がん細胞は生体内では周囲間質細胞からのシグナルを受け、また逆にがん細胞自身が生存に適した間質細胞を誘導している。本研究では申請者がこれまで開発したマウス・ヒト由来の配列の分離する技術をもとに、PDXを含む様々ながん種のXenograftについて、がん間質相互作用の全体像とその多様性をゲノムレベルでの解明を行った。またシングルセルトランスクリプトームから間質細胞種別の相互作用解析技の開発も行い、がん組織中の詳細ながん細胞や間質細胞間のホメオスタシスの解析を行った。その結果いくつかのがん種において新規のがん間質相互作用を担う重要な分子を見いだし実験的に検証することが出来た。
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