喘息の感受性遺伝子の多変量解析的アプローチ

2005 年度 研究成果報告書概要

• 研究課題/領域番号: 16590260
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 人類遺伝学
• 研究機関: 千葉大学
• 研究代表者: 鈴木 洋一 千葉大学, 大学院・医学研究院, 助教授 (80216457)
• 研究分担者: 呉 繁夫 東北大学, 大学院・医学研究科, 助教授 (10205221) ; 松原 洋一 東北大学, 大学院・医学研究科, 教授 (00209602)
• 研究期間 (年度): 2004 – 2005
• キーワード: 喘息 / 遺伝子多型 / 多変量解析 / ハプロタイプ / インターロイキン / 補体 / ロイコトリエン受容体

研究概要

本研究は、複数の疾患感受性遺伝子の遺伝子多型から、喘息発症のリスクをどの程度まで推定できるのかを明らかにすることを目的として行った。喘息感受性候補遺伝子として80遺伝子、320以上の一塩基多型をスクリーニングし、複数の遺伝子多型が成人喘息ないし小児喘息と相関を示すことを見出した。それら複数の感受性遺伝子からのロジェスティック回帰による疾患発症予測がどの程度可能か、Area Under ROC curve(AUC)を中心に用い評価した。昨年度には、小児喘息のリスクの解析を中心に行ったが、本年度は、成人喘息発症における評価を行った。成人喘息の患者484例と成人コントロール629例とのχ2乗検定でP値0.05以下を示したものは、MD1、MYD88、SERPNA1、STAT4、TLR2、TLR5、CYSLT2、C3、C5ARであった。これらの遺伝子をロジェスティック回帰式の独立変数としてみた場合、各遺伝子の有意確率は0.003、0.001、0.593、0.630、<0.001、0.001、<0.001、<0.001、0.251であった。このモデルでのNagelkerke's R2乗は0.231、AUCは0.721であった。遺伝子間相互作用のスクリーニングの結果、最も効果の大きいと考えられた、SERPNA1とCYSLT2の相互作用を含めたモデルも検討したが、Nagelkerke's R2乗=0.236、AUC=0.724と相互作用無しのモデルと差が無かった。小児喘息の発症予測では、遺伝子相互作用を加えた場合R2乗0.549、AUC 0.887であったので、成人喘息の発症予測の成績は、小児喘息に比して悪かった。この結果は、小児喘息に比べて成人喘息のほうが、環境要因が大きいことを示唆している可能性、または、小児喘息と成人喘息の感受性遺伝子が異なっており、これまで検討した遺伝子が小児喘息への影響の大きいものに偏っている可能性を示唆している。

研究成果

• [雑誌論文] An association study of asthma and related phenotypes with polymorphisms in negative regulator molecules of the TLR signaling pathway (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakashima K et al.
  • 雑誌名: J Hum Genet (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Association of the RIP2 gene with childhood atopic asthma (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakashima K et al.
  • 雑誌名: Allergology International (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Association between ADAM33 polymorphisms and adult asthma in the Japanese population (2006)
  • 著者名/発表者名: Tamari M et al.
  • 雑誌名: Clin Exp Allergy (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] An association study of asthma and related phenotypes with polymorphisms in negative regulator molecules of the TLR signaling pathway (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakashima, K., Hirota, T., Obara, K., Shimizu, M., Jodo, A., Kameda, M., Doi, S., Fujita, K., Shirakawa, T., Enomoto, T., Kishi, F., Yoshihara, S., Matsumoto, K., Saito, H., Suzuki, Y., Nakamura, Y., Tamari, M.
  • 雑誌名: J Hum Genet (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Association of the RIP2 gene with childhood atopic asthma (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakashima, K., Hirota, T., Suzuki, Y., Matsuda, A., Akahoshi, M., Shimizu, M., Hasegawa, K., Jodo, A., Doi, S., Fujita, K., Ebisawa, M., Yoshihara, S., Enomoto, T., Shirakawa, T., Obara, K., Kishi, F., Nakamura, Y., Tamari, M.
  • 雑誌名: Allergology International (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Association between ADAM33 polymorphisms and adult asthma in the Japanese population (2006)
  • 著者名/発表者名: Tamari, M., Hirota, T., Hasegawa, K., Obara, K., Matsuda, A., Akahoshi, M., Nakashima, K., Doi, S., Fujita, K., Suzuki, Y., Nakamura, Y., Shirakawa, T.
  • 雑誌名: Clin Exp Allergy (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Functional haplotypes of IL-12B are associated with childhood atopic asthma (2005)
  • 著者名/発表者名: Hitora T et al.
  • 雑誌名: J allergy Clin Immunol 116 ページ: 789-795
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Functional haplotypes of IL-12B are associated with childhood atopic asthma (2005)
  • 著者名/発表者名: Hirota, T., Suzuki, Y., Hasegawa, K., Obara, K., Matsuda, A., Akahoshi, M., Nakashima, K., Cheng, L., Takahashi, N., Shimizu, M., Doi, S., Fujita, K., Enomoto, T., Ebisawa, M., Yoshihara, S., Nakamura, Y., Kishi, R, Shirakawa, T., Tamari, M.
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol 116 ページ: 789-795
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より