飯野 守男 京都大学, 医学研究科, 助手 (80362466)
山本 敏充 名古屋大学, 医学研究科, 助教授 (50260592)
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| 研究期間 (年度) |
2004 – 2005
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| キーワード | ミニサテライト / DNA多型 / CEB1 / MS32 / human genetics |
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| 研究概要 |
法医実務では変性して断片化したDNA試料の場合が多く、比較的長さの大きいフラグメントのローカスでは検出できなくなってしまう。16年度は現在最も高変異なヒトミニサテライトであるCEB1について、初めて日本人における性状解析を行った。その結果、ミニサテライトは長さによるヘテロ接合度が85%に達し、アリル長は平均69リピートの一峰性分布を示した。また、CEB1にはアリル近傍に多数のSNPsが欧米人のアリルにおいて報告されているが、我々は、日本人において新しいSNPをアリル近傍下流に発見した。さらに、アリル3'末端側のリピート構造を分析したところ、各アリル内および各アリル間でリピート構造は全て異なっており、従来の報告以外の位置でも塩基置換、挿入/欠失がみられた。17年度は、MS32(D1S8)のアリル構造について、今まで分析されていないタイ人についておこなった。まず、ミニサテライトの5´末端付近の近傍配列の一塩基多型(SNP)のハプロタイピングをおこなった。その結果、タイ人は日本人に比べてアリル頻度はやや異なるが、いずれの部位も多型性を有していた。このSNPを利用してアリル特異的MVR-PCRを行い、アリルのマッピングをおこなった。マッピングされた106例のうち102個のアリルは全て異なっていた。このため、MS32はタイ人においても、極めて有用な個人識別マーカーとなりうることが示された。さらに、ドット・マトリクス法で、今までマッピングされた世界の民族アリルのデータと構造を比較したところ、有意な類似性を示してグループを作成するものが半数以上あった。タイ人アリルに最も似ているアリルに日本人アリルが選ばれる場合が、コーカシアンアリルに比べ2倍以上あり、また、アフリカンアリルに最も似ているという結果を示したアリルは見られなかった。このように、MS32はタイ人においても多型マーカーとして極めて有用なローカスであることが示された。今後は、B6.7など他のローカスや他の集団に分析を拡げて、高度なミニサテライト解析法を確立したいと考えている
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