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2005 年度 研究成果報告書概要

時計遺伝子サーカディアン・リズムの数理モデル構築と分岐解析

研究課題

研究課題/領域番号 16500132
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 感性情報学・ソフトコンピューティング
研究機関徳島大学

研究代表者

吉永 哲哉  徳島大学, 医学部, 教授 (40220694)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
キーワードサーカディアンリズム / 時計遺伝子 / 数理モデル / 非線形力学系理論 / 分岐理論 / ニューロンモデル
研究概要

生物時計によるサーカディアン(概日)リズムの発生機構が分子遺伝学的手法により近年活発に研究されている.哺乳類においては視交叉上核(SCN)に体内時計が存在することが明らかとなり,負帰還機構に基づく時計発振遺伝子の転写制御が発振の原理であることなどが明らかになりつつある.本研究期間において,非線形力学系の定性的分岐理論に基づいた解析により,生体リズムの本質的機構を解明することが目的である.
研究実績の概要は次の通りであり,申請時において設定した目標を達成させることができた.
1.時計遺伝子によるタンパク質の合成・分解のサイクルをモデル化した自律系常微分方程式系の解析を行った.。系に含まれるパラメータを変化させたとき,安定な平衡点と安定なリミットサイクルのそれぞれの存在領域には重なりが存在する.すなわち,遺伝子リズムを発現する分子に光刺激を単発的に注入したとき,発振状態が停止する可能性を示している.独自に開発した「定性的分岐理論を適用した分岐集合計算アルゴリズム」を利用して,この硬い発振がみられる現象を詳細に解析し,発生メカニズムを解明した.
2.時計遺伝子モデルに光刺激として周期的矩形波外力を印加し,サーカディアン・リズムの同期問題を検討した.従来までの解析では,光刺激のモデルとして正弦波や矩形波を仮定したシミュレーションが行われており,両者に違いはないと考えられてきた.解析により,矩形波を印加した系においては周期倍分岐が特徴的にみられ,カオス解が比較的容易に観察されることなどの性質が明らかとなった.外力の振幅が振動解の性質に与える影響について生理実験との対応を検討した.
3.明暗サイクルとして矩形波列と正弦波の2種類の周期的外力を注入した時計遺伝子モデル系を対象とし,解析により,明暗サイクルに引き込まれるパラメータ領域や,2つの系にみられる振動現象の性質の違いが明らかとなった.概日システムへ与える光の効果がアカパンカビとショウジョウバエに対して異なる可能性を示唆する新しい結果が得られた.すなわち,アカパンカビや哺乳類の概日システムにおいて,光は遺伝子の転写を促進する効果があるが,ショウジョウバエにおいてはタンパク質の分解を促進する効果をもつことが数理的に例証された.

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (16件)

  • [雑誌論文] Bifurcation structure of successive torus doubling2006

    • 著者名/発表者名
      Sekikawa Munehisa
    • 雑誌名

      Physics Letters A 348

      ページ: 187-194

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcations in a mathematical model for circadian oscillations of clock genes2006

    • 著者名/発表者名
      Kunichika Tsumoto
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology 239(1)

      ページ: 101-122

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcation structure of successive torus doubling2006

    • 著者名/発表者名
      MUNEHISA, Sekikawa
    • 雑誌名

      Physics Letters A vol.348

      ページ: 187-194

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcations in a mathematical model for circadian oscillations of clock genes2006

    • 著者名/発表者名
      TSUMOTO, Kunichika
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology vol.239, no.1

      ページ: 101-122

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Collapse of duck solution in a circuit driven by an extremely small periodic force2005

    • 著者名/発表者名
      Munehisa Sekikawa
    • 雑誌名

      Electronics and Communications in Japan, Part 3 88(4)

      ページ: 51-59

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcation of Synchronization Phenomena Observed in a Coupled Neuron Model for Circadian Clock Rhythms2005

    • 著者名/発表者名
      Kunichika Tsumoto
    • 雑誌名

      Systems and Computers in Japan 36(8)

      ページ: 1-14

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Taming Chaos現象のからくり2005

    • 著者名/発表者名
      関川宗久
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌 J88-A(6)

      ページ: 788-792

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcations in Morris-Lecar Neuron Model2005

    • 著者名/発表者名
      Kunichika Tsumoto
    • 雑誌名

      Neurocomputing 69(4-6)

      ページ: 293-316

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Collapse of duck solution in a circuit driven by an extremely small periodic force2005

    • 著者名/発表者名
      SEKIKAWA, Munehisa
    • 雑誌名

      Electronics and Communications in Japan, Part 3 vol.88, no.4

      ページ: 51-59

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcation of Synchronization Phenomena Observed in a Coupled Neuron Model for Circadian Clock Rhythms2005

    • 著者名/発表者名
      TSUMOTO, Kunichika
    • 雑誌名

      Systems and Computers in Japan vol.36, no.8

      ページ: 1-14

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] On the Trick of Taming Chaos Phenomenon2005

    • 著者名/発表者名
      MUNEHISA, Sekikawa
    • 雑誌名

      The Transactions of the Institute of Electronics, Information and Communication Engineers A vol.J88-A, no.6

      ページ: 788-792

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcations in Morris-Lecar Neuron Model2005

    • 著者名/発表者名
      TSUMOTO, Kunichika
    • 雑誌名

      Neurocomputing vol.69, no.4-6

      ページ: 293-316

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] 時計遺伝子リズムのニューロンモデルにみられる同調現象の分岐2004

    • 著者名/発表者名
      津元国親
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌 87-D-II(7)

      ページ: 1516-1528

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] A method to accelerate the convergence of the PMART for computed tomography2004

    • 著者名/発表者名
      Tetsuya Yoshinaga
    • 雑誌名

      WSEAS Transactions on Systems 10(3)

      ページ: 2981-2984

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Bifurcation of Synchronized Phenomena Observed in a Coupled Neuron Model for Circadian Clock Rhythms2004

    • 著者名/発表者名
      TSUMOTO, Kunichika
    • 雑誌名

      The Transactions of the Institute of Electronics, Information and Communication Engineers A vol.J87-D-II, no.7

      ページ: 1516-1528

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] A method to accelerate the convergence of the PMART for computed tomography2004

    • 著者名/発表者名
      YOSHINAGA, Tetsuya
    • 雑誌名

      WSEAS Transactions on Systems vol.10, no.3

      ページ: 2981-2984

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 2007-12-13  

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