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2005 年度 実績報告書

NMRによるタンパク質分子複合体の迅速な立体構造決定方法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 16570090
研究機関北海道大学

研究代表者

小椋 賢治  北海道大学, 大学院・薬学研究科, 助手 (50270682)

キーワードNMR / タンパク質 / 立体構造
研究概要

本研究課題において,研究代表者は,タンパク質-タンパク質あるいはタンパク質-低分子化合物複合体の立体構造を迅速に決定できるよう,新しい安定同位体標識法を提案することを目的とした.
好中球NADPHオキシダーゼの構成成分,p67phoxのTetratricopeptide repeat (TPR)ドメインは,GTP結合状態のRacと結合することにより,NADPHオキシダーゼを活性化する役割を担っている.研究代表者らは,p67phoxのTPRドメイン(203残基)の主鎖連鎖帰属およびメチル基特異的帰属をおこなった.Val,LeuおよびIleのメチル基のみプロトン化された2H/13C/15NラベルTPRドメインを作成し,NMRスペクトル解析をおこない,連鎖帰属を完了した.さらに,プロトン化されたVal,LeuおよびIleのメチル基についても帰属することができた.さらに,このTPRドメインのグローバルフォールドを迅速に決定することができた(投稿準備中).この手法はタンパク質単体の立体構造決定だけでなく,タンパク質分子複合体においても応用可能である.
Grb2タンパク質のSH2ドメインは乳癌との関連が指摘されている,細胞内シグナル伝達において重要なタンパク質である.近年,米国保健研究所Burke博士より開発された低分子化合物がGrb2 SH2ドメインに対して強い親和性を持つことが示され,薬剤候補化合物として注目が集まっている.研究代表者は,Grb2 SH2ドメイン-この薬剤候補化合物の複合体の立体構造をNMR法を用いて決定した.構造解析過程にて,Grb2 SH2ドメインを重水素標識することにより,タンパク質に結合した低分子化合物のNMR信号を高感度で検出することができ,このタンパク質分子複合体の立体構造を従来よりも短時間かつ高精度で決定することができた(投稿準備中).

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (3件)

  • [雑誌論文] NMR solution structure of the tandem Src homology 3 domains of p47phox complexed with a p22phox-derived proline-rich peptide2006

    • 著者名/発表者名
      Ogura, K.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 281

      ページ: 3660

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] 好中球活性酸素発生系を制御する蛋白質p47phoxの新規分子認識機構2005

    • 著者名/発表者名
      小椋賢治
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50

      ページ: 1233

  • [雑誌論文] 1H, 13C and 15N resonance assignments of the backbone and methyl groups of the 24 kDa tetratricopeptide repeat domain in p67(phox)2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR 32

      ページ: 176

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公開日: 2007-04-02   更新日: 2016-04-21  

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