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2016 年度 実績報告書

メダカ科魚類における複合適応形質としての腹鰭保育の平行進化

研究課題

研究課題/領域番号 16F16392
研究機関琉球大学

研究代表者

山平 寿智  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (20322589)

研究分担者 MONTENEGRO GONZALEZ JAVIER  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2016-11-07 – 2019-03-31
キーワード進化 / 生態
研究実績の概要

メダカ科魚類のいくつかの種に見られる‘腹鰭保育’は,腹鰭の伸長や卵巣卵の同期発達などの形質が同時進化することで機能する複合適応形質であるが,その進化の遺伝基盤は不明である.本研究は,腹鰭保育を行うエバースメダカ(Oryzias eversi)と,その近縁種で非腹鰭保育種であるメダカ属未記載種(Oryzias sp.)を利用して,腹鰭保育の進化の遺伝基盤を解明することである.まず,野外採集によって得られた野生個体の産卵形質(腹鰭長,総排泄口のくぼみの大きさ,および産卵間隔)の比較を行う.次いで,雑種F2の表現型のタイピングも行い,腹鰭保育に関わる形質の量的遺伝学的解析を行うと共に,腹鰭保育を制御する遺伝子座のマッピングも行う.
本年度は,ティランガ湖およびドピン・ドピン川からそれぞれエバーシメダカとメダカ属未記載種を採集し,活かしたまま日本に持ち帰った.これらの個体を親魚として,雑種F2個体を作出している.交配の組み合わせは,腹鰭保育種♂×非腹鰭保育種♀の1ペアである.得られたF1個体同士をランダムに交配し,現在得られた一部のF2メス各個体の腹鰭長,総排泄口のくぼみの大きさ,および産卵間隔の計測・計数を行っている.現時点で50個体ほどのF2メスのデータが得られ,これらの個体からゲノムを抽出し,ddRAD-seqにかけてQTLマッピング用のSNPマーカーの検討を行っている最中である.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

F1メス個体の性比が大きくオスに偏ることから,F2個体の作出が難しい状況であるが,多数のF1個体をランダムに交配することでそれをカバーしている.計画に大きな遅れはない.

今後の研究の推進方策

引き続きF2個体の作出と各個体の表現型のタイピングを行う.追加で50個体くらいタイピングが終了した時点で(つまり合計100個体ほどのF2個体のタイピングが終了した時点で),再度ddRAD-seqを行う.このデータセットをもとに,SNPマーカーの連鎖解析と,腹鰭保育遺伝子座のマッピングに関する解析を行う.

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Sam Ratulangi University/Haluoleo University/LIPI(インドネシア)

    • 国名
      インドネシア
    • 外国機関名
      Sam Ratulangi University/Haluoleo University/LIPI
  • [雑誌論文] Phylogenomics reveals habitat-associated body shape divergence in Oryzias woworae species group (Teleostei: Adrianichthyidae)2018

    • 著者名/発表者名
      Mokodongan DF, Montenegro J, Mochida K, Fujimoto S, Ishikawa A, Kakioka R, Yong L, Mulis, Hadiaty RK, Mandagi IF, Masengi WA, Wachi N, Hashiguchi Y, Kitano J, Yamahira K
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution

      巻: 118 ページ: 194-203

    • DOI

      10.1016/j.ympev.2017.10.005

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Phylogeography of the eight-barbel loach Lefua nikkonis (Cypriniformes: Nemacheilidae): how important were straits in northern Japan as biogeographical barriers?2018

    • 著者名/発表者名
      Ooyagi A, Mokodongan DF, Montenegro J, Mandagi IF, Koizumi N, Machida Y, Inomata N, Shdedko SV, Hutama AA, Hadiaty RK, Yamahira K
    • 雑誌名

      Ichthyological Research

      巻: 65 ページ: 115-126

    • DOI

      10.1007/s10228-017-0597-0

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Male courtship activeness of Oryzias latipes in Okinawa Island2017

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto S, Yamahira K
    • 雑誌名

      The Biological Magazine Okinawa

      巻: 55 ページ: 1-17

    • 査読あり
  • [学会発表] メダカの緯度クラインの研究:生活史から種分化へ2018

    • 著者名/発表者名
      山平寿智
    • 学会等名
      第65回日本生態学会大会
  • [学会発表] Highly-structured freshwater fish populations within a single river system2018

    • 著者名/発表者名
      Mandagi IF, Lawelle SA, Masengi KWA, Mokodongan DF, Nagano AJ, Matsunami M, Kimura R, Yamahira K
    • 学会等名
      第65回日本生態学会大会
  • [学会発表] Just-completed sympatric speciation in an ancient lake2018

    • 著者名/発表者名
      Nobu S, Mokodongan DF, Nagano AJ, Matsunami M, Kimura R, Yamahira K
    • 学会等名
      第65回日本生態学会大会
  • [学会発表] Convergent evolution of body coloration in genus Oryzias and Nomorhamphus in Sulawesi-tenggara2017

    • 著者名/発表者名
      Montenegro J, Mochida K, Sugiuchi S, Matsui K, Fujimoto S, Mokodongan DF, Ishikawa A, Kitano J, Yong L, Mandagi IF, Masengi KWA, Hadiaty RK, Yamahira K
    • 学会等名
      Congress of the European Society for Evolutionary Biology
    • 国際学会
  • [学会発表] Population structures of adrianichthyids in the Malili Lakes System2017

    • 著者名/発表者名
      Yamahira K
    • 学会等名
      3rd Southeast Asian Gateway Evolution Meeting
    • 国際学会
  • [学会発表] Species and genetic diversity of medaka fishes (the family Adrianichthyidae) in Southeast Sulawesi2017

    • 著者名/発表者名
      Yamahira K, Mokodongan DF, Lawelle SA, Masengi KWA
    • 学会等名
      The 1st International Seminar on Sustainability in the Marine Fisheries Sector 2017
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] メダカ科魚類の鰭の形態と機能の多様性について(月刊アクアライフ2017-11)2017

    • 著者名/発表者名
      山平寿智
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      エムピージェー
  • [備考] 世界のメダカ研究室

    • URL

      http://ny-tbrc.jimdo.com/

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公開日: 2018-12-17  

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