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2005 年度 研究成果報告書概要

急速に分化した植物群における系統解析-複数の核遺伝子を用いて

研究課題

研究課題/領域番号 16570072
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関東北大学

研究代表者

牧 雅之  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助教授 (60263985)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
キーワード系統解析 / 核DNA / ギボウシ属 / ヤマハッカ属 / 交雑 / 葉緑体DNA / 種分化
研究概要

ユリ科のギボウシ属とシソ科のヤマハッカ属について,核遺伝子を用いた解析を行った.ギボウシ属については,藤田(1976)によって記載されている分類群のうち,明らかに自然交雑起源であるものを除き,1分類群につき1個体からDNAを抽出,アルコール脱水素酵素2遺伝子座(Adh-1,Adh-2)およびグリセリンアルデヒド-3-リン酸脱水素酵素(Gap)をPCRによって増幅し,クローニングを行った.各個体から複数のクローンを選んで,合計約2260塩基対の配列を決定した.葉緑体DNAについての予備的なデータと比較して,明らかに変異が多数見られ,ギボウシ属のように急速に分化したと考えられるグループの系統推定に,核遺伝子が有効であることが示された.同一個体からのクローンは,大部分は単系統性を示すが,一部の分類群からのクローンでは異なるクラスタに属する場合があった.これは,交雑に由来する可能性とlineage sortingの可能性の両方があり得る.また,同様に急速に分化したと推定されるヤマハッカ属について,葉緑体DNA,核18S-26S ITS領域,5S ITS領域の塩基配列を決定した.葉緑体DNAによる系統解析では,同一の分類群が異なるクラスタに属する場合が頻繁に見られた.これは,上記のギボウシ属の場合と同様の状況である.2つのITS領域の変異から,ヤマハッカ属では,交雑が頻繁に起きていることが示唆された.

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] A comparative study on reproductive characters and genetic diversities of an autogamous Tylophora matsumurae and its progenitor Tylophora tanakae (Apocynaceae-Asclepiadoideae).2006

    • 著者名/発表者名
      Yamashiro, T.
    • 雑誌名

      Plant Systematics and Evolution 256

      ページ: 55-67

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] A comparative study on reproductive characters and genetic diversities of an autogamous Tylophora matsumurae and its progenitor Tylophora tanakae (Apocynaceae-Asclepiadoideae).2006

    • 著者名/発表者名
      Yamashiro, T., Maki, M.
    • 雑誌名

      Plant Systematics and Evolution 256

      ページ: 55-67

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny and evolution of alcohol dehydrogenase (Adh) genes in legumes.2005

    • 著者名/発表者名
      Fukuda, T.
    • 雑誌名

      BMC Plant Biology 5

      ページ: 6

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Characterization of the TrcMADS1 gene of Trillium camtshcatcence (Trilliaceae) reveals functional evolution of the SOC/TM-3 line gene.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, T.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research 118

      ページ: 229-235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny and evolution of alcohol dehydrogenase (Adh) genes in legumes.2005

    • 著者名/発表者名
      Fukuda, T. et al.
    • 雑誌名

      BMC Plant Biology 5

      ページ: 6

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Characterization of the TrcMADS1 gene of Trillium camtshcatcence (Trilliaceae) reveals functional evolution of the SOC/TM-3 line gene.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, T. et al.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research 118

      ページ: 229-235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 2007-12-13  

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