| 研究課題/領域番号 |
16F16085
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| 研究機関 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構 |
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研究代表者 |
横川 太一 国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋生命理工学研究開発センター, 研究員 (00402751)
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| 研究分担者 |
DE CORTE DANIELE 国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋生命理工学研究開発センター, 外国人特別研究員
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| 研究期間 (年度) |
2016-07-27 – 2019-03-31
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| キーワード | 水圏ウイルス / ファージ / 微生物海洋学 |
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| 研究実績の概要 |
海洋生態系に遍在するウイルスは他の生物を圧倒する数で存在し(海水1mL中に一万から百万粒子;ホストである細菌の10から100倍 の密度)，生態系における細菌生物量の主要な変動要因として存在していることがわかってきた．また，ウイルスはホストとなる細菌生物量を決定するだけでなく，「ホストへの感染から致死・溶菌に至るまでのプロセス」で，海洋生態系の「微生物を介した物質循環経路」および「他の微生物群集動態の決定」に強く関わっていることも明らかになってきている．しかし，現時点での知見では，海洋におけるウイルスの生態を示す統合的な理解には至っていない．この問題の解決には，海水中における,ウイルスの有機物粒子としての挙動の理解と，ウイルスと宿主との相互作用の機構を理解することが必要不可欠である．本研究は，ウイルス生態の体系的な理解を構築する解析の一つとして，次の2課題に焦点をあて，その機構を明らかにすることを目的としている．1)ウイルスと非生物有機物質粒子間での物理化学的な吸着・脱着プロセスの解析，2)そのプロセスに付随して起きるウイルス-細菌間の相互作用の解析. 平成29年度は「ウイルスー細菌間の相互作用」のための，環境試料採取法および微小生態系実験の構築・試行・確立を行った．とくに，ウイルス生産量を放射性同位体で修飾したヌクレオシドを用いて見積もる手法を確立した．この方法を用いた定点観測による時系列観測も実施いている（2017年4月から2018年6月まで実施予定）．また，ウイルス系統組成の動態解析のための分子微生物学的手法を確立し，国際学会（SAME15 - 15th Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Croatia）において発表を行った．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本研究課題では，平成29年度課題としていた「ウイルスー細菌間の相互作用」の解析を予定どおり実施した．この課題で得られた結果を現在解析中である．また，昨年度までの研究成果を"Viral population in the global deep ocean circulation assessed by targeted viromics"というタイトルで国際学会（SAME15 - 15th Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Croatia）において発表した
予定した実験項目に関して着実に結果がでてきていること，昨年度の結果を国際学会において発表できたことから,「おおむね順調に進展している」を選択した.
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| 今後の研究の推進方策 |
平成30年度は実施している課題「ウイルスー細菌間の相互作用」の解析に関して，微小生態系を用いたモデル検証実験を行う．また，これまでの解析結果を統合し学会発表，論文発表を行う．
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