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2005 年度 研究成果報告書概要

X染色体上に存在するSTRの対立遺伝子の出現頻度とde novo変異の解析

研究課題

研究課題/領域番号 16590551
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 法医学
研究機関大阪医科大学

研究代表者

田村 明敬  大阪医科大学, 医学部, 助手 (50207239)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
キーワードX-STR / DXS10011 / ハプロタイプ / 蛍光標識 / 同時検出 / 変異 / 遺伝子頻度
研究概要

X-STRのなかから17種(DXS101,DXS6789,DXS6800,DXS6803,DXS6807,DXS7132,DXS7133,DXS7423,DXS7424,DXS8377,DXS8378,DXS9895,DXS9898,DXS10011,HUMARA,HPRTB,GATA172D05)を選び、日本人集団における対立遺伝子の出現頻度と変異の調査を行った。17種のなかで最も高い多型性を示したSTRは、アリール17〜40までの36種が観察されたDXS10011で、Power of discriminationは0.933(男)と0.997(女)であった。親子鑑定肯定例についてX-STRのタイピングを行ったところDXS10011で2例に母子間で共有しないアリールが見られた。そこで、変異の詳細を明らかにするためDXS10011が存在するXq28近傍にあってDXS10011と連鎖しているとされるDXS7423、DXS8377とを併せたハプロタイプ解析を行った。DXS7423とDXS8377の2つのSTRは34種のハプロタイプに分類できた。これらのハプロタイプとDXS10011のアリールの解析から、2例のうちの1例で母親の2本のアリールのうちの一方のアリールの反復数が3回減少したと推定することができた。
現在、常染色体やY染色体上のSTRは蛍光標識をしたプライマーを用いて16種のSTRの同時検出が行われている。そこで、我々もX-STRのなかから同時検出が可能な6種のSTR(GATA172D05,DXS6789,DXS6807,DXS6803,DXS101,HPRTB)を選び、蛍光標識プライマーとしてTAMRAとJORで標識し、母-娘-父(肯定例)の同時検出を試みた。それぞれのバンドは両親と娘で一致していた。この結果、蛍光標識プライマーを用いたしたX-STRの同時検出システムの確立が可能であった。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2006

すべて 雑誌論文 (4件)

  • [雑誌論文] 蛍光標識プライマーを用いたX-STRの同時検出2006

    • 著者名/発表者名
      田村明敬
    • 雑誌名

      DNA 多型 Vol.14(印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Genetic studies of seventeen X-STR in the Japanese population2006

    • 著者名/発表者名
      A.Tamura et al.
    • 雑誌名

      Progress in Forensic Genetics 11 11 (In press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Simultaneous analysis of X-STRs with fluorescence dye primers2006

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi TAMURA, Misa IWATA, Izumi TAKASE, Kento TSUBOI, Shinya FUKUNISHI, Takeshi TAKAGI, Tokiko MIYAZAKI, Hajime NISHIO, Koichi SUZUKI
    • 雑誌名

      DNA POLYMORPHISM Vol.14 (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Genetic studies of seventeen X-STR in the Japanese population2006

    • 著者名/発表者名
      A.Tamura, M.Iwata, I.Takase, S.Fukunishi, T.Takagi, K.Tsuboi, T.Miyazaki, H.Nishio, K.Suzuki
    • 雑誌名

      Progress in Forensic Genetics 11 (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 2007-12-13  

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