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22週齢の雄性ラットSHR/NDmcr-cp/cpおよびWKY/Izmの膵臓を摘出し、破砕後超遠心分離にかけ、得られた可溶性画分の二次元電気泳動(2-DE)を行った。次に2-DEゲル上でSHR/NDmcr-cp/cpとWKY/Izm間で変動のあったタンパク質スポットを切り出し、脱染色、トリプシン処理、ペプチド抽出およびZipTipによるペプチド濃縮後、MALDI-TOF Msにより質量スペクトルを得た。主要質量ピークのリストを作成し、Mascot(Swiss-Prot)を用いてデータベース検索を行い、生活習慣病関連タンパク質の検索および解析を行った。
2-DEで検出された335個のスポットのうち、32個がデータベース中のタンパク質と有意な一致(p<0.05)を示した。このうちSHR/NDmcr-cp/cpで発現の亢進が見られたタンパク質は、alpha-enolase、phosphoglycerate kinase、phosphofructokinase、farnesyl pyrophosphate synthetase、insulin-like growth factor、carboxypeptidase A1 precursor、L-lactose dehydrogenase C chain、hemoglobin beta chain、phosphatidylinositol phosphate kinase、resistin-like alpha precursorなど15種であった。現在、これらタンパク質の病態との関連およびバイオマーカーとしての可能性を検討中である。
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